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1/3 Cientistas Revem a Arquitetura do Núcleo do Poxvirus, abrindo caminho para a terapêutica direcionada Estrutura da proteína do núcleo poxviral A10. As três subunidades do trimer (coloridas de forma diferente) são representadas como superfícies crio-EM simuladas na frente de uma micrografia criogênica crua. A superfície crio-EM é cada vez mais visível a cada subunidade. Um recente ressurgimento e surto de Mpox trouxe os poxvírus de volta como uma ameaça à saúde pública, sublinhando uma importante lacuna de conhecimento em seu núcleo. Agora, uma equipe de pesquisadores do Instituto de Ciência e Tecnologia da Áustria (ISTA) levantou os mistérios da arquitetura do núcleo do poxviral combinando várias técnicas de microscopia crio-elétron 2/3 com modelagem molecular. Os resultados, publicados na Nature Structural & Molecular Biology, podem facilitar pesquisas futuras sobre terapêuticas direcionadas ao núcleo do poxvírus. O vírus Variola, o mais notório poxvirus e um dos vírus mais mortais a ter afligido os seres humanos, causou estragos ao causar varíola até ser erradicado em 1980. A erradicação foi bem-sucedida graças a uma extensa campanha de vacinação usando outro poxvirus, o vírus Vaccinia apropriadamente chamado. O ressurgimento e o surto do vírus da Mpox 2022-20 nos lembraram mais uma vez que os vírus encontram maneiras de retornar à vanguarda como ameaças à saúde pública. É importante ressaltar que isso destacou as questões fundamentais sobre os poxvírus que permaneceram sem resposta até hoje. Uma questão fundamental está, literalmente, no cerne da matéria: “Sabemos que, para que os poxvírus sejam infecciosos, seu núcleo viral deve ser adequadamente formado. Mas do que é feito esse núcleo poxviral e como seus componentes individuais se unem e funcionam?”, pergunta o professor assistente da ISTA, Florian Schur, o autor correspondente do estudo. Schur e sua equipe agora colocam o dedo no elo perdido: uma proteína chamada A10. Curiosamente, o A10 é comum a todos os poxvírus clinicamente relevantes. Além disso, os pesquisadores descobriram que o A10 atua como um dos principais blocos de construção do núcleo do poxviral. Esse conhecimento pode ser fundamental para futuras pesquisas sobre terapêuticas direcionadas ao núcleo do poxviral. “As técnicas mais avançadas de crio-EM disponíveis hoje” O núcleo viral é um dos fatores comuns a todas as formas de poxvírus infecciosos. “Experimentos anteriores em virologia, bioquímica e genética sugeriram vários candidatos a proteínas do núcleo para os vírus da varíola, mas não havia estruturas derivadas experimentalmente disponíveis”, diz a estudante de doutorado da ISTA Julia Datler, uma das co-primeiras autoras do estudo. Assim, a equipe começou por prever computacionalmente modelos dos principais candidatos a proteínas, usando a agora famosa ferramenta de modelagem molecular baseada em IA AlphaFold. Paralelamente, Datler estava definindo as bases bioquímicas e estruturais do projeto, baseando-se em sua formação em virologia e a principal experiência do grupo Schur: microscopia eletrônica criogênica ou crio-EM para abreviar. “Integrámos muitas das técnicas de crio-EM mais avançadas disponíveis hoje com modelagem molecular AlphaFold. Isso nos deu, pela primeira vez, uma visão geral detalhada do núcleo poxviral – o “seguro” ou “biorreator” dentro do vírus que envolve o genoma viral e o libera em células infectadas”, diz Schur. “Foi um pouco de uma aposta, mas finalmente conseguimos encontrar a combinação certa de técnicas para examinar essa questão complexa”, diz o pós-doutor, Jesse Hansen, co-primeiro autor do estudo cuja experiência em várias técnicas de biologia estrutural e métodos de processamento de imagens foi fundamental para o projeto. Uma visão 3D global do poxvirus Os pesquisadores do ISTA examinaram viriões maduras do vírus Vaccinia “vivo” e núcleos poxímicos purificados sob todos os ângulos possíveis – muito literalmente. “Combinamos a crioo-EM de partículas simples ‘clássica’, tomografia criogênica, média de subtomograma e análise AlphaFold para obter uma visão geral do núcleo poxviral”, diz Datler. Com a tomografia crio-elétron, os pesquisadores podem reconstituir volumes 3D de uma amostra biológica tão grande quanto um vírus inteiro, adquirindo imagens enquanto gradualmente inclinam a amostra. “É como fazer uma tomografia computadorizada do vírus”, diz Hansen. “A tomografia de crio-elétron, a ‘especialidade’ do nosso laboratório, nos permitiu obter resoluções de nível nanométrico de todo o vírus, seu núcleo e interior”, diz Schur. Além disso, os https://www.nature.com/articles/s41594-023-01201-6 https://ista.ac.at/en/research/schur-group/ 3/3 pesquisadores poderiam encaixar os modelos AlphaFold nas formas observadas como um quebra- cabeça e identificar moléculas que compõem o núcleo poxviral. Entre estes, o principal candidato a proteína A10 destacou-se como um dos principais componentes. “Descobrimos que o A10 define os principais elementos estruturais do núcleo de poxvírus”, diz Datler. Schur acrescenta: “Essas descobertas são um ótimo recurso para interpretar pedaços de dados estruturais e virológicos gerados nas últimas décadas”. Um caminho robusto para descobrir núcleos de poxviral O caminho para essas descobertas foi quase simples. “Nós precisávamos encontrar nosso próprio caminho desde o início”, diz Datler. Aproveitando sua experiência em bioquímica, virologia e biologia estrutural, Datler isolou, propagou e purificou amostras do vírus Vaccinia e estabeleceu os protocolos para purificar o núcleo viral completo, otimizando essas amostras para estudos estruturais. “Estruturalmente, foi extremamente difícil estudar esses núcleos de vírus. Mas, felizmente, nossa perseverança e otimismo valeram a pena”, diz Hansen. Os pesquisadores da ISTA estão convencidos de que suas descobertas poderiam fornecer uma plataforma de conhecimento para futuras terapias que buscam atingir os núcleos do poxviral. Por exemplo, pode-se pensar em drogas que impedem o núcleo de se reunir – ou mesmo desmontar e liberar o DNA viral durante a infecção. Em última análise, a pesquisa fundamental sobre o vírus, como feito aqui, nos permite estar melhor preparados contra possíveis futuros surtos virais”, conclui Schur.
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