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PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 1 Biologia Molecular e Análises Clínicas PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 2 ❖Foi demonstrado, em 1950, que a informação genética nas células estavam codificadas em uma sequência de nucleotídeos do DNA; ❖Essa informação é transmitida, de modo conservativo, de uma célula aos seus descendentes pelo processo de replicação do DNA; ❖Essas instruções genéticas são representadas por apenas 4 letras: A, C, G, T (U, no caso do RNA). Relembrando PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 3 ❖ O DNA não dirige a síntese protéica; ❖ Células copiam o DNA em RNA (transcrição) e utilizam esta informação presente no RNA para produzir uma proteína (tradução); ❖ Variações – splicing do RNA – transcritos rearranjados antes que as células eucarióticas os traduzam em ptns; ❖ Modifica o significado das moléculas de RNA e são essenciais para compreender a decodificação do genoma pelas células. Do DNA ao RNA PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 4 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 5 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 6 -Química de produtos naturais -Química fina -Tecnologia das enzimas -Microbiologia -Cultura de células de plantas e animais -Bioreatores e sistema de controle -Bioquímica -Biologia molecular -Genética PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 7 BIOLOGIA MOLECULAR ➢Custo e facilidade de uso, permite estabelecer diferentes técnicas em Laboratórios de Análises Clínicas. Genética DNA Produção de PTNS Hereditariedade Submicroscópico PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 8 1975 Nathans e Smith purificaram enzimas de restrição (ferramentas essenciais para manipulação in vitro do DNA) Fundamental importância para o isolamento e amplificação de fragmentos específicos de DNA 1975 Uma nova tecnologia começou a ser usada para investigar a localização dos genes SOUTHERN BLOTTING Marcou o início da aplicação destas tecnologias no estudo de doenças genéticas PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 9 1977 Técnicas de sequenciamento Permitiram a identificação de alterações específicas na sequência de DNA e a associação destas com diferentes doenças genéticas 1987 Técnicas de reação em cadeia da polimerase (PCR) Marco no desenvolvimento das técnicas de diagnóstico molecular PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 10 Desenvolvimento da bioinformática tem sido absolutamente essencial para a Biologia Molecular Projeto liderado por James Dewey Watson, um dos maiores bioquímicos americanos, que pretende desvendar o código genético de um organismo (podendo ser animal, vegetal, de fungos, bactérias ou de um vírus) através do seu mapeamento ( AACGTGTCGAA). Determinar o completo manual de instruções do homem pela leitura da seqüência precisa de bases químicas (A, C, G e T) no DNA Início da década de 90 PROJETO GENOMA HUMANO PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 11 O Projeto Genoma (PGH) determinou a sequência dos 3 bilhões de bases na fita dupla do DNA. Contudo, desse total, apenas 10% originam genes, ou seja, segmentos que codificam proteínas. Os 90% restantes constituem o junk DNA (DNA lixo), que não apresenta função conhecida, sendo interpretado como um resíduo do processo evolutivo da espécie humana. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 12 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 13 Types of noncoding DNA sequences Cis- and Trans-regulatory elements - Cis-regulatory elements are sequences that control the transcription of a nearby gene. Cis-elements may be located in 5' or 3' untranslated regions or within introns. Trans- regulatory elements control the transcription of a distant gene. Noncoding functional RNA - Noncoding RNAs are functional RNA molecules that are not translated into protein. Examples of noncoding RNA include ribosomal RNA, transfer RNA and microRNA. Introns - Introns are non-coding sections of a gene, transcribed into the precursor mRNA sequence, but ultimately removed by RNA splicing during the processing to mature messenger RNA. Many introns appear to be mobile genetic elements. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 14 Pseudogenes - Pseudogenes are DNA sequences, related to known genes, that have lost their protein-coding ability or are otherwise no longer expressed in the cell. Repeat sequences, transposons and viral elements - Transposons and retrotransposons are mobile genetic elements. Telomeres - are regions of repetitive DNA at the end of a chromosome, which provide protection from chromosomal deterioration during DNA replication. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 15 No longer junk: Role of long noncoding RNAs in autism risk long noncoding RNAs (lncRNAs) - Previous work has identified a subset of lncRNAs that are important for regulating the birth of new neurons, or neurogenesis, and the process by which synapses adapt to experience, called synaptic plasticity. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 16 Descreve todas as proteínas codificadas pelos genes presentes em cada cromossoma humano que atuam na determinação dos caracteres hereditários. As características dos organismos dependem das proteínas sintetizadas em estruturas celulares conhecidas por ribossomos PROTEOMA PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 17 Utilização de técnicas de Biologia Molecular em exames diagnósticos PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 18 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 19 Biologia Molecular vs Diagnóstico PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 20 ✓Sensibilidade ✓Precocidade ✓Especificidade ✓Pouco material ✓Múltiplas amostras ✓Contaminação ✓Presença de inibidores ✓Viabilidade (RNA) ✓Custo ✓Padronização PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 21 SOUTHERN BLOTTING PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 22 Fragmentos de DNA são separados em gel de agarose. Transferidos para membranas por ação capilar. DNA é desnaturado antes ou durante a transferência Sonda radioativa de DNA hibrida com o DNA na membrana DETECTA POLIMORFISMOS DE DNA OU MUTAÇÕES Aplicações: Alterações em um único nucleotídeo; detecção de inserções; deleções Com o advento da PCR seu uso tornou-se limitado PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 23 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 24 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 25 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 26 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 27 WESTERN BLOTTING PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 28 Corrida de proteínas em gelde poliacrilamida. Separação e caracterização das proteínas. Transferência para membrana por força elétrica Proteína alvo é identificada por anticorpo mono ou policlonal. Revelação do sistema com anticorpo secundário fluorescente ou radioativo Informa o tamanho e a quantidade das proteínas PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 29 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 30 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 31 HIV - WESTERN - BLOT Código .:WHIV Material .: soro Sinônimo .: Western Bloting Volume .: 2.0 mL Método .: Western blot Resultado .: Após 48 horas Temperatura .: Sob refrigeração Coleta .: Jejum não obrigatório. Soro não pode ser hemolisado. Código SUS .: 0202030296 / Código CBHPM .: 4.03.07.87-5 Interpretação .: Ver HIV 1 e 2 - Anticorpos (2 Métodos). Referência .: Não Reagente : Ausência de bandas; Reagente : Presença de, no mínimo, 2 (duas) bandas dentre as: gp160/120; gp 41; p24. Indeterminado: Qualquer outro padrão de bandas diferente dos descritos acima PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 32 HTLV I/II - WESTERN BLOT Técnica de Western Blot é útilizada para confirmar a positividade do teste imunoenzimático (ELISA) e, a partir das bandas de proteínas detectadas, identificar o tipo de infecção, se é pelo vírus HTLV-1 ou pelo HTLV-2. Código .: HTLVW Material .: soro Volume .: 2.0 mL Método .: Western blot Resultado .: 15 dias Temperatura .: Sob refrigeração Coleta .: Jejum não necessário. Coletar soro. Código SUS .: / Código CBHPM .: 4.03.07.88-3 Interpretação .: Uso: Confirmação da positividade e discriminação entre as infecções por HTLV 1 e 2. http://www.htlv.com.br/patogenese.htm Vírus linfotrópico das células T Ativação imune contra a presença de antígenos do HTLV-I, conduzindo a um processo inflamatório de desmielinização, principalmente no medula espinhal torácica. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 33 FISH Hibridização in situ com fluorescência PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 34 PRINCÍPIO: Os cromossomos são isolados da célula (em lâmina de microscopia) e tratados com solução química para desnaturar a dupla fita do DNA. A seguir adiciona-se sondas específicas para ligarem ao DNA. Finalmente, incuba com material fluorescente capaz de identificar o DNA ligado à sonda. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 35 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 36 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 37 As principais indicações no diagnóstico pré-natal são: · Presença de anomalias fetais à ultra-sonografia; · Alterações nos exames séricos maternos de rastreamento (Papp-A e ß-HCG livre); · História familiar de aneuploidias; · Idade materna igual ou superior a 35 anos. DIAGNÓSTICO RÁPIDO DE CROMOSSOMOPATIAS POR FISH NO PRÉ- NATAL A coleta do material é guiada por ultra-som, e o exame deve ser feito entre a décima e décima-quarta semanas de gestação, para o vilo corial, e entre a décima quarta e vigésima semanas para o líquido amniótico. Pelo fato de serem investigadas apenas alterações numéricas dos cromossomos alvo (13, 18, 21, X, Y), anomalias estruturais não são reconhecidas. Assim, a FISH deve ser complementada pelo cariótipo fetal convencional. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 38 FISH PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 39 Captura Híbrida HPV PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 40 A Captura Híbrida é o exame mais moderno para se fazer o diagnóstico do HPV. É um teste de biologia molecular qualitativo e quantitativo, que amplifica e detecta o sinal dos híbridos formados pela reação enzima-substrato. A leitura do resultado é feita por quimioluminescência. O exame consegue diagnosticar a presença do vírus mesmo antes do aparecimento de qualquer sintoma. O exame possibilita informar com certeza se o/a paciente é portador/a da infecção ou não. É um exame útil no diagnóstico e acompanhamento da infecção pelo Papilomavírus Humano (HPV). Identifica 18 tipos do HPV, divididos em sondas de baixo e alto risco para câncer do colo do útero. Permite a detecção de 1 pg/mL de DNA-HPV, equivalente a 0,1 cópia de vírus por célula. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 41 A Captura Híbrida não identifica os tipos virais do HPV, e sim os grupos virais. O teste possui dois pools de sondas, uma para os vírus de baixo risco (não oncogênicos ou seja, que não causam o câncer) que pesquisa os tipos virais 6, 11, 42, 43 e 44; e outra para os vírus de alto risco (oncogênicos ou que podem causar o câncer) que pesquisa os tipos virais 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59 e 68. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 42 Como é feito o processamento laboratorial? Após a coleta do material, o processamento laboratorial é semi- automatizado. Reagindo com sonda gênica especifica, o material para análise forma híbridos de RNA/DNA que são capturados por anticorpos que revestem as paredes da microplaca. A seguir, os híbridos imobilizados, reagem com anticorpos específicos conjugados a fosfatase alcalina, formando um substrato estável que é posteriormente detectado por quimioluminescência ultra-sensível. Os valores lidos pelo quimioluminômetro são transmitidos a um computador, dotado de software específico, que analisa os números recebidos e faz os cálculos de validação do ensaio e a quantificação dos controles positivos, negativos e amostras. O software executa o relatório final do teste e sua impressão, não havendo margem de erro nos cálculos. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 43 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 44 Desnaturação – Hibridização – Captura Híbrida – Conjugação - Detecção O Sistema de Captura Híbrida é um teste capaz de detectar diversos agentes etiológicos de doenças infecciosas, como o papilomavírus humano – HPV. Este sistema é um ensaio com amplificação do sinal dos anticorpos contra os híbridos capturados em microplaca, que utiliza a detecção quimiluminescente. A presença de certos tipos de HPV no trato genital feminino são o principal factor de risco para o cancro cervical. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 45 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 46 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 47 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 48 HEPATITES PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 49 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 50 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 51 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 52 Extração de ácidos nucléicos PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 53 Extração de ácidos nucléicos Necessário pois toda a análise ou manipulação de DNA ou RNA depende da extração do organismo a ser estudado. Exemplos: tecidos, líquidos biológicos(sangue, escarro…)Etapas da extração: lise celular, desproteinização e concentração do DNA ou RNA. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 54 Quais são os métodos???? Fenol-clorofórmio Quelex Kit comercias e etc PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 55 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 56 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 57 Como proceder após a extração do material genético? Se a amostra for DNA pode ser armazenada no -20° ou no -80°C Se a amostra for RNA antes de armazenar tem que fazer a RT-PCR PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 58 Utilizada para analisar macromoléculas com carga (proteínas e ácidos nucléicos) em relação a um campo elétrico. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 59 ELETROFORESE Metodologia amplamente empregada, que se baseia na migração de moléculas com carga em relação a um campo elétrico. No caso dos ácidos nucléicos, que se comportam como poliânions (carga negativa), a migração ocorre em direção ao anodo (pólo positivo). PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 60 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 61 O que significa RT-PCR? Etapa prévia a PCR, que é a síntese de uma fita de DNA tendo como molde uma molécula de RNA. O produto obtido através dessa técnica chama-se DNA complementar (cDNA). PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 62 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 63 PCR PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 64 • Técnica de biologia molecular empregada para obter-se amplificação exponencial de pequenas quantidades de DNA in vitro, empregando elementos do processo natural de replicação do DNA. PCR = Polymerase Chain Reaction ou Reação em cadeia da Polimerase ou Reação de polimerização em cadeia ou Polimerização em cadeia do DNA PCR PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 65 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 66 Eletroforese em gel de agarose 1,5% dos produtos de PCR para se determinar o genótipo G de Rotavírus A. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 67 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 68 PCR Tempo Real PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 69 TESTE DE PATERNIDADE / DNA FINGERPRINTPCR Código .: PATDUO Material .: sangue total com EDTA Sinônimo .: Investigação de Vínculo Genético de Filiação Volume .: 10.0 mL Método .: PCR Rotina .: Diária Resultado .: 15 dias uteis Temperatura .: Temperatura ambiente Coleta .: Coletar sangue total com EDTA de todas as partes participantes do teste. Caso a mãe tenha menos que 18 anos encaminhar com o material uma declaração do responsável por ela. Quando o filho não for registrado em nome do suposto pai, é necessário uma declaração do responsável legal. Quando o filho não tiver registro deve ser encaminhado a declaração de nascido vivo. Código SUS .: /Código CBHPM .: 0.00.00.00-0 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 70 Interpretação: O Laboratório Alvaro emprega em suas análises o DNA genômico extraído de leucócitos presentes no sangue dos examinandos (Suposto Pai, Mãe e Filho (a)). Para cada indivíduo determina-se os seus dois alelos de cada um dos treze locos em estudo. Na identificação de cada loco de microssatélite utiliza- se a tecnologia da PCR (Polymerase Chain Reaction, Reação em Cadeia pela Polimerase) que amplifica os locos e promove a marcação destes utilizando-se oligonucleotídeos marcados com grupos fluorescentes de quatro cores diferentes. Os alelos amplificados e marcados são analisados em sequenciador automático ABI-PRISM Genetic Analizer (sistema validado pelo TWGDAM) e seus tamanhos em pares de bases (bp) são determinados por meio de comparação com padrões previamente obtidos de DNA de comprimento conhecido. Posteriormente todos os dados são calculados estatisticamente com base em tabelas de frequências alélicas determinadas experimentalmente numa amostra representativa da população. Nos casos de inclusão de paternidade alcança-se uma certeza maior do que 99,99% e nos casos de exclusão de paternidade a certeza é de 100% PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 71 TESTE DE PATERNIDADE / DNA FINGERPRINT T ro c a d e b e b ê s n a m a te rn id a d e Regiões são especificamente selecionadas por possuírem grande diversidade de tamanho dentro de uma população (marcadores genéticos). PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 72 Sequenciamento PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 73 Sequenciamento Sequenciamento do