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21/03/2025 1 2025 Professor: Dr. Erik Saenz ENZIMAS Importância das enzimas • Diagnóstico de algumas doenças, “kits de diagnóstico”, • Processos biotecnológicos como: engenharia química, de alimentos, genética e bioquímica, cosméticos, estética, outros – Fabricação de alimentos e bebidas, – Amaciante de carnes, – Descoloração de tecidos de algodão, indústria do papel, outros • Hoje são reconhecidas a existência de mais de 2.000 diferentes proteínas enzimáticas com funções distintas 21/03/2025 2 • São proteínas especializadas que funcionam na aceleração de reações químicas (catalisadores biológicos) • Exceção: grupo de RNA catalítico (ribozimas) • Função: catalisadores biológicos. Importância da catálise: • Sem a catálise, a maioria das reações químicas nos sistemas biológicos seria muito lenta para fornecer produtos na proporção adequada para sustentar a vida. Definição: Estrutura tridimensional de uma ribozima • Catalisadores Biológicos: aceleram reações químicas sem serem consumidos e sem deslocar o equilíbrio. • C. Biológicos: - condições brandas - altamente específicos - atuam em baixas concentrações - fator de aceleração até aprox. 1014 vezes - podem ter as atividades controladas Exemplo de reação: 2 H2O2 → 2 H2O + O2 Condições Energia de ativação Veloc. Relativa Sem catalisador 18,0 kcal/mol 1 Platina 11,7 kcal/mol 2,77 x 104 Catalase 5,5 kcal/mol 6,51 x 108 21/03/2025 3 Nomenclatura: Geralmente, o nome da enzima é dado pelo substrato (S) da reação mais uma palavra terminada em ASE, sendo que esta palavra indica a sua função. Ex.: UREASE : Catálise da Ureia. DNA POLIMERASE : Polimerização do DNA LIPASE : Lipideos. GLICOGÊNIO SINTETASE : Síntese de Glicogênio. ENZIMAS SUFIXO: ASE Nomenclatura (regida pela IUB) (União Internacional de Bioquímica) • Nome trivial Ex: Quimotripsina, Tripsina e Urease • Nome sistemático: Nome do Substrato, Tipo de reação com sufixo ASE Ex: Lactato Desidrogenase • Numeração código com 4 dígitos Ex: Carboxipeptidase EC 3.4.17.1 EC - Comissão de Enzimas da IUB – 1° dígito – Tipo de reação (Hidrolase) – 2° dígito – Tipo de ligação (Peptidase) – 3° dígito - Característica do Sítio Ativo (c/ Zn2+) – 4° dígito – No. específico deste grupo 21/03/2025 4 Sítio Ativo • Centro Ativo ou Sítio Ativo: Região tridimensional responsável pela catálise. 1) Sítio de ligação 2) Sítio catalítico Sítio Ativo: 1) Sítio de ligação 2) Sítio catalítico Sítio de ligação: Região tridimensional que reconhece e liga o substrato Sítio catalítico Região tridimensional responsável pela transformação do substrato 21/03/2025 5 • Equação geral: Componentes de uma reação enzimática • Velocidade da reação a Energia de Ativação transforma o substrato. Variação do conteúdo energético durante a reação química E Energia de ativação é a energia mínima para que uma reação química possa ocorrer Aumenta em até 1017 vezes a velocidade da reação. As enzimas são catalisadores de reações químicas, diminuindo a energia de ativação dessa reação. Reação catalisada (enzima) Reação não-catalisada (sem enzima) 21/03/2025 6 Estado de transição • Estado de transição é o ponto da reação que possui a maior energia de ativação. • Neste ponto a reação está no ponto máximo da barreira energética que separa os reagentes e os produtos. • Onde a probabilidade de uma ligação química se rompa ou se forme seja muito elevada. • instável e tende a voltar ao estado inicial ou ser transformado em produto • Não confundir com os intermediários da reação : ES e EP. Interação Enzima - Substrato • Por muitos anos, a interação entre uma enzima e seu substrato foi descrita pelo modelo “chave- fechadura”. Entretanto, estudos demonstraram que esse mecanismo apresenta falhas, o que levou a um novo modelo: a teoria do encaixe induzido. 