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Enzimas: Visão Geral e Mecanismos de Ação Professora Dsc. Marcela Gonçalves Enzimas: Definição São proteínas especializadas na catalise de reações biológicas, para síntese e degradação Aceleram a velocidade de uma reação, sem participar dela como reagente ou produto, com alta eficiência Aceleram de 109 a 1.012 vezes a velocidade da reação, transformando de 100 a 1.000 moléculas de substrato em produto, por minuto de reação São extremamente específicas para a reação que catalisam Enzimas: Definição São sintetizadas por células vivas e atuam em quase todas as reações químicas do metabolismo dos organismos vivos Atuam em concentrações muito baixas e em condições suaves de temperatura e pH Sendo ainda reguladores deste conjunto de reações Podem ter sua atividade regulada Estão quase sempre dentro da célula e compartimentalizadas Enzimas: Definição Convertem uma substância, chamada de substrato, em outra denominada produto Em geral, uma enzima catalisa um só tipo de reação química Enzimas: Definição Como são catalisadoras, as enzimas não são consumidas na reação e não alteram seu equilíbrio químico. Presentes nos vários alimentos, atuando na hidrólise do material alimentício em compostos mais simples. Ex.: as lipases que hidrolisam as gorduras em glicerol e ácidos graxos, e as amilases que hidrolisam amido em açúcares mais simples. amilases Enzimas: Definição As enzimas, sendo proteínas globulares de diversos tamanhos, têm sua estrutura definida pelas estruturas primária, secundária, terciária e quaternária. Citrato sintase Ligase do DNA Enzimas: Nomenclatura Nome Recomendado: Usa o sufixo "ase" para caracterizar a enzima. Ex: Urease, Hexoquinase, Peptidase Nome Sistemático: Mais complexo, oferece a informação precisa sobre a função metabólica da enzima Ex: ATP-Glicose-Fosfo-Transferase Nome Usual: Consagrado pelo uso Ex: Tripsina, Pepsina (digere proteina), Ptialina (digere amido). Enzimas: Classificação e Estrutura Segundo a União Internacional de Bioquímica (IUB), são 6 classes: Oxidorredutases: catalisam reações de transferência de elétrons, ou seja, reações de oxiredução. São as desidrogenases e as oxidases. Se uma molécula se reduz, tem que haver outra que se oxide. Transferases: catalisam reações de transferência de grupamentos funcionais, como grupos amina, fosfato, acil, carboxil, etc. Exemplos: As quinases e as transaminases Enzimas: Classificação e Estrutura Segundo a União Internacional de Bioquímica (IUB), são 6 classes: Hidrolases: catalisam reações de hidrólise de ligação covalente. Exemplos: As peptidases. Liases: catalisam a quebra de ligações covalentes e a remoção de moléculas de água, amônia e gás carbônico. Exemplos: As dehidratases e as descarboxilases. Enzimas: Classificação e Estrutura Segundo a União Internacional de Bioquímica (IUB), são 6 classes: Isomerases: catalisam reações de interconversão entre isômeros ópticos ou geométricos. Exemplos: As epimerases. Ligases: catalisam reações de formação e novas moléculas a partir da ligação entre duas já existentes, sempre à custa de energia (ATP). Exemplos: as sintetases. Enzimas: Classificação e Estrutura Segundo a União Internacional de Bioquímica (IUB): Enzimas: Especificidade As enzimas são específicas, isto é, hidrolisam e/ou sintetizam um composto em particular. Sua ação está limitada a ligações específicas dentro dos compostos com os quais exercem reação: SITIO ATIVO Parte da enzima, que a difere da proteína, é capaz de se ligar a moléculas denominadas substrato formando o complexo enzima-substrato E + S ↔ [ES] ↔ E + P Enzimas: Teorias de Especificidade Teoria da chave-fechadura (Emil Fischer): onde a chave (o substrato), deve-se ajustar à fechadura (a enzima), de modo que cada enzima aja sobre um número muito limitado de compostos. Enzimas: Teorias de Especificidade Modelo do Ajuste induzido: prevê um sitio de ligação não totalmente pré-formado, mas sim moldável a molécula do substrato; a enzima se ajustaria a molécula do substrato na sua presença. Enzimas: Cofatores Pequenas moléculas orgânicas ou inorgânicas que podem ser necessárias para a função de uma enzima. Compostos Inorgânicos: Enzimas: Coenzimas Compostos Orgânicos: são normalmente grupos prostéticos, que estão intimamente ligados às enzimas a que eles prestam assistência. Se um cofator for orgânico, recebe o nome de COENZIMA. Coenzimas: Maioria deriva de vitaminas hidrossolúveis, sendo classificado como transportadoras de H e transportadoras de grupos químicos Enzimas: Coenzimas Coenzimas: B8 B9 Enzimas: Coenzimas Coenzimas: Enzimas: Coenzimas Eles não estão ligados permanentemente a molécula da enzima mas, na ausência deles, a enzima é inativa. A fração proteica de uma enzima, na ausência do seu cofator, é chamada de Apoenzima. Fração Proteica + Cofator = Holoenzima. Enzima Enzimas: Coenzimas Podem atuar segundo 3 modelos: Ligando-se a enzima com afinidade semelhante a do substrato; Ligando-se covalentemente em local próximo ou no próprio sítio catalítico da apoenzima; Atuando de maneira intermediaria aos dois extremos acima citados. Enzimas: Mecanismo de Ação Atuam, principalmente: Baixando a energia de ativação: através da criação de um ambiente