Tutorial Desenho de Primers

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Tutorial desenho de primers 
 
Desenho de primers: 
 
 
1. Entrar no banco NCBI: Nucleotide; 
2. Colocar o nome do gene na parte de busca; 
3. Na parte de “sequence information”colocar CDS (coding sequence)  get 
sequence; 
4. Copiar a sequencia CDS e colar no BLAST (Ncbi); 
5. Ir para o primer Blast; 
6. Ajusta os parâmetros de temperatura do primer: 
 
7. Em seguida: 
 
 
8. Em seguida: 
 
 
 
 
 
 
 
Advanced Parameters 
 
 
 
 
 
 
 
9. Em seguida: “get primers”; 
10. Após a escolha dos primers entrar no ncbi de novo, ir para o Blast e fzer 
um blast de nucleotídeos; 
11. Colocar a sequencia do primer forward e indicar o microorganismo; 
12. Checar a similaridade; 
13. Avaliar a formação de estrutura secundário