21/03/2025 7 Complexo E-S Não é o ideal, estabiliza o substrato. Interações ótimas só ocorrem no estado de transição. Chave-Fechadura , que considera que a enzima possui sitio ativo complementar ao substrato. Encaixe Induzido , enzima e o substrato sofrem conformação para o encaixe. 21/03/2025 8 Classificação: tipo de reação Óxido-redutases (óxido-redução) Transferases (transfere grupos) Hidrolases (hidrólise) Liases (adição de grupos a duplas ligações) Isomerases (rearranjo intramolecular) Ligases (condensa 2 moléculas) ENZIMAS Holoenzimas Apoenzima ( Aas ) Grupo Prostético Carboidratos Lipídeos Metais Coenzimas Outros. Porção Protéica (Apoenzima) G. Prostético • Enzimas simples: somente Aminoácidos • Holoenzima: Proteína conjugada (apoenzima + grupo prostético) Classificação: Composição química 21/03/2025 9 Coenzimas: - São cofatores orgânicos de baixo P.M. - Sofrem transformação durante a reação - Também denominados “Co-substratos” ou “Substratos Secundários” - As principais coenzimas são as vitaminas ou derivadas de vitaminas. - Vitaminas, substâncias orgânicas exógenas, necessárias em pequenas quantidades e de natureza química variável • Os cofactores ou cofatores são substâncias orgânicas (Coenzima) ou inorgânicas (Não coenzima ) necessárias ao funcionamento das enzimas. Elementos inorgânicos que servem como cofatores das enzimas Classificação: Regulação da atividade - Reguladas: a) Alostéricas (allo = diferente) b) Modificação covalente - Reversível: Fosfatação e Defosfatação - Irreversível: Ativação de proenzimas 21/03/2025 10 • Enzimas alostéricas • Allo = outro • Estereo = espaço • Outro sítio onde os moduladores ou efetores alostéricos se ligam • Moduladores: - Positivos (ativador) - Negativos (repressor ou inibidor) Classificação: Regulação da atividade Enzimas podem ter mais de um sítio ativo e vários sítios alostéricos • Subunidades: • C = Catalítica - Contém o sítio ativo • R = Regulatória - Contém os sítios alostéricos Enzimas alostéricas têm estrutura 4ária 21/03/2025 11 • Modificação covalente Reversível Ex: Acetilação e Deacetilação Fosfatação e Defosfatação Proteínas Kinases Proteínas Defosfatases • Modificação covalente irreversível Ex: Ativação das PROENZIMAS pancreáticas .. 21/03/2025 12 • A cinética enzimática estuda as reações químicas catalisadas pelas enzimas, em especial a velocidade de reação. • O estudo da cinética de uma enzima permite elucidar os pormenores do seu mecanismo catalítico, o seu papel no metabolismo, como é controlada a sua atividade na célula e como pode ser inibida a sua atividade por drogas ou venenos, ou potenciada por outro tipo de moléculas. Cinética enzimática • As duas propriedades cinéticas mais importantes de uma enzima são: o tempo que demora a saturar-se com um substrato em particular e o seu ponto máximo de saturação. • O conhecimento destas propriedades torna possível formular hipóteses sobre o comportamento de uma enzima no ambiente celular e prever como responderá frente a mudanças nessas condições. 21/03/2025 13 Importância prática das constantes cinéticas • O estudo da cinética enzimática é importante por duas razões principais: • Ajuda a explicar como as enzimas trabalham, e, permite prever o comportamento das enzimas em organismos vivos. • Por exemplo, o oxaloacetato que pode estar envolvido em várias vias e/ou reações metabólicas. • As constantes cinéticas Km e Vmax, são críticas na compreensão do modo de funcionamento conjunto das enzimas para controlar o metabolismo. • A concentração de substrato na qual ocorre a reação em um valor mediano da Vmax é chamada de Km , e serve para medir quão rapidamente a velocidade da reação aumenta com a concentração do substrato. • A Km é também uma medida da afinidade (tendência de se ligar) de uma enzima com seu substrato. Uma Km menor corresponde a uma maior afinidade pelo substrato. Uma Km maior corresponde a uma menor afinidade pelo substrato. • Diferente da Vmax , que depende da concentração enzimática, a Km é sempre a mesma para uma determinada enzima.21/03/2025 14 Fatores que alteram a velocidade de reações - temperatura; - pH; - concentração das enzimas; - concentração dos substratos; - presença de inibidores - Reversíveis - Irreversíveis - Presença de cofatores - Presença de agentes desnaturantes FATORES QUE AFETAM A VELOCIDADE DA REAÇÃO Temperatura e estabilidade molecular A temperatura ótima para a maioria das enzimas humanas está entre 35 e 40ºC. Acima de 40ºC, as enzimas desnaturam. Bactérias termófilas apresentam temperaturas ótimas acima de 70ºC. 21/03/2025 15 Efeito do pH Cadeias laterais ionizáveis ou não ionizáveis FATORES QUE AFETAM A VELOCIDADE DA REAÇÃO FATORES QUE AFETAM A VELOCIDADE DA REAÇÃO CONCENTRAÇÃO DO SUBSTRATO Unidade de enzima (U) - quantidade de enzima que catalisa a transformação de 1 µmol de substrato por min [ES] SÍTIOS DE LIGAÇÃO OCUPADOS 21/03/2025 16 INIBIÇÃO ENZIMÁTICA Inibidores enzimáticos são substâncias que interferem na atividade das enzimas, bloqueando o processo catalítico (Reduz a velocidade de uma reação enzimática). INIBIDORES REVERSÍVEIS IRREVERSÍVEIS COMPETITIVOS NÃO COMPETITIVOS INCOMPETITIVOS FATORES QUE AFETAM A VELOCIDADE DA REAÇÃO REVERSÍVEL: Inibidor Competitivo = complexo catalitícamente inativo Compostos com estrutura similar S (análogo) Uma substancia que compete diretamente com o substrato pelo sítio de ligação de uma enzima. No reage com o substrato 21/03/2025 17 REVERSÍVEL: Inibidor Não- Competitivo • Não tem competição pelo sitio ativo. • Enzima completamente inativada quando se liga o inibidor Ex.: Metais Pesados; mercúrio (Hg), Chumbo(Pb) que reagem com os grupos SH das proteínas Inibidor não-competitivo se liga reversivelmente, aleatória e independentemente em um sítio próprio. A enzima pode combinar-se simultaneamente com o substrato e o inibidor. REVERSÍVEL: Inibidor Incompetitivo (se liga ao Complexo E-S) Inibidor incompetitivo se liga reversivelmente, em um sítio próprio, ao complexo Enzima-Substrato. 21/03/2025 18 Ex: é o íon cianeto (CN-), que se une à enzima citocromo oxidase, enzima muito importante no processo de respiração celular, levando à sua inativação definitiva, a célula deixa de realizar a respiração e morre. Estes inibidores são muito tóxicos para o organismo já que não são específicos, sendo capazes de inativar qualquer enzima. O inibidor combinasse com o grupo funcional da enzima (centro ativo), inativando-a definitivamente. Forma-se uma ligação COVALENTE entre o Inibidor e a Enzima. INIBIÇÃO IRREVERSÍVEL BIBLIOGRAFIA BÁSICA: • • NELSON, DL; COX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger. 7 ed. Porto Alegre: Artmed/Panamericana Editora Ltda, 2018. • BERG, JM; TYMOCZKO, JL; STRYER, L. Bioquímica. 7 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2014. 1162 p. • VOET, D; Voet, JG. Bioquímica. 4 ed.Editora Artmed, Rio Grande do Sul-RS, Porto Alegre, 2013.1512p. • MARZZOCO, A.; TORRES, B.B. Bioquímica Básica. 4 ed. Editora Guanabara Koogan, Rio de Janeiro-RJ, 2015. 404p. • CAMPBELL, MK; FARREL, SO. Bioquímica. 2 ed. Editora Cengage Learning. 2015. 864p. • RODWELL, VW; BENDER, DA; BOTHAM, KM; KENNELLY, PJ, WEIL, PA. BIOQUÍMICA ILUSTRADA DE HARPER.; 30 ed. edição traduzida, Editora Artmed, 2016. • HARVEY, R.; FERRIER, D. Bioquímica Ilustrada. 7 ed. Artmed, 2018.