no qual o estado de transição é estabilizado (por exemplo, distorcendo a forma da molécula do substrato) Enzimas: Regulação e Processos de Inibição Enzimas: Atividade das Enzimas Fatores que afetam a atividade das enzimas Temperatura: Maior velocidade da reação em uma temperatura ótima. A partir dela, a atividade volta a diminuir, por desnaturação da molécula Enzimas: Atividade das Enzimas Fatores que afetam a atividade das enzimas pH: Existe um pH ótimo, onde a distribuição de cargas elétricas da molécula da enzima e, em especial do sitio catalítico, é ideal para a catálise. Enzimas: Atividade das Enzimas Fatores que afetam a atividade das enzimas Concentração do Substrato: Quanto maior for a concentração de substrato no meio, maior será a atividade enzimática, essa velocidade aumentará até atingir seu máximo, que é dado pela saturação de enzima no meio. Enzimas: Inibição Enzimática Algumas substâncias que podem inibir a atividade de enzimas, diminuindo-a ou eliminando-a totalmente Quando um inibidor interage com uma determinada região da enzima, chamado de Sitio Regulatório, provoca uma alteração na sua conformação e uma desativação do Sitio Catalítico A atividade enzimática, portanto, pode ser controlada, pelo organismo, através da liberação ou captação de inibidores. Enzimas: Inibição Enzimática A inibição enzimática pode ser: REVERSÍVEL ou IRREVERSÍVEL Inibição Enzimática Reversível: é baseada na presença ou não de competição entre o inibidor e o substrato pelo centro ativo da enzima. Inibidor Reversível Competitivo: compete com o substrato pelo centro ativo da enzima. Apresentam configuração semelhante ao substrato e por isso são capazes de se ligarem ao centro ativo da enzima. Eles produzem um complexo enzima-inibidor - semelhante ao complexo enzima-substrato. Substrato Inibidor Enzimas: Inibição Enzimática Inibição Enzimática Reversível: Inibidor Reversível Não Competitivo: Não tem semelhança estrutural com o substrato de reação que inibem. A sua inibição se dá pela sua ligação a radicais que não pertencem ao grupo ativo. Esta ligação vai alterar a estrutura da enzima e inviabiliza a sua catálise. Substrato Inibidor Enzimas: Inibição Enzimática Inibição Enzimática Irreversível: se ligam as enzimas levando a inativação definitiva desta. Estes inibidores são muito tóxicos para o organismo já que não são específicos, sendo capazes de inativar qualquer enzima. Inibidores Irreversíveis: O ácido cianídrico e grande número de pesticidas (como o DDT) intervêm na respiração. Estes inibidores são também designados venenos metabólicos. Enzimas: Regulação Enzimática Algumas enzimas podem ter suas atividadesreguladas, atuando assim como moduladoras do metabolismo celular Esta modulação é essencial na coordenação dos inúmeros processos metabólicos pela célula. Além dos já citados para modulação da atividade enzimática (variação da concentração do substrato, ou por inibição enzimática) existem 2 modelos de regulação enzimáticos mais conhecidos: Alostérica Covalente Enzimas: Regulação Enzimática Modulação Alostérica: Ocorre nas enzimas que possuem um sitio de modulação, ou alostérico, onde se liga de forma não covalente um modulador alostérico que pode ser positivo (ativa a enzima) ou negativo (inibe a enzima) Esta ligação induz a modificações conformacionais na estrutura espacial da enzima, modificando a afinidade desta para com os seus substratos. Enzimas: Regulação Enzimática Modulação Alostérica: Um modelo muito comum de regulação alostérica é a inibição por "FEEDBACK", onde o próprio produto da reação atua como modulador da enzima que a catalisa. Substrato Inicial Enzima 1 Enzima 2 Enzima 3 Enzima 4 Substratos Intermediários Inibição por Feedback Produto Final Enzimas: Regulação Enzimática Modulação Covalente: Ocorre quando há modificação da molécula da enzima, com conversão entre formas ativa/inativa. O processo ocorre principalmente por adição/remoção de grupamentos fosfato de resíduos específicos de serina image3.png image4.jpeg image5.png image6.jpeg image7.jpeg image8.jpeg image9.gif image10.jpeg image11.jpeg image12.png image13.gif image14.png image15.gif image16.png image17.png image18.png image19.png image20.png image21.jpeg image22.png image23.gif image24.emf CoenzimaAbreviaturaReação catalisada Origem Nicotinamida adenina dinucleotídio NAD + Oxi-reduçãoNiacina ou Vitamina B 3 Nicotinamida adenina dinucleotídio fosfato NADP + Oxi-redução Niacina ou Vitamina B 3 Flavina adenina dinucleotídio FADOxi-redução Riboflavina ou Vitamina B 2 image25.emf Coenzima Abrev. Reação catalisada Origem Coenzima A CoA-SH Transferência de grupo acil Pantotenato ou Vitamina B 5 Biotina Transferência de CO 2 Biotina ou Vitamina H Piridoxal fosfato PyF Transferência de grupo amino Piridoxina ou Vitamina B 6 Metilcobalamina Transferência de unidades de carbono Cobalamina ou Vitamina B 12 Tetrahidrofolato THF Transferência de unidades de carbono Ácido fólico Tiamina pirofosfato TPP Transferência de grupo aldeído Tiamina ou Vitamina B 1 image26.jpeg image27.gif image28.jpeg image29.jpeg image30.jpeg image31.png image32.jpeg image33.png image34.jpeg image35.jpeg image36.jpeg image37.png image38.jpeg image39.jpeg image40.jpeg image41.png image42.png