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A B C D E 1 Marcar para revisão A curva padrão desempenha um papel essencial na quantificação absoluta de um DNA alvo em uma amostra. Qual é a finalidade da curva padrão em quantificação absoluta de DNA alvo? Determinar a temperatura ótima de amplificação do DNA alvo. Calibrar a concentração de reagentes na reação de amplificação. Estabelecer a linearidade e eficiência da amplificação para cálculos precisos. Identificar a sequência específica do DNA alvo. Avaliar a presença de contaminantes na amostra. Questão 1 de 10 Em branco �10� Finalizar exercício 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Feedback Exercício Amplificação In Vitro De Dna Sair e finalizar depois A B C 2 Marcar para revisão A Biotecnologia utiliza conceitos das áreas da Biologia Molecular e da Genética Molecular, que têm uma ampla gama de técnicas, métodos e equipamentos específicos para cada objetivo. Com relação à análise e identificação de material genético utilizando técnicas de biologia molecular, assinale a opção correta. A eletroforese em gel de agarose é preferencialmente utilizada para separar fragmentos de DNA, como produtos de PCR. Quando uma solução aquosa de DNA é aquecida até 100 °C ou exposta a um pH maior ou igual a 13, a hélice da molécula rapidamente se dissocia em duas fitas duplas. Cromossomos inteiros não podem ser individualizados por meio de técnicas de Biologia Molecular. D E Para análise de perfil genético, por exemplo, na Biologia forense, utiliza-se a tecnologia do DNA recombinante, ou por clonagem gênica. A hibridação de sondas de DNA com RNAs celulares em uma qPCR permite determinar se um gene sofreu ou não uma mutação. 3 Marcar para revisão Em algumas situações, a obtenção de DNA a partir de RNA transcrito é importante, como, por exemplo, na construção de bibliotecas. Considerando os conceitos relacionados a essa estratégia e a figura acima, que mostra uma das possíveis estratégias para síntese de DNA a partir de RNA, assinale a opção correta. A B C D E A reação mostrada na etapa 3 ilustra a atividade da enzima transcriptase reversa. A reação mostrada na etapa 4 ilustra a atividade da enzima DNA polimerase. Na etapa 4, para que ocorra a reação, é suficiente a adição dos nucleosídios representados por A, U, C, G. O DNA obtido pelo método ilustrado é denominado tDNA. A reação mostrada na etapa demonstra a desnaturação da fita de mRNA. 4 Marcar para revisão No diagnóstico clínico- molecular, a reação em cadeia da polimerase �PCR) em tempo real pode ser utilizada para a avaliação da carga viral ou bacteriana, para a determinação da resistência a antibióticos e, até mesmo, para o prognóstico de tumores malignos. A figura abaixo apresenta ciclos de amplificação de amostras por PCR em tempo real, sendo �A� uma amplificação de um determinado segmento gênico que identifica um determinado marcador tumoral em células neoplásicas e �B) uma amplificação do mesmo segmento gênico em células não neoplásicas. A partir das informações apresentadas, conclui-se que: A B C o Ct (ciclo threshold) pode ser determinado pela intersecção da linha do limiar de detecção da reação threshold, com a linha da amplificação gênica de cada amostra. O aumento da fluorescência indica que a amplificação da sequência-alvo está ocorrendo, pois a cada ciclo, durante a desnaturação da dupla fita, ocorre liberação da fluorescência. A linha paralela ao eixo referente ao número de ciclos, na altura em que se inicia a fase exponencial da amplificação gênica, denominado threshold, representa falsos sinais positivos por contaminação das amostras por DNA genômico. D E A análise comparativa das duas amostras deve ser realizada a partir da estabilização da amplificação, que ocorre na fase platô, sendo alcançada no ciclo 28 para a amostra A, e no ciclo 40, para a amostra B. O maior Ct �26) é observado no início da fase exponencial de amplificação em células não neoplásicas ( B ), e indica maior expressão comparativamente às células neoplásicas ( B ), que apresentam Ct = 17, não sendo esta sequência-alvo um bom marcador tumoral. 