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Prof. Macks Wendhell Gonçalves, Msc Pontifícia Universidade Católica de Goiás Departamento de Biologia mackswendhell@gmail.com Ácidos nucleicos ÁCIDOS NUCLÉICOS A vida depende da capacidade das células de armazenar, replicar, transcrever, traduzir e transmitir as instruções genéticas. Desde essa descoberta, em 1940, o DNA recebe um lugar em destaque na Biologia Molecular. ÁCIDOS NUCLÉICOS - GENE As instruções genéticas são guardadas nos genes. Gene - Toda sequência de ácido nucléico que é necessária para a síntese de um polipeptídio funcional ou molécula de RNA ESTRUTURA DOS ÁCIDOS NUCLÉICOS Watson e Crick em 1953 revelaram a estrutura do DNA - Revelou como o DNA pode ser copiado (replicação). - Forneceu os primeiros indícios de como o DNA pode codificar as instruções para produzir as proteínas. Fotografia da difração do raio X obtida por Rosalind Franklin ESTRUTURA DO DNA As cadeias estão organizadas de forma antiparalela e unidas por meio de ligações de hidrogênio. 2 ligações: mais lábil 3 ligações: mais forte ESTRUTURA DOS ÁCIDOS NUCLÉICOS - Base nitrogenada – Anel heterocíclico de átomos de carbono e nitrogênio - Pentose – Açúcar com cinco carbonos - Grupo fosfato – Molécula com um átomo de fósforo cercado por 4 oxigênios. ESTRUTURA DOS ÁCIDOS NUCLÉICOS Pirimídicas - Timina - Citosina - Uracila Púricas - Adenina - Guanina Bases nitrogenadas ESTRUTURA DOS ÁCIDOS NUCLÉICOS Bases nitrogenadas Pares de bases complementares na dupla hélice de DNA ESTRUTURA DOS ÁCIDOS NUCLÉICOS Os nucleotídeos são ligados por meio de ligações fosfodiéster. Os nucleotídeos são covalentemente ligados pelo grupo 3’- hidroxila de um açúcar e o 5’-fosfato do próximo ESTRUTURA DE UM GENE DE PROCARIOTO ESTRUTURA DE UM GENE DE EUCARIOTO CÓDIGO GENÉTICO A correspondência do alfabeto de 4 letras de nucleotídeos do DNA e as 20 letras do alfabeto de aminoácidos das proteínas formam o Código genético. EXPRESSÃO GÊNICA A expressão gênica é a leitura do código genético de acordo com as necessidades metabólicas das células pela qual se dá a produção de proteínas. ESTRUTURA DO RNA O açúcar é uma ribose; É formado geralmente por uma fita simples que pode enrolar-se; Não existe a base pirimídica Timina, no seu lugar encontra-se a Uracila; Os pareamentos por complementariedade de bases seguem a ordem: RIBOSE E DESORRIBOSE Diferem uma da outra pela presença ou ausência do grupo hidroxila no carbono C 2’ da pentose DNA x RNA DOGMA CENTRAL DA BIOLOGIA MOLECULAR REPLICAÇÃO DO DNA A base para a replicação do DNA está na complementaridade das bases. QUÍMICA DA SÍNTESE DE DNA Adição de um desoxirribonucleosídeo na extremidade 3’OH em uma cadeia de polinucleotídica (fita iniciadora). REPLICAÇÃO DO DNA Forquilhas de replicação PROCESSO DE REPLICAÇÃO DO DNA Fita contínua Fita descontínua - Helicases - SSBs - Primase - DNA-polimerase - Topoisomerase - DNA-ligase TRANSCRIÇÃO Classes de RNA - RNA mensageiro (mRNA) - RNA transportador (tRNA) - RNA ribossômico (rRNA) - Pequenos RNA nucleares (snRNA) - Micro RNA (miRNA) - Pequenos RNA de interferência (siRNA) Existem duas classes gerais de RNA: as que codificam proteínas (mRNA) e as que são funcionais como RNA. Os RNA funcionais