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Ácidos nucléicos Um nucleotídeo Bases nitrogenadas Ribose Conformações da ribose Adenina Adenosina Adenilato RNA Deoxiadenosina Deoxiadenilato DNA Guanina Guanosina Guanilato RNA Deoxiguanosina Deoxiguanilato DNA Citosina Citidina Citidilato RNA Deoxicitina Deoxicitidilato DNA Timina Timidina Timilato DNA Deoxitimidina Deoxitimidilato DNA Uracila Uridina Uridilato RNA Nomenclatura dos nucleotídeos e ácidos nucléicos Base Nucleosídeo Nucleotídeo Ácido nucléico Desoxiribonucleotídeos Deoxiadenosina Deoxiguanosina Deoxiadenilato Deoxiguanilato Desoxiribonucleotídeos Deoxitimidilato Deoxicitidilato Ribonucleotídeos Adenilato Guanilato Ribonucleotídeos Uridilato Citidilato Abreviaturas para ribonucleosideos 5`-fosfatos Base modificadas Nucleotídeos modificados AMP cíclico: AMPc, cAMP Nucleotídeos modificados A dupla hélice e o pareamento de Watson-Click A dupla hélice e o pareamento deWatson-Click Dupla fita Sulco maior Sulco menor Pareamentos não-Watson-Click Tetraplex de guanosina Quebra da fita de RNA em meio básico Representação simplificada da fita simples do DNA Espectroscopia de absorção Espectroscopia de absorção Experimento de Avery-Macleod-McCarty Experimento de Hershey-Chase Regras de Chagaff 1. A composição de bases geralmente varia de uma espécie para outra. 2. Amostras de DNA isolados de diferentes tecidos da mesma espécie têm a mesma composição de bases. 3. A composição de bases do DNA em uma dada espécie não muda com a idade do organismo, estado nutricional, ou mudança ambiental. 4. Em todos DNA celular, sem consideração das espécies, o número de resíduos de adenosina é igual de timidina, e o número de resíduos de guanosina é igual de citidina. Difração de raios-x do DNA Pareamento de bases na fita dupla de DNA e as pontes de hidrogênio entre bases A replicação semi- conservativa do DNA Características das formas do DNA Seqüências de reconhecimentos no DNA Conformações do DNA: grampo de cabelo Pareamento de Hoogsten DNA triplex Genes mono ou poli-cistrônico RNA de fita simples Conformações do RNA de fita dupla: barrigas, loops internos, grampos de cabelo Grampo de cabelo em fita dupla RNA transportador Desnaturação e annealling Tm=temp. of melting, temp. fusão A Tm cresce com a razão de bases C-G Hibridação de DNA Modificação das bases nitrogenadas Modificação de nucleotídeo Formação de dímeros de timina e fotoproduto 6-4 pela radiação UV Enrugamento da dupla hélice no dímero de timina Precursores do ácido nitroso: Agentes lesivos ao DNA Agentes alquilantes do DNA Tautomerização e alquilação Seqüenciamento genético: fita molde e primers Dideoxinucleotídeos: interrupção da polimerização pela ausência da OH 3` Uso de PAGE em seqüen- ciamento A reação de polimerase em cadeia (PCR): uma breve história. • Em 1965 foi descoberto o Termophilus aquaticus pelo prof. Thomas Brock, da Univ. Wisconsin; • Em 1980 Kary Mullis idealizou a PCR, com uso de polimerase de Escherichia coli; • No final de 1980 foi introduzido a polimerase de Termus aquaticus, Taq; • O comércio de Taq polimerase na Europa em 1991 foi de U$26 milhões. • Atualmente são usadas também as polimerases de: • Pfu Pyrococcus furiosos,. • Amplitaq(R) Termus aquaticus. • Hot TubTM Therms flavis. • PyrostaseTM Thermus flavis, • VentTM Thermococcus litoralis, • Deep VentTM Pyrococcus GB-D, • ULTmaTM Thermotoga maritima. Síntese de poli-nucleotídeos em fase sólida Outros nucleotí- deos com funções fisiológicas