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Genética de Populações Curso de Biomedicina Disciplina Genética Humana e Médica Renata Canalle NUSSBAUM, R. L.; MCINNES, R. R.; WILLARD, H. F. Thompson Genética médica. Guanabara Koogan, 2008 LEWIS, R. Genética Humana: conceitos e aplicações. Guanabara Koogan, 2004 OTTO, P.G.; OTTO, P.A.; FROTA-PESSOA, O. Genética Humana e Clínica. Roca, 2004. Até agora consideramos as características genéticas pela perspectiva do indivíduo e da família Algumas, como a síndrome de Down, são características raras que afetam pessoas no mundo Outras, como a Fibrose Cística, são mais prevalentes em algumas populações do que em outras Considerações gerais Nesta aula, consideraremos as características genéticas por uma perspectiva diferente, a da população Embora os genes atuem em indivíduos e tenham um fluxo por meio das famílias, as forças que determinam as frequências gênicas atuam em nível de populações Genética médica Paciente é um reflexo da família e da população à qual pertence Envolvida não só em fazer o diagnóstico correto Mas também em determinar os genótipos de outros membros familiares O estudo dos fatores que determinam frequências gênicas pode ter importantes implicações para a medicina (porque algumas populações se destacam em distúrbios genéticos particulares e podem estar livres de outros?) • Avaliar os riscos de recorrência Considerações gerais Considerações gerais A característica dominante nem sempre é a mais frequente em uma população: Depende da frequência do alelo que a determina; Exemplo: a doença de Huntington é autossômica dominante, enquanto o fenótipo normal é recessivo. O que é mais frequente: indivíduos afetados ou normais? indivíduos normais mais frequente, pois a frequência do alelo para a doença é muito menor. A frequência de uma característica em uma determinada população (frequência fenotípica) depende da frequência do respectivo alelo (frequência alélica) Considerações gerais Genética de populações - Estudo da distribuição dos genes (variação genética) nas populações e de como as frequências dos genes e genótipos são mantidas ou alteradas de geração a geração Fatores genéticos Fatores ambientais e sociais • Mutação • Reprodução • Seleção • Deriva genética (oscilação genética) • Migração (fluxo gênico) - Dentro de uma população completa pode haver muitos alelos diferentes em um locus, mas cada pessoa individualmente tem apenas dois alelos. - O pool gênico para o locus A consiste em todos os alelos para aquele locus na população. A frequência gênica do alelo A1 é a proporção de todos os alelos A no pool que são A1, sendo tbem chamado frequência alélica. Considerações gerais Frequência gênica: A proporção de cópias de um gene em uma população para qual um alelo contribui; Ou seja: a probabilidade de encontrar esse alelo quando um gene é tomado aleatoriamente na população Frequência genotípica: A proporção de cópias de um genótipo em uma população é um grupo de indivíduos da mesma espécie que vive na mesma área geográfica e cruzam entre si População: Conjunto gênico ou pool gênico: é constituído por todos os alelos contidos na totalidade dos indivíduos que se cruzam de uma população, em um dado momento Considerações gerais Há variação entre indivíduos em uma população. Estas diferenças são passadas de pais para filhos. Um número maior de filhos nasce comparado àqueles que sobrevivem e reproduzem. Algumas variantes têm maior sucesso na sobrevida e/ou reprodução que outras. Charles Darwin (1959) Origem e transmissão da variação ? Considerações gerais Redescobrimento dos trabalhos de Mendel (1900) Hugo de Vries – Holanda Carl Correns – Alemanha Eric von Tschermak - Áustria As características são determinadas por genes, que se segregam em alelos diferentes, e os genes são transmitidos para a prole em gametas produzidos