DNA é um processo que determina a ordem dos nucleotídeos em uma amostra PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 74 Método de Sanger Pelo método de Sanger, uma fita simples de DNA que será sequenciada, é hibridizada com um iniciador de desoxinucleotídeos marcado na ponta 5 (cinco linha). Quatro misturas de reação são preparadas onde os iniciadores utilizados serão polimerisados por uma DNA polimerase. NGS (Next Generation Sequence) – Illumina, Ion torrent, metagenomica, genoma completo etc. PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 75 Sequenciamento PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 76 HEPATITE B - Quantitativo + Genotipagem Código .:HBQG Material .: soro Volume .: 2,0 mL Método .: PCR e sequenciamento Resultado .: 30 dias Temperatura .: Congelar à - 4oC Coleta .: 1 - Sangue deve ser coletado em tubos estéreis sem aditivos ou contendo EDTA; 2 - Soro ou plasma (EDTA) devem ser separados entre 2 a 6 horas após a coleta ; 3 - O material deve ser congelado logo após a centrifugação e enviado congelado ao laboratório; 4 - Os materiais que chegarem descongelados serão considerados como LIMITADOS para a quantificação e/ou detecção viral e a interpretação do resultado será restrito. Código SUS .: /Código CBHPM .:4.03.14.08-1 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 77 Interpretação: O vírus da Hepatite B é um dos principais agentes etiológicos das hepatites agudas e crônicas e está também relacionado com o desenvolvimento de cirrose e carcinoma hepático. Embora existam diversos marcadores sorológicos extremamente úteis, em muitas situações é importante a detecção do DNA viral e a quantificação da carga viral. Alguns mutantes VHB podem apresentar modificações importantes no AgHBs e no AgHBe, fazendo com que não sejam mais detectados por métodos imunológicos. Nestes casos, apenas a detecção do DNA pode identificar a presença da partícula viral circulante. Este método tem como objetivo detectar a presença de mutações específicas nos domínios B e C da DNA polimerase viral. A presença dessas mutações M1550V, M550I e L 526M leva o paciente a ficar resistente a essas drogas. Este teste também é conhecido como resistência genotípica do VHB aos inibidores da DNA polimerase viral, sequenciamento da DNA polimerase do VHB ou pesquisa de mutação YMDD. Referência .:Indetectável Positivo : Presença de HBV-DNA e resistência Limite mínimo teórico de detecção 50 cópias/mL PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 78 Microarray PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 79 Microarray- Chip de DNA- Microarranjos de DNA Southern blotting em lâmina Chips de genes Pode conter mais de 10.000 sondas oligonucleotídicas Hibridização com mRNA ou cDNA fluorescentes Leitura por scanners PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 80 V a nt a ge ns D e sv a nt a ge ns Microarray PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 81 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 82 PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 83 Atividade PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 84 1 - Cite as diferenças entre o DNA e o RNA. 2 – Explique como ocorre a replicação do DNA? Cite 3 diferenças encontradas nesse processo entre procarioto e eucarioto. 3 - Quais das seguintes afirmações estão corretas? Justifique sua resposta a) A forquilha de replicação é assimétrica porque contém duas moléculas de DNA polimerase estruturalmente distintas. b) Os fragmentos de Okazaki são removidos por uma RNA nuclease. c) A taxa de erros da replicação de DNA é reduzida pelo mecanismo de verificação da DNA polimerase. d) Na ausência do reparo (DNA polimerase e enzimas), os genes são instáveis. e) O câncer resulta de mutações não corrigidas nas células somáticas. 4 - Se uma cadeia de DNA apresenta a sequência de bases: ATTGCTGCGCATT, a outra cadeia apresenta na região correspondente qual sequência complementar? PÓS-GRADUAÇÃO EM ANÁLISES CLÍNICAS Profa Dra Camila Souza Lemos e Profa Ms. Larissa Gomes 85 1)Onde ocorre a transcrição do DNA? E a tradução do RNA? 2)Porque o splicing do mRNA é importante? 3)O que é um códon? 4)Podemos dizer que essas afirmações estão corretas? Se não justifique as alternativas incorretas. I) Os três tipos de RNA, rRNA, tRNA, mRNA participam do processo de síntese protéica II) rRNA que é um dos componentes dos ribossomos III) Os mRNA contém a mensagem que será traduzida em proteína IV) Os tRNA carregam os aminoácidos específicos para cada códon
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