5 Marcar para revisão Ao se analisar a evolução das estratégias para determinação de identidade genética, que se tornaram um procedimento sensível e informativo, pode-se notar três fases: uma inicial, após a descrição de um marcador voltado ao polimorfismo genético em 1980, que deu origem às A B impressões digitais de DNA, com a aplicação de técnicas de polimorfismo de tamanho dos fragmentos de restrição - restriction fragment length polymorphism �RFLP� -; uma segunda fase de incorporação de novas técnicas, no final da década de 80 do século XX, como a reação em cadeia da polimerase �PCR�, que permitiu um significativo aumento na sensibilidade dos métodos e a consequente identificação de indivíduos com amostras colhidas de fragmentos de unhas, goma de mascar etc.; e uma terceira etapa, mais recente, cuja ênfase foi a padronização metodológica e estatística e a geração de bancos de dados. Considerando as aplicações da PCR, assinale a opção correta. Amplificação de conjuntos de repetições em tandem curtas (short tandem repeats) facilita a identificação de indivíduos. O uso correto da PCR requer cuidados para evitar a desnaturação do DNA na etapa em que as fitas são separadas. C D E A RT-qPCR permite a amplificação por meio da adição de aminoácidos a novas fitas de polímero sintetizadas. Uma das limitações da PCR é a impossibilidade de se amplificar diferentes sequências simultaneamente. Ao se planejar um experimento para identificação de indivíduos, deve-se ter o cuidado de escolher sondas para qPCR em regiões que não contenham mutações. 6 Marcar para revisão A Reação em Cadeia da Polimerase �PCR) desempenha um papel fundamental na biologia molecular, possibilitando a amplificação seletiva de segmentos específicos de DNA. Qual é a diferença central entre a PCR qualitativa e a PCR quantitativa (em tempo real)? A B C A PCR qualitativa requer ciclos adicionais para quantificar o produto, enquanto a PCR quantitativa não necessita de revelação posterior. A PCR quantitativa é mais rápida e não exige revelação posterior, enquanto a PCR qualitativa é mais lenta. A PCR qualitativa ocorre em um termociclador especializado (tempo real), enquanto a PCR quantitativa utiliza um termociclador comum. D E A PCR quantitativa é mais sensível na detecção de alvos específicos necessitando de amplificação em tempo real, enquanto a PCR qualitativa é mais rápida na amplificação. A PCR qualitativa não requer amplificação do produto alvo, enquanto a PCR quantitativa quantifica a presença do alvo em tempo real. 7 Marcar para revisão SNPs são empregados amplamente para a identificação humana e possuem diferenças relevantes. A análise dos SNPs também pode estar associada aos fenótipos individuais, havendo uma possibilidade futura de identificação de traços físicos como, por exemplo, a cor da íris. Os SNPs são: A B C D E A B Elementos repetitivos do genoma nuclear Sequências presentes somente no DNA mitocondrial Homozigotos Polimorfismos de nucleotídeo único; uma variação na sequência de DNA Heterozigotos 8 Marcar para revisão A principal função do PCR multiplex é permitir a detecção simultânea de múltiplos alvos de DNA em uma única reação. Qual é a principal função da técnica de PCR multiplex no diagnóstico de doenças genéticas? Amplificar regiões próximas de repetições de DNA. Identificar a presença de infecções virais. C D E Determinar a estrutura tridimensional de proteínas. Avaliar a expressão gênica em diferentes tecidos. Detectar pequenas mutações em alelos distintos. 9 Marcar para revisão A importância primordial da sensibilidade da PCR transcende diversoscenários biomoleculares, incluindo diagnósticos clínicos, pesquisas genéticas e análises de patógenos. Nesse contexto, qual é exatamente o conceito subjacente à sensibilidade da PCR? A B C D E Sensibilidade da PCR refere-se à capacidade de amplificar DNA em altas temperaturas, o que facilita a detecção. Sensibilidade da PCR representa a habilidade da enzima Taq polimerase em se ligar ao DNA-alvo. Sensibilidade da PCR é a quantidade máxima de DNA que pode ser amplificada em uma reação. Sensibilidade da PCR é a capacidade de detectar o sinal do DNA-alvo em amostras contendo-o na realidade. Sensibilidade da PCR é a velocidade com que os produtos de amplificação são gerados. 10 Marcar para revisão A B C A Biotecnologia trabalha predominantemente manipulando material genético de seres vivos; para a maioria dos organismos, o material genético é a molécula de DNA. Acerca da estrutura da molécula de DNA, assinale a opção correta. O DNA é composto por quatro tipos de bases nitrogenadas: adenina, citosina, timina e uracila. O açúcar contido na molécula de DNA é a ribose. Em uma cadeia de DNA, os nucleotídeos se ligam aos açúcares e fosfatos por pontes de hidrogênio. D E As duas fitas que compõem a molécula de DNA são ligadas por pontes de hidrogênio entre suas bases nitrogenadas. Há complementaridade entre as bases nitrogenadas adenina e timina e entre guanina e uracila.