por seus genitores S. Wright R. A. Fisher J. B. S. Haldane Considerações gerais Genética de populações Aplicações • Interpretação dos fatores evolutivos • Doenças e defeitos hereditários (diagnóstico) • Frequência de portadores de características recessivas • Triagem populacional de doenças genéticas • Casamentos consanguíneos • Cálculo de risco em aconselhamento genético • Teste de paternidade e prova forense Na prática de genética médica, a genética de populações fornece o conhecimento acerca dos genes das diferentes doenças que são comuns em diferentes populações, informação necessária para diagnóstico clínico e consulta genética e determinação das frequências do alelo requeridas para cálculos de risco Frequências gênicas e genotípicas A prevalência de doenças genéticas pode variar consideravelmente entre populações Fibrose cística • 1 / 2.500 – entre caucasianos • 1 / 90.000 – entre asiáticos Frequências gênicas e genotípicas A prevalência de doenças genéticas pode variar consideravelmente entre populações Fibrose cística • 1 / 2.500 – entre caucasianos • 1 / 90.000 – entre asiáticos Anemia Falciforme • 1 / 600 – entre afro-americanos • Quase nunca observada entre descendentes do leste europeu Fenilcetonúria • 1 / 16.000 – entre chineses 1 / 2.600 – entre turcos • 1 / 119.000 – entre japoneses 1 / 10.000 – entre caucasianos Frequências gênicas e genotípicas Nos ajudam a medir e compreender a variação populacional nos genes de doenças LMLM = 64 /200 = 0,32 LMLN = 120 /200 = 0,60 LNLN = 16 /200 = 0,08 Alelo Frequência gênica LM 0,62 LN 0,38 Total 1 LM = (64 x 2) + 120 / 400 = 0,62 LN = (16 x 2) + 120 / 400 = 0,38 Genótipo Nº de pessoas Frequência genotípica LMLM 64 0,32 LMLN 120 0,60 LNLN 16 0,08 Total 200 1 Frequências gênicas e genotípicas Mourant (1954): Frequência de MN em 2 populações de esquimós Gene LM LN Groenlândia 0,913 0,17 Islândia 0,57 0,43 Grupo sanguíneo Nº de pessoas LMLM LMLN LNLN Groenlândia 0,835 0,156 0,009 569 Islândia 0,312 0,515 0,173 747 Frequências gênicas e genotípicas Mourant (1954): Frequência de MN em 2 populações de esquimós Será que se forem colhidas novas amostras hoje, os dados seriam os mesmos ? Sim, seriam Se não houve mutação Nem migração Nem Seleção Se a população for infinitamente grande E for panmítica Quando não está ocorrendo evolução A genética da resistência ao vírus da AIDS Prevalência de infecção pelo HIV em adultos Europeus: menor prevalência de HIV → polimorfismo do gene CCR5 (deleção) selecionado pela peste bubônica ou varíola A genética da resistência ao vírus da AIDS Deleção ΔCCR5: terminação incorreta e prematura da proteína – resistência ao HIV Gene CCR5: codifica um receptor de citocina na superfície celular – ponto de entrada para HIV A genética da resistência ao vírus da AIDS Deleção ΔCCR5 em europeus Alelo Frequência gênica ou alélica CCR5 0,906 ΔCCR5 0,094 Total 1 Genótipo Nº de pessoas Frequência genotípica observada CCR5/CCR5 647 0,821 CCR5/ΔCCR5 134 0,168 ΔCCR5/ ΔCCR5 7 0,011 Total 788 1 • Para loci autossômicos, o tamanho do pool genético em um locus é duas vezes o número de indivíduos na população (2 x 647) + (1 x 134) (788 x 2) ----------------------------- = 0,906 Frequência observada do alelo Pool de genes = todos os alelos em um locus em uma população; coleção de gametas A genética da resistência ao vírus da AIDS Deleção ΔCCR5 em europeus Alelo Frequência gênica CCR5 0,906 ΔCCR5 0,094 Total 1 Se soubermos as frequências alélicas podemos calcular osgenótipos ? Sim, utilizando as regras de probabilidade Podemos usar uma amostra de indivíduos com genótipo conhecido em uma população para obter estimativas das frequências de alelos. A Lei de Hardy-Weinberg (1908) Godfrey Hardy (matemático inglês) Wilhelm Weinberg (médico alemão) “Em uma população em equilíbrio as frequências gênicas e genotípicas permanecem