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Núcleo e nucléolo Daniel Ardisson-Araújo DNA RNA Proteína Núcleo Estrutura: Cromatina • Cromatina transcricionalmente ativa é menos condensada - eucromatina. • A heterocromatina é altamente condensada e transcricionalmente inativa. • Os cromossomos mitóticos são formados por cromatina no seu estado mais condensado Cromossomos • Estruturas dos cromossomos: linear • 1 centrômero • 2 telômeros • várias origens de replicação Cromatina cromatina • As histonas são as principais proteínas estruturais dos cromossomos eucarióticos • existem por volta de 60 milhões de moléculas por núcleo (outra proteína normalmente é de 10 mil) . Rica em aminoácidos básicos (lisina e arginina) • Formam a partícula unitária da cromatina: o nucleossomo • tipos H2A, H2B, H3 e H4 (histonas nucleossomais) entre 102 a 135 a.a. • existem 20 cópias de cada um genes de histonas no genoma Os nucleossomos são empacotados com a ajuda da histona H1 (220a.a.) para a formação de estruturas regulares com grau de espiralização maior. Nucleossomos Replicação do DNA enzimas/proteínas 1. DNA pol 2. Helicase 3. Primase 4. ssDBP 5. Ligase 6. Topoisomerase II Fita retardada Fragmentos de Okazaki 1ª limitação de DNA polimerase Replicação RNA Primase 2ª limitação de DNA polimerase Topoisomerase Produz quebras numa cadeia do DNA e permite o giro da cadeia quebrada sobre a cadeia intacta. A enzima restaura a ligação fosfodiéster e sela a quebra. Topoisomerase pode relaxar superespiralamentos no DNA. A DNA polimerase é autocorretiva Mecanismo de verificação (Proofreading) DNA-polimerase possui •Uma atividade de polimerização 5’3’ •Uma atividade de exonuclease 3’5’ Telômeros x Telomerase Telômeros X Telomerase Telomerase • rico em repetições das bases GGGTTA, humano • adicionados ao final do cromossomo pela enzima telomerase. Telomerase Transcrição Visão geral dos processos biológicos: DNA ProteínaRNA1 2 3 1. Transcrição (RNA polimerase) 2. Tradução (Ribossomos) 3. Replicação ou duplicação (DNA polimerase) 4. Respiração (Mitocôndria) Para o desempenho de cada processo é necessário ENERGIA! Açúcares Lipídeos ENERGIA (ATP) 4 Dogma central da biologia molecular Algumas descobertas posteriores não coincidiram com este Dogma: 1. O RNA pode sofrer replicação em alguns vírus e plantas 2. O RNA viral, através de uma enzima denominada transcriptase reversa, pode ser transcrito em DNA 3. ODNA pode diretamente traduzir proteínas específicas sem passar pelo processo de transcrição, porém o processo ainda não está bem claro Genes celulares (perpetuação e expressão) o dogma é aplicado! Do DNA a proteína 1.Eucariotos 2.Procariotos A seqüência de nucleotídeos de um gene determina a seqüência de AAs de uma proteína RNA deriva de informações permanentemente ARMAZENADAS no DNA essas informações são processadas durante a TRANSCRIÇÃO por meio de um sistema enzimático mRNA codifica sequencias de aminoácidos que compõe um (euc.) ou mais (proc.) polipeptídeos tRNA lê a informação codificada pelo mRNA e leva consigo o aminoácido adequado. rRNA constituinte dos ribossomos Como a célula sabe qual gene expressar (qual proteína produzir) se nós temos mais de 20.000 genes no núcleo de nossas células? Onde iniciar a transcrição? Qual das duas fitas usar? E sendo o DNA uma dupla-fita contínua, com vários genes concatenados, como a célula sabe onde parar a transcrição? • No DNA existem