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Núcleo, organização da cromatina, cromossomos (estrutura e cariótipo) e nucléolo Professor: Ricardo Antunes de Azevedo Turma: Ciências dos Alimentos Biologia Celular núcleo Golgi lisossomo mitocôndria RE envelope nuclear membrana plasmática Golgi mitocôndria peroxisomo lisossomo vesícula secretória RE EUCARIOTO maior organela da célula; carioteca: 2 membranas com poros; matriz nuclear; membrana externa é contínua ao RER; cromatina; nucléolo. ENVOLTÓRIO NUCLEAR É constituído por duas membranas concêntricas: externa e interna Estrutura semelhante à da membrana plasmática Separadas pelo espaço perinuclear, interrompido por poros Apresenta ribossomos aderidos à sua superfície externa Apresenta uma lâmina nuclear de proteínas ligada à membrana interna O DNA NUCLEAR DE EUCARIOTO É ASSOCIADO A PROTEÍNAS (HISTONAS) PARA FORMAR A CROMATINA a estrutura geral da cromatina é semelhante nas células de todos os eucariotos, incluindo fungos, plantas e animais; a família de proteínas mais abundantes associadas ao DNA são as histonas: proteínas pequenas de caráter básico, ricas em aa carregados positivamente, presente em todos os núcleos eucarióticos; cinco principais tipos: H1, H2A, H2B, H3, H4 (a sequência das histonas são bem similares em espécies distantes); nucleossomo: centro protéico com DNA enrolado em sua superfície, como um carretel. O centro protéico é um octâmero formado por duas cópias de cada uma das histonas H2A, H2B, H3, H4; os nucleossomos de todos os eucariotos contêm 147 pares de bases de DNA enrolado em pouco menos de duas voltas sobre o centro protéico. O comprimento de ligação é mais variável entre as espécies (15-80 pb). Nucleossomo Fonte: Alberts et al. (1997) O nucleossomo e seus componentes A Estrutura tridimensional do octâmero de histonas B Fonte: Griffiths et al. (1999) Nucleossomo: DNA ao redor do octâmero de histonas Core de histonas (H2A, H2B, H3, H4) nucleossomo Arranjo solenóide com 6 nucleossomos por volta Proteína (não histona) scaffold cromossomo Fibra de cromatina de 30 nm alça Proteínas não – histônicas fornecem um suporte estrutural para as longas alças da cromatina Vista de um microscópio eletrônico Fonte: Alberts et al. (1997) (B) “Colar de contas” - Nucleossomos Fonte: Alberts et al. (1997) (A) Fibra de 30 nm - Solenóide 50 nm Fonte: Griffiths et al. (1999) Compactação do DNA Fonte: Alberts et al. (1997) Do DNA ao cromossomo Eucromatina: regiões do cromossomo que apresentam um padrão normal de condensação e distensão durante o ciclo celular. se duplica rapidamente durante a Interfase geralmente áreas onde está ocorrendo a expressão gênica. Heterocromatina: regiões do cromossomo condensadas por todo o ciclo celular e é transcricionalmente inativa ou transcreve pouco. Regiões do DNA que se duplicam tardiamente na Interfase facultativa: num mesmo organismo se apresenta condensada em algumas células e descondensada em outras (cromatina sexual) constitutiva: (sequências altamente repetitivas) centrômeros e telômeros Eucromatina e Heterocromatina Eucromatina: regiões definidas originalmente como coradas mais levemente Heterocromatina: regiões definidas originalmente como coradas mais fortemente Daniel Pizzaia e Margarida LR Aguiar-Perecin, 2007 O nucléolo não é uma organela! É apenas uma estrutura temporária. NUCLÉOLO Constituído por cromatina e grandes quantidades de RNAs Local de síntese de RNA ribossômico (RNAr) Bastante desenvolvido em células com atividade de síntese protéica. Constrição secundária - Milho Constrições Secundárias em Humano: cromos.:13, 14, 15, 21 e 22 Região Organizadora do Nucléolo (RON) Ocorre em determinados cromossomos que contêm genes para os