constantes ao longo das gerações” População em equilíbrio ? Será que existem populações em equilíbrio ? Então para que serve essa lei ? A lei de Hardy-Weinberg serve como hipótese nula quando se estuda a composição genética de uma população Fundamento da genética de populações As características dominantes devem aumentar de prevalência em uma população, e as características recessivas diminuir? A Lei de Hardy-Weinberg Godfrey Hardy (matemático inglês) Wilhelm Weinberg (médico alemão) “Em uma população em equilíbrio as frequências gênicas e genotípicas permanecem constantes ao longo das gerações” Se não houve mutação Nem migração Nem Seleção Se a população for infinitamente grande E for panmítica “Em uma população infinita, onde os cruzamentos ocorrem ao acaso e sobre a qual não há atuação de fatores evolutivos, tais como mutação, seleção natural, deriva genética e fluxo gênico, as frequências alélicas e genotípicas permanecem constantes ao longo das gerações” “Em uma população infinita, onde os cruzamentos ocorrem ao acaso e sobre a qual não há atuação de fatores evolutivos, tais como mutação, seleção natural, deriva genética e fluxo gênico, as frequências alélicas e genotípicas permanecem constantes ao longo das gerações” A Lei de Hardy-Weinberg Godfrey Hardy Wilhelm Weinberg 2. Frmax Aa = 50 % ou 0,5 Fr AA = aa = 25 % ou 0,25 Uma população em equilíbrio: as freq. genotípicas são determinadas pelas freq. alélicas 3. Quando a frequencia de um alelo é baixa , os homozigotos para esse alelo serão raros, e a maioria das cópias de um alelo raro estará presente nos heterozigotos 1. o equilíbrio genético é alcançado após uma única geração de acasalamentos ao acaso (embora com uma nova freq. gênica) (p + q)2 = p2 + 2pq + q2 Qual a importância do Teorema de Hardy-Weinberg? 1. Ele demonstra que traços dominantes não aumentam necessariamente de uma geração para outra. 2. Ele demonstra que a variabilidade genética pode ser mantida em uma população, desde que uma vez estabelecida uma população ideal, as frequências alélicas permaneçam inalteradas. 3. Descrever a composição populacional em termos de frequências alélicas. 4. se supormos que o teorema de Hardy-Weinberg está certo, então, conhecendo apenas a frequência de um genótipo, pode-se calcular as frequências de todos os outros genótipos (ex.: 9% autossômica recessiva na população – alelo mutado 30% / alelo normal 70%). 5. Os riscos do portador em populações específicas pode ser determinado aplicando-se a incidência da classe homozigota recessiva à equação de H-W. 6. Mostrando que populações ideais não evoluem, pode-se usar o Teorema de Hardy-Weinberg para identificar forças que façam a população evoluir (ex.: migração, seleção natural, mutação, deriva genética, etc) A Lei de Hardy-Weinberg População masculina P o p u la ç ã o f e m in in a Alelo Frequência gênica CCR5 0,906 ΔCCR5 0,094 Total 1 Se soubermos as frequências alélicas podemos calcular os genótipos ? Genótipo Lei de HW Nº de pessoas Frequência genotípica CCR5/CCR5 p2 CCR5/ΔCCR5 2pq ΔCCR5/ ΔCCR5 q2 Total 788 1 (p + q)2 = p2 + 2pq + q2 = 1 0,821 0,170 0,009 A Lei de Hardy-Weinberg Se soubermos as frequências alélicas podemos calcular os genótipos ? Genótipo Lei de HW Nº de pessoas Frequência genotípica CCR5/CCR5 p2 0,821 CCR5/ΔCCR5 2pq 0,170 ΔCCR5/ ΔCCR5 q2 0,009 Total 788 1 Genótipo Nº de pessoas Frequência genotípica CCR5/CCR5 647 0,821 CCR5/ΔCCR5 134 0,168 ΔCCR5/ ΔCCR5 7 0,011 Total 788 1 646,819 134,218 7,092 Genes codominantes A Lei de Hardy-Weinberg Alelo Frequência gênica LM 0,62 LN 0,38 Total 1 Genótipo Nº de pessoas Frequência genotípica LMLM 64 0,32 LMLN 120 0,60 LNLN 16 0,08 Total 200 1 p2 + 2pq + q2 = 1 p + q = 1 Genes codominantes A Lei de Hardy-Weinberg Alelo Frequência gênica LM 0,62 LN 0,38 Total 1 Genótipo Nº de pessoas Frequência genotípica LMLM 64 0,32 