Prévia do material em texto
Nome: Marisa Camargos Barbosa Matrícula: 814003 Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais – Campus Betim Estudo Dirigido 8 – Sequenciamento de Nova Geração 1) Julgue as frases a seguir e coloquei V para as verdadeiras e F para as falsas: ( V ) Os métodos de nova geração de sequenciamento de DNA (next generation sequencing) permitem realizar sequenciamento de alto desempenho, sendo um desses métodos o pirosequenciamento. A leitura da sequência de DNA por esse método é realizada a partir de uma combinação de reações enzimáticas, iniciada com a liberação de uma molécula de pirofosfato, quando um desoxinucleotídeo é incorporado à cadeia de DNA ( F ) Metodologias de segunda e terceira geração de NGS são baseadas na amplificação dos ácidos nucléicos a serem sequenciados, sendo essa amplificação essencial para a captação do sinal de leitura em equipamentos de ambas as gerações ( V ) Sequenciar um genoma por métodos NGS é mais barato e rápido do que sequenciar o mesmo genoma pelo o método Sanger. 2) A técnica de sequenciamento de DNA consiste em determinar exatamente a sequência de nucleotídeos que compõe um fragmento de DNA. Uma das primeiras metodologias foi desenvolvida na década de 1970 e ficou conhecida como sequenciamento de Sanger. Atualmente, com a evolução da metodologia, o sequenciamento é conhecido por nova geração, o que possibilitou a diminuição considerável do tempo necessário para obtenção de resultados, além de reduzir seus custos. Qual item a seguir indica a diferença entre o sequenciamento de Sanger e o de nova geração? a) Não há diferença técnica entre as metodologias, o que ocorreu foi simplesmente um avanço na área da informática que permitiu maior agilidade na obtenção dos resultados no sequenciamento de nova geração. b) Utilização de di-deoxi-ribonucleotídeos radioativos no de Sanger, diferindo da capacidade de automação com a utilização de di-deoxi-ribonucleotídeos fluorescentes no de nova geração. c) A diferença entre os métodos baseia-se simplesmente na quantidade de nucleotídeos que são registrados por cada uma delas. Enquanto numa única reação de Sanger são registrados aproximadamente 1.000 nucleotídeos, no sequenciamento de nova geração mais de 1.000.000 de nucleotídeos são registrados em cada poço de reação. Portanto, há uma considerável otimização no segundo caso. d) O método de Sanger era todo manual, o que tornou o processo bastante demorado. Já o de nova geração foi automatizado com a utilização de equipamentos computadorizados, aumentando a velocidade de processamento das amostras. e) O método de Sanger utiliza nucleotídeos com a substituição do grupo hidroxila por hidreto no carbono 3' da ribose. Já no de nova geração, diversos princípios foram desenvolvidos, porém todos eles compartilham algumas características, como multiplexing (análise de diversas amostras ao mesmo tempo) e capacidade de registrar sequências menores em relação ao de Sanger. 3) Os estudos de sequenciamento genético iniciaram-se na década de 1970. Desde então, as tecnologias de sequenciamento vêm evoluindo e permitindo expressivos avanços nas mais deferentes áreas do conhecimento. Analise as seguintes afirmativas referentes às metodologias de sequenciamento de ácidos nucleicos atualmente disponíveis. I - As tecnologias de sequenciamento de ácidos nucleicos denominadas de NGS (Next Generation Sequencing) apresentam como grande diferencial o processamento massivo de amostras, que é possível pelo uso de adaptadores específicos e determinados para cada tecnologia. II - Metodologias de segunda e terceira geração de NGS são baseadas na amplificação dos ácidos nucleicos a serem sequenciados, sendo essa amplificação essencial para a captação do sinal de leitura em equipamentos de ambas as gerações. III - A tecnologia de sequenciamento por terminadores reversíveis tem como principal característica, frente a outras tecnologias, o fundamento da fragmentação de DNA com alta integridade e posterior ligação de terminadores reversíveis à porção 5’ e 3’ dos fragmentos gerados. IV - A base do processo, em todas as metodologias de sequenciamento, para a obtenção da sequência de um genoma bacteriano completo é a fragmentação do DNA, a construção das bibliotecas e a leitura das bases. Posteriormente, o sucesso na montagem do conjunto de dados obtido, com fechamento do genoma bacteriano, está primariamente vinculado à qualidade das sequências geradas. Quais estão corretas? a) Apenas I. b) Apenas I e III. c) Apenas I e IV. c) Apenas II e III. d) Apenas II e IV.