participam de uma variedade de processes celulares, incluindo a síntese de proteínas (tRNA, rRNA), RNA de processamento (snRNA), regulação da expressão genica (miRNA) e defesa do genoma (siRNA). Tipos de RNA pol. - RNA polimerase I - RNA polimerase II - RNA polimerase III TRANSCRIÇÃO DNA fita codificadora DNA fita molde RNA transcrito ELETROFORESE • Movimento de partículas dispersas num fluído sob influência de um campo elétrico uniforme • DNA, carga negativa - Tem tendência a se dirigir ao polo positivo quando sujeito a um campo elétrico • Serve para separar moléculas por tamanho/carga elétrica - Proteína deve ser desnaturada com detergente (SDS) - Técnica utilizada à exaustão em trabalhos de biologia molecular ELETROFORESE, ETAPAS 1.Preparação do gel 2.Aplicação das amostras 3.Eletroforese 4.Coloração 5. Análise dos resultados PREPARAÇÃO DO GEL Horizontal X Vertical Agarose X Poliacrilamida APLICAÇÃO DAS AMOSTRAS Definição do mapa das amostras por canaleta CORRIDA DO GEL • Aplicação do campo elétrico • Fonte elétrica gera fluxo de íons através da solução tampão • Terminais positivo e negativo • Tempo adequado, senão o DNA sai do gel COLORAÇÃO DAS MOLÉCULAS • Brometo de etídio • Agente intercalante do DNA (Carcinogênico) • Composto fluorescente à luz UV • Gel de agarose • Prata • Gel SDS-PAGE • Poliacrilamida • Gel Eletroforese • Melhor resolução PCR - Reação em Cadeia da Polimerase REAÇÃO EM CADEIA DA POLIMERASE - PCR A PCR é uma técnica pela qual moléculas de DNA ou cDNA são amplificadas milhares ou milhões de vezes in vitro. Thomas D. Brock foi o primeiro a isolar o T. aquaticus Thermus aquaticusYellowstone National Park PROCEDIMENTOS DA PCR Mg2+ DNA Polimerase (Taq-Polimerase) dNTPs DNA (sequência alvo) 2 Primers (Oligonucleotídeos iniciadores) Tampão Termociclador Eppendorf PROCEDIMENTOS DA PCR DNA molde: deve estar livre de impurezas uma vez que estas podem inibir a reação de PCR Solução tampão • Tris: mantém o pH da solução estável • Ions de K+, Na+ e NH4+ otimizam as condições da reação • Soro de albumina de bovino: atua como proteína estabilizadora • Íon Magnésio: - Baixa concentração: pouco ou nenhum produto - Elevada concentração: baixa especificidade. Primers • Baixa concentração: induz má polimerização • Elevada concentração: induz o aparecimento de produtos inespecíficos e formação de dímeros de primers PROCEDIMENTOS DA PCR APLICAÇÕES DA PCR Quantidade de DNA reduzida (Genética forense) Detecção de genes e sondas Montagem de bibliotecas genômicas Sequenciamento de DNA e/ou cDNA Número do slide 1 Número do slide 2 Número do slide 3 Número do slide 4 Número do slide 5 Número do slide 6 Número do slide 7 Número do slide 8 Número do slide 9 Número do slide 10 Número do slide 11 Número do slide 12 Número do slide 13 Número do slide 14 Número do slide 15 Número do slide 16 Número do slide 17 Número do slide 18 Número do slide 19 Número do slide 20 Número do slide 21 Número do slide 22 Número do slide 23 ELETROFORESE ELETROFORESE, ETAPAS PREPARAÇÃO DO GEL APLICAÇÃO DAS AMOSTRAS CORRIDA DO GEL COLORAÇÃO DAS MOLÉCULAS Número do slide 30 PCR -�Reação em Cadeia da Polimerase Número do slide 32 Número do slide 33 Número do slide 34 Número do slide 35 Número do slide 36