LMLN 120 0,60 LNLN 16 0,08 Total 200 1 p2 : 2pq : q2 Genótipo Nº de pessoas Esp Frequência genotípica Esp LMLM 0,3844 LMLN 0,4712 LNLN 0,1444 Total 200 1 76,88 94,24 28,88 A Lei de Hardy-Weinberg Genótipo Nº de pessoas Obs Frequência genotípica Obs LMLM 64 0,32 LMLN 120 0,60 LNLN 16 0,08 Total 200 1 Nº de pessoas Esp Frequência genotípica Esp 76,88 0,3844 94,24 0,4712 28,88 0,1444 200 1 X2 = (64 – 76,88)2 / 76,88 + (120 – 94,24)2 / 94,24 + (16 – 28,88)2 / 28,88 X2 = 14,9433 X2 = 14,9433 > 3,841 Grau de liberdade é 3 – 2 = 1; A amostragem da tabela reflete o equilíbrio de Hardy-Weinberg? Deriva genética? Erro de amostragem? A Lei de Hardy-Weinberg Em geral, os graus de liberdade para um teste de qui-quadrado de EHW são iguais ao número de classes genotípicas esperadas menos o número de alelos associados. Os números observados não são tão livres para variar. Grau de liberdade é 3 – 2 = 1; Frequências Genotípicas Observadas e Esperadas em 4 Populações Humanas para o Sistema MN Observado Frequência Gênica Esperada Amostra Grupo Sangüíneo N % N % Norte-Americano M 125 31,7 p=0,562 124,5 31,6 MN 193 49,0 q=0,438 193,8 49,2 N 76 19,3 75,7 19,2 Total 394 100,0 394,0 100,0 Holandeses M 52 27,1 p=0,500 48,0 25,0 MN 88 45,8 q=0,500 96,0 50,0 N 52 27,1 48,0 25,0 Total 192 100,0 192,0 100,0 Ingleses M 363 28,4 p=0,532 362,0 28,0 MN 634 49,6 q=0,468 637,0 49,0 N 282 22,0 280,0 21,0 Total 1279 100,0 1279,0 100,0 Brasileiros M 30 30,0 p=0,550 30,25 30,25 MN 50 50,0 q=0,450 49,50 49,50 N 20 20,0 20,25 20,25 Total 100 100,0 100,00 100,00 • Grupos sanguíneos: a viabilidade é igual para qualquer indivíduo da população, independentemente do seu genótipo, ou seja, não ocorre seleção. • Também não ocorre: mutação, migração, nem casamento preferencial. Suponhamos que numa determinada região exista uma população de 600 indivíduos, todos pertencentes ao grupo sanguíneo NN. A essa região chegam de repente 400 indivíduos, todos do grupo MM. Imediatamente esses imigrantes se interam à população e começam os casamentos ao acaso. Qual será a composição genotípica da próxima geração? Amostra = 1000 MM = 0,40 NN = 0,60 frequência de cruzamentos MM x MM é 0,40 x 0,40 = 0,16 frequência de cruzamentos MM x NN é 2 x 0,40 x 0,60 = 0,48 frequência de cruzamentos NN x NN é 0,60 x 0,60 = 0,36 Frequência da geração 1 (filhos): MM 0,16 MN 0,48 NN 0,36 População inicial: MM 0,40 MN 0,00 NN 0,60 Já apresenta o equilíbrio de Hardy-Weinberg Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Estimativa da frequência de genes recessivos Consulta genética - Ex.: Fibrose Cística Características clínicas • Doença pulmonar crônica • Deficiência de enzimas digestivas do pâncreas, problemas intestinais • Obstrução dos pulmões por um muco espesso • Sobrevida média de 26 – 29 anos • Homens geralmente inférteis; mulheres férteis, mas com reprodução limitada • Autossômica recessiva Considerar os alelos em uma população, o pool de genes, é mais preciso do que avaliarfenótipos. pois o mesmo fenótipo pode resultar de genótipos diferentes Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Consulta genética - Ex.: Fibrose Cística Frequência de 1/2.500 (na Europa e EUA) (mesmo apresentando heterogeneidade alélica) q2 = 1/2.500 q = 1/50 (√q2) q = 0,02 p = 0,98 2pq = 2 x (0,02 x 0,98) = 0,04 ou 4% ou freq. de portadores = 2q, pois como o alelo causador da doença é raro a freq. p = 1 4% deve ser portador na população caucasiana cerca de 1 em 25 •Usada na incidência de doenças genéticas para se obter os riscos de serem portadores •Podemos prever as frequências alélicas a partir das frequências genotípicas? •E as condições para o EHW? Frequência baixa nas populações finlandesa, asiática e africana Naturalmente, quanto maior for a freq. do gene na população, maior será a proporção de casamentos entre heterozigotos e, assim, a incidência