RNAr, localizados em constrições secundárias. Induz a formação do nucléolo. Diferenciação linear dos cromossomos Teoria uninêmica: 1 cromossomo - 1 molécula de DNA Visualização de estruturas: Centrômero tem sequência específica de DNA. Constrição secundária DNA medianamente repetitivo (RNAr). Heterocromatina regiões mais condensadas no núcleo interfásico, em prófases mitóticas ou meióticas. É importante para o mapeamento cromossômico. Eucromatina tem os genes ativos. Caracteriza todas as regiões que não são heterocromáticas. OBS: As heterocromatinas se caracterizam pela inatividade genética. Sua localização pode ser terminal, intersticial ou pericêntrica. Tem ainda a característica de inibir permuta (crossing-over) nas regiões vizinhas. Componentes dos Cromossomos Centrômero: região de aderência das cromátides irmãs e ligação dos cromossomos às fibras do fuso. Os cromossomos podem ser classificados de acordo com a posição do centrômero (ou relação de braços): -Metacêntrico: centrômero mediano (1,0 a 1,7). -Submetacêntrico: posição submediana (1,7 a 3,0). -Acrocêntrico ou subtelocêntrico: posição subterminal (maior que 3,0) -Telocêntrico: posição terminal. Cromátide: no cromossomo metafásico, uma das duas estruturas simétricas que contém uma molécula de DNA Cromatina: DNA + proteína Constrição secundária: Ocorre em determinados cromossomos. Função: organizar o nucléolo (RON = região organizadora do nucléolo). Na RON estão os genes que codificam os RNA ribossômicos 18S e 28S e induzem a formação dos nucléolos (o nucléolo é o local de síntese dos ribossomos). CENTRÔMERO: região de constrição, de cromatina bastante condensada e sequências de DNA altamente repetitiva SUBTELOCÊNTRICOMetacêntrico Submetacêntrico Subtelocêntrico Telocêntrico Os cromossomos apresentam número, tamanho, e forma espécie- específicos durante a metáfase Camundongo Milho Humano DISCO INTERNO DISCO EXTERNO D IS C O IN TE R N O C EN TR O M ER O D IS C O E X TE R N O MICROTÚBULOS CENTRÔMERO CINETOCORO –ESTRUTURA PROTEÍCA LATERALMENTE ASSOCIADA AO CENTRÔMERO DE CADA CROMÁTIDE. o disco mais interno se conecta ao centrômero e o mais externo aos microtúbulos que compõem o fuso de divisão; os cinetócoros dirigem a migração dos cromossomos durante a divisão celular. Cariótipo (= complemento cromossômico) É o conjunto de características dos cromossomos. Como descrever um cariótipo: Medidas: do tamanho do cromossomo e posição do centrômero. Número: contagem dos cromossomos. Idiograma: representação diagramática dos cromossomos. Montagem do Cariótipo: fotografias dos cromossomos identificados - organização dos pares de homólogos em ordem decrescente de tamanho. Portanto, o cariótipo de cada espécie depende do número, tamanho e morfologia dos cromossomos. CARIÓTIPO: CONJUNTO DE CARACTERÍSTICAS MORFOLÓGICAS DOS CROMOSSOMOS DE UMA CÉLULA. Idiograma é um esquema dos cromossomos de uma determinada espécie. Ele pode mostrar informações simples como o tipo de cromossomo (localização do centrômero), tamanho dos braços e bandeamentos. Cariograma é o nome dado a uma fotografia dos cromossomos, em que estes são ordenados, esquematicamente, juntando os pares de cromossomos homólogos, de forma a permitir o estudo do cariótipo diplóide. Daniel Pizzaia e Margarida LR Aguiar-Perecin, 2011 http://www.araucaria2000.cl/biologia/biologia.php Acesso em: 25 mar. 2012 http://www.araucaria2000.cl/biologia/biologia.php Cromossomos humanos desordenados e Cromossomos humanos ordenados Metáfase Cariograma Indivíduo Feminino www.chromoscitogenetica.com.br Acesso em: 10 fev. 2011 http://www.chromoscitogenetica.com.br/ Cromossomos humanos desordenados e Cromossomos humanos ordenados Metáfase Cariograma Indivíduo Masculino www.chromoscitogenetica.com.br Acesso em: 10 fev. 2011 http://www.chromoscitogenetica.com.br/ Cariótipo de Silene latifolia Idiograma Genome 45: 243–252 (2002) CROMOSSOMOS POLITÊNICOS: presentes em células de larvas de insetos dípteros presentes em núcleos interfásicos; cromossomos gigantes:cada cromossomo é formado por um grande número de filamentos paralelos (resultado da duplicação cromossômica sem a separação dos filamentos duplicados); por razões desconhecidas os centrômeros não replicam; as regiões cromossômicas apresentam regiões de maior compactação alternadas com regiões menos compactadas. As regiões mais compactadas cromômeros; menos compactadas intercromoméricas; acredita-se que muitas cópias dos cromossomos permita um desenvolvimento larval muito mais rápido do que as células diplóides; são estáveis e só desaparecem quando o tecido se desintegra durante a metamorfose do inseto. Cromossomos de Glândulas salivares de Drosophila CROMOSSOMOS PLUMOSOS: presentes em ovócitos de anfíbios presentes na prófase da meiose (diplóteno) em ovócitos de certos animais, como anfíbios, peixes e répteis; cada cromossomo é constituído por duas cromátides, aparecem regiões de maior compactação da fibra, formando os cromômeros que se alternam com regiões de menor compactação, intercromoméricas; alguns desses cromômeros se desespiralizam e formam alças (o conjunto dessas alças confere aos cromossomos o aspecto de pluma (lampbrush chromosome); na região das alças ocorre intensa síntese e acúmulo de RNA (transcrição) transcrição durante a meiose; o aparecimento dos cromossomos plumosos coincide com a fase de intenso crescimento do ovócito, quando material macromolecular deve ser acumulado para, posteriormente, atender as necessidades do embrião durante a fase de segmentação; desaparecem depois da prófase meiótica, voltando a sua morfologia normal. Métodos de Estudo de Núcleos e de Cromossomos Mitóticos e Meióticos Coletas provenientes de: Animais Crom. Mitóticos: rins de peixes, medula óssea de anfíbios, répteis, aves e roedores, sangue de animais de grande porte e humanos. Crom. Meióticos: testículos de peixes, de anfíbios, répteis, aves e roedores. Plantas Crom. Mitóticos: meristema apical e de pontas de raizes Crom. Meióticos: anteras (mais comum) Método de Feulgen Coloração uniforme dos cromossomos Daniel Pizzaia e Margarida LR Aguiar-Perecin, 2009 Smilax fluminensis Método de Feulgen – Aberrações Cromossômicas Daniel Pizzaia e Ricardo Antunes de Azevedo, 2012 Genotoxicity - Sensitivity of tomato to Cd revealed by chromosomal aberrations Normal Abnormal Interphase Metaphase Anaphase Telophase Bar = 10 µm Chromosome aberrations in Anaphase: (A) Normal anaphase - (B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L) Abnormal anaphases (B, C, D, E, F, G, H, I, J) Chromosome loss. (B, C) Arrows: chromosomal breakage. (K, L) Bridges. Bar = 5 μm. Cd effects on α-tubulin organization in tomato root-meristem cells (immunofluorescent analysis: fluorescein isothiocyanate [FITC] – anti-α- tubulin (Green) and DAPI for DNA [Blue]) DNA α-tubulin Merge DNA α-tubulin Merge Interphase Prophase Metaphase Anaphase Telophase Normal Abnormal Bar = 10 µm DAPI FITC Combined Anaphase Control (-Cd) +Cd B1 - Chromosome loss D1,E1 - Bridge B2,C2,D2 – Short, disorganized, fragmented MTs E2: multipolarity Coloração por Nitrato de Prata Detecção de Regiões Organizadoras de Nucléolo Daniel Pizzaia e Margarida LR Aguiar-Perecin, 2010 Smilax rufescens FISH (Hibridização in situ Fluorescente) Milho Cada cor fluorescente equivale a um segmento de DNA com sequência específica de nucleotídeos. Kato, Lamb Birchler., 2004 .
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