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Estrutura do DNA e RNA O DNA é mais estável que o RNA ou as proteínas DNA – geralmente bifilamentar RNA – geralmente unifilamentar DNA DUPLA=HÉLICE dextrogira o Concentração de timina é sempre igual à de adenina o A concentração total de pirimidinas é sempre igual à concentração total de purinas o Cada uma das cadeias polinucleotídicas em uma dupla hélice consiste em uma sequência de nucleotídeos unidos por ligações fosfodiéster o Os dois filamentos são mantidos juntos por ligações de hidrogênio entre bases em filamentos opostos Os pares de bases resultantes são empilhados entre as duas cadeias perpendiculares ao eixo da molécula, como os degraus de uma escada espiral Pareamento é base-específico Adenina e timina – duas pontes de hidrogênio Guanina e citosina – três pontes de hidrogênio o Dois filamentos são então complementares o Arcabouços de açúcar-fosfato são antiparalelos ESTABILIDADE do DNA – ligações de hidrogênio entre os pares de bases, ligações hidrofóbicas (de empilhamento) entre os pares de base adjacentes. o Centro do DNA é hidrofóbico Sulcos um maior e outro menor- importante para interações entre DNA e proteínas reguladoras da expressão gênica. Formas alternativas da Dupla hélice As moléculas de DNA variam em função do ambiente. Sua conformação depende da natureza das moléculas com as quais está interagindo. DNA B – conformação em condições fisiológicos – giro para a direita (dextrogira), 10,4 pares de base por volta. DNA A – altas concentrações de sais ou estado de desidratação parcial – giro para direita, com 11 pares de bases por volta; dupla-hélice mais espessa e mais curta. o Quase certo que essa estrutura nunca existe in vivo o Mas é importante porque heterodúplex DNA-RNA ou dúplex RNA-RNA existem em uma estrutura muito semelhante a essa DNA Z – presente em hélices ricas em GC e CG alternados – giro para a esquerda (levogira), 12 pb por volta, diâmetro de 1,8 nm e um único sulco profundo. Super-hélices negativas in vivo Todas as moléculas de DNA ativas em células vivas apresentam outro nível muito importante de organização – a super-hélice. Introduzidas em uma molécula de DNA quando há clivagem de um ou ambos os filamentos, e quando os filamentos complementares em uma extremidade são rodados ou torcidos ao redor um do outro, enquanto a outra extremidade é mantida fixa. Causam colapso DNA São introduzidas e removas do DNA por enzimas que têm papéis essenciais na replicação do DNA Ocorre apenas em moléculas de DNA com extremidades fixas o Extremidades de DNA circulares são fixas o Extremidades de DNA lineares também são fixadas por ligações espaçadas e nas extremidades aos componentes não DNA dos cromossomos DNA de quase todos os organismos apresente super-helicoidização negativa (quando gira-se a extremidade livre na direção oposta da dupla-hélice). Muitas funções biológicas dos cromossomos só podem ser realizadas quanto as moléculas de DNA participantes têm super-helicoidização negativa. Estrutura do cromossomo em procariotos e vírus Moléculas de DNA são organizadas em domínios com super-helicoidização negativa. Procariotos são monoploides – só têm um conjunto de genoma. Cromossomos bacterianos contêm moléculas circulares de DNA divididas em aproximadamente 50 domínios. Estrutura do cromossomo em eucariotos Contêm enormes moléculas de DNA altamente condensadas durante a mitose e a meiose. Os centrômeros e telômeros dos cromossomos eucarióticos têm estruturas exclusivas Nível de complexidade muito maior Maioria dos eucariotos é diploide Quantidade de DNA é ordens de magnitude maior Grande parte do DNA eucarioto não contém genes codificadores de proteínas ou RNA. Composição química Cromossomos interfásicos não são visíveis à microscopia óptica, geralmente Cromatina – constituída principalmente de DNA, proteínas e com menor quantidade de RNA o Proteínas básicas – histonas (carga positiva em pH neutro) o Grupo heterogêneo de proteínas – maioria ácidas (carga negativa em pH neutro) – proteínas cromossômicas não histônicas Formas alternativas da Dupla hélice Super-hélices negativas in vivo Estrutura do cromossomo em procariotos e vírus Estrutura do cromossomo em eucariotos Composição química
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