de afetados na população. Dominância completa (quando não se conhece freq. de heterozigotos) Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Consulta genética - Ex.: Fibrose Cística O teorema de HW também é aplicado em teste de paternidade e prova forense (uso de marcadores, polimorfismos RFLPs, que estão em equilíbrio de HW, e portanto não influenciam a escolha do parceiro e não estão sob seleção) • Se não houver FC na família, qual o risco de uma pessoa ter um filho afetado? • Pela estatística da população, o risco é relativamente baixo - Chance de cada genitor potencial ser portador: 1 em 25 - Ambos → 1/25 x 1/25 = 1 em 625 - Filho de portadores → 1 em 4 ou 25% Risco de que duas pessoas não aparentadas caucasianas sem história familiar de FC tenham um filho afetado é: 1/4 x 1/25 x 1/25 = 1 em 2.500 Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg DNA fingerprints: cada repetição usada em um fingerprint de DNA é considerada um alelo Homozigotos para cada repetição: p2 e q2 Heterozigotos para cada repetição: 2pq Em um julgamento, o promotor conclui “A chance de que o fingerprint de DNA das células da evidência corresponda ao sangue do acusado por acaso é de 1 em 738 trilhões”. (Para isso é preciso considerar a população em estudo e as frequências alélicas das regiões de estudo nesta população – bancos de dados étnicos mais restritivos). Resultado é a probabilidade de que esta combinação particular de sequências de DNA ocorra na população (e em equilíbrio de HW) se uma combinação de alelos é muito rara na população de onde vem o suspeito, e se é encontrada tanto no DNA do suspeito quanto na evidência da cena do crime, a culpa do suspeito parece se altamente provável Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg DNA fingerprints: cada repetição usada em um fingerprint de DNA é considerada um alelo Uso de fingerprints de DNA: a equação de Hardy- Weinberg e a regra do produto são usadas para obter as estatísticas que apóiam um fingerprint de DNA. •Southern blot •PCR •PCR-RFLP •Sequenciamento •DNA nuclear •DNA mitocondrial •SNPs ou VNTRs/STRs - 13 mesmos marcadores por acaso é 1 em 250 trilhões - Identificação das vítimas do World Trade Center (11/09/2001) • STRs – estão em EHW; não sofrem seleção • Frequências alélicas - Bancos de dados/ grupos étnicos Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Frequência de genes e genótipos ligados ao X Sexo Genótipo Fenótipo Incidência Homem X+ Normal p = 0,92 Xcb Daltônico q = 0,08 ou 8% Mulher X+/X+ Normal (homozigoto) p2 = (0,92)2 = 0,8464 X+/Xcb Normal (heterozigoto) 2pq = 2(0,92)(0,08) = 0,1472 Normal (total) p2 + 2pq = 0,9936 Xcb/Xcb Daltônica q2 = (0,08)2 = 0,0064 ou 0,64% (p + q)2 = p2 + 2pq + q2 somente para mulheres Daltonismo vermelho-verde (traço não deletério; não são objetos de seleção) p + q somente para homens (freq. alélica é a freq. fenotípica)Homem hemizigose Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Frequência de genes e genótipos ligados ao X (p + q)2 = p2 + 2pq + q2 somente para mulheres Daltonismo vermelho-verde (traço não deletério; não são objetos de seleção) p + q somente para homens Em uma amostra de 200 homens, 24 têm daltonismo ligado ao X 24/200 = 0,12 → q = 0,12 1-q = 1 - 0,12 = 0,88 → p = 0,88 Mulheres: p2 0,77 2pq 0,21 q2 0,014 ou 1,4% ou 12% 21% são portadoras com chance de 50% de ter um filho daltônico Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Frequência de genes e genótipos com alelos múltiplos (p + q + r)2 = p2 + q2 + r2 + 2pq + 2qr + 2pr Sistema sanguíneo ABO (traço não deletério; não são objetos de seleção); expressão multinominal: três alelos IA, IB e i trinômio p + q + r = 1 Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Frequência de genes e genótipos com alelos múltiplos Determinando-se os grupos sanguíneos do sistema ABO numa amostragem de 1.200 indivíduos de nacionalidade grega, verificou-se que 40% grupo A 14% grupo B 0,4% grupo AB 42% grupo O (p + q + r)2 = p2 + q2 + r2 + 2pq + 2qr + 2pr frequência do grupo A = p2 + 2pr = 0,40 ou 40% frequência do grupo B = q2 + 2qr = 0,14 ou 14% frequência do grupo AB = 2pq = 0,04 ou 4% Frequência do grupo O = r2 = 0,42 ou 42% Frequência de indivíduos pertencentes aos grupos A e O é p2 + 2pr + r2 = (p + r)2 = 0,40 + 0,42 = 0,82 raiz quadrada de 0,82 = 0,90 = p + r como p + q + r = 1 → q = 1 – (p + r) = 1 – 0,90 = 0,10 Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Frequência de genes e genótipos com alelos múltiplos frequência do grupo A = p2 + 2pr = 0,40 ou 40% frequência do grupo B = q2 + 2qr = 0,14 ou 14% frequência do grupo AB = 2pq = 0,04 ou 4% Frequência do grupo O = r2 = 0,42 ou 42% Frequência de indivíduos pertencentes aos grupos B e O é q2 + 2qr + r2 = (q + r)2 = 0,14 + 0,42 = 0,56 raiz quadrada de 0,56 = 0,75 = q + r como p + q + r = 1 → p = 1 – (q + r) = 1 – 0,75 = 0,25 Frequência r do gene O p + q + r = 1 → r = 1 – (p + q) = 1 - 0,35 = 0,65 ou raiz quadrada de 0,42 = 0,65 Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Frequência de genes e genótipos com alelos múltiplos Uso de frequências alélicas em Consulta Genética Consultores genéticos usam dados de freq. alélica em conjunto com análise de heredogramas para calcular o risco de que uma pessoa desenvolva uma doença genética Análise de heredogramas usando dados populacionais para calcular o risco de doença de Tay-Sachs em uma criança. Aplicação da Lei de Hardy-Weinberg Doença de Tay-Sachs: •Autossômica recessiva (1:3.600) •Frequência alélica de 0,017 q = 0,017 (1/60) •Portador 2pq = 2 (0,983) (0,017) Portador = 0,033 ou 1/30 = 0,006 0,006 é 20x maior o risco do que na população (q2 = (0,017)2 = 0,0003) Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à reprodução aleatória Estratificação Casamento preferencial Consanguinidade Exceções à constância das frequências alélicas Mutação e seleção Seleção contra mutações autossômicas dominantes Seleção contra mutações autossômicas recessivas Seleção contra mutações recessivas ligadas ao X Seleção a favor de heterozigotos Migração (Fluxo gênico) Deriva genética (oscilação gênica) Podem causar grandes desvios; alteram apenas frequências genotípicas Causam menores desvios Pode causar grandes desvios Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à reprodução aleatória Distúrbio População Incidência (q2) Freqüência gênica Freqüência heterozigotos Anemia falciforme Afro-americanos Hispano-americanos 1 em 400 1 em 40.000 0,05 0,005 1 em 11 1 em 101 Fenilcetonúria Escócia Finlândia Japão 1 em 5.300 1 em 200.000 1 em 109.000 0,014 0,002 0,003 1 em 22 1 em 30 1 em 250 Tay-Sachs Judeus Ashkenazidos EUA Caucasianos não-Ashkenazi 1 em 3.900 1 em 112.000 0,016 0,003 1 em 30 1 em 170 Estratificação • Subgrupos geneticamente distintos (separados) • Ex.: Afro-americanos X Caucasianos nos EUA • Resultado: aumenta homozigotos; deficiência de heterozigotos Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à reprodução aleatória • Aumenta homozigotos • Escolha de um parceiro porque ele possui uma determinada característica • Pessoa tende a escolher uma outra que lhe seja similar • Ex.: Mesma língua, inteligência, estatura, cor da pele, talento musical, habilidade atlética Consanguinidade • Aumenta homozigotos • Ex.: Autofecundação, reduz a proporção de heterozigotos à metade a cada geração Casamento preferencial Muda as frequências genotípicas, mas não muda as frequências alélicas Mutação e seleção Variação resulta de mutação Mutação é evento raro: 10-5 Indivíduos mais adaptados, em um determinado ambiente, são aqueles que possuem características que são vantajosas para sua sobrevivência e reprodução (seleção natural) Valor adaptativo Capacidade do genótipo de doar genes para geração seguinte (w) Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à constância das frequências alélicas s = desvio da adaptabilidade, chamado coeficiente de seleção 0,25 s = 1 → aa genótipo letal w = 0 w = 1 - s Mutação e seleção Variação resulta de mutação Mutação é evento raro: 10-5 /locus/geração Ocorre com taxa constante m por geração A taxa de mutação m é expressa em frequência de gametas que mutaram por geração Atuação da seleção Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à constância das frequências alélicas Alteração nas freq. gênicas, levando-se em conta somente o efeito das mutações, é um processo extremamente lento Em média, a cada geração há um gameta mutado para 100.000 gametas normais 94 mil nascimento - 10 anões acondroplásicos - 8 filhos de pais normais - m gene = 8/94.000 = 1/12.000 - m por gameta = 1.24.000 Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à constância das frequências alélicas Seleção contra mutações autossômicas dominantes • Alelos totalmente expostos à seleção • Efeitos da seleção e da mutação são mais óbvios • Implicação para consulta genética Se uma doença dominante for deletéria mas não letal, as pessoas afetadas poderão se reproduzir, mas contribuirão com menos que o número médio de prole para a geração seguinte w = 1 - s Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à constância das frequências alélicas Seleção contra mutações autossômicas dominantes • Alelos totalmente expostos à seleção • Efeitos da seleção e da mutação são mais óbvios • Implicação para consulta genética Anões têm 1/5 de filhos estatura normal na população (média) – 20% da capacidade reprodutiva das pessoas normais w = 0,20 s = 0,80 Na geração seguinte, apenas 20% dos alelos para o distúrbio serão passados mutações novas Equilíbrio (freq. de alelos estáveis) – seleção x mutação nova Neurofibromatose I e DMD – 1 x 10-4 Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à constância das frequências alélicas Seleção contra mutações autossômicas recessivas • Efeito menor na frequência populacional pequena proporção dos genes nos homozigotos • Mesmo que w = 0, levaria muitas gerações para reduzir significativamente a frequência gênica • Os alelos recessivos são introduzidos por mutação ou migração e mantidos nos heterozigotos, portanto todas as populações têm alguns alelos que seriam prejudiciais em homozigose (coleção de tais alelos deletérios em uma população → carga genética Logo, desde que os casamentos sejam aleatórios, os genótipos em doenças autossômicas recessivas podem ser consideradas como estando em equilíbrio de Hardy-Weinberg Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à constância das frequências alélicas Seleção a favor de heterozigotos – “vantagem do heterozigoto” • Fibrose cística 5% em caucasianos • Anemia falciforme 9% a 10% em afro-americanos 45 a 50% portadores na África Como podemos explicar os distúrbios nos quais o alelo mutante atinge frequências bem altas? Frequências de portadores Explicações • Ação de deriva genética (efeito do fundador) • Alta taxa de mutação • Aumento da adaptabilidade dos heterozigotos em determinados ambientes (anemia falciforme e malária) Polimorfismo genético balanceado Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à constância das frequências alélicas Seleção a favor de heterozigotos – “vantagem do heterozigoto” O efeito é balanceado porque o efeito protetor da condição não herdada contrabalança o efeito negativo do alelo deletério, mantendo sua frequência na população Malária: força seletiva que pode manter os alelos de globina mutantes na população Polimorfismo balanceado: variante genética mantida a uma frequência relativamente alta em uma população devido à seleção contra o homozigoto para o tipo selvagem ou sequência variante, com a adaptabilidade sendo mais alta nos heterozigotos (vantagem do heterozigoto) Quando as frequências de dois alelos para essa característica estão em equilíbrio Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Exceções à constância das frequências alélicas Seleção a favor de heterozigotos – “vantagem do heterozigoto” O efeito é balanceado porque o efeito protetor da condição não herdada contrabalança o efeito negativo do alelo deletério, mantendo sua frequência na população Malária: força seletiva que pode manter os alelos de globina mutantes na população Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Deriva genética Flutuação de frequência gênica aleatória que opera em um pequeno pool de genes contido em uma população pequena (mortes acidentais, catástrofes ambientais, barreiras geográficas) Geração I Geração II Geração III p(A) = 0,6 q(a) = 0,4 p(A) = 0,8 q(a) = 0,2 p(A) = 1,0 q(a) = 0 Deriva genética pode levar a fixação acidental de um alelo e a exclusão de algum outro Quando um pequeno grupo de indivíduos é separado de uma população grande, ou só se reproduz entre si dentro de uma população maior (amostragem ao acaso do total) Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Deriva genética Alta incidência da doença de Huntington na região do Lago Maracaibo, Venezuela Aproximadamente 100 afetados e 900 com risco de 50% de transmissão Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Deriva genética Alta incidência da doença de Huntington na região do Lago Maracaibo, Venezuela Aproximadamente 100 afetados e 900 com risco de 50% de transmissão Pequena amostra funda nova população População original Nova População Efeito do fundador maior freq. do alelo raro Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Deriva genética Efeito fundador Old Older Amish, uma religião isolada de linhagem européia, colonizou a Pensilvânia A incidência da síndrome de Ellis-van Creveld, em algumas comunidades, mas não em outras, é uma ilustração do efeito do fundador Nanismo de membros curtos, dedos curtos, polidactilia, unhas e dentes anormais e alta incidência de defeitos cardíacos congênitos Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Fluxo gênico Migração Lenta difusão de genes através de uma barreira Atua para unificar as frequências gênicas entre as populações, impedindo que diferentes populaçõesde uma espécie venham a divergir uma da outra A migração diminui as diferenças genéticas entre as populações e aumenta a variação genética dentro das populações Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Fluxo gênico Migração Lenta difusão de genes através de uma barreira Efeitos da mistura de populações sobre frequências alélicas e genotípicas. Misturar de modo aleatório populações reprodutivas temporariamente perturba o equilíbrio de HW. A migração de indivíduos de uma população para outras também causa perturbação temporária no equilíbrio de HW. Entretanto, se uma população que recebeu imigrantes se reproduz aleatoriamente por uma geração, o EHW será restaurado Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Fluxo gênico Migração Lenta difusão de genes através de uma barreira Ex. frequência de determinados alelos para PKU migração dos Celtas (origem céltica) PKU na Irlanda = 1/4.500 PKU no Japão = 1/109.000 Fatores que perturbam o equilíbrio de Hardy-Weinberg Fluxo gênico Migração Lenta difusão de genes através de uma barreira Ex. frequência de determinados alelos para deficiência de galactocinase (catarata) migração dos Ciganos Vlax Roma na Bulgária (800.000 ciganos) Deficiência de galactocinase na Europa: este distúrbio autossômico recessivo que causa cegueira varia em prevalência através da Europa. Fórmulas matemáticas que estudam o problema do fluxo gênico, são usadas para se conhecer a composição étnica (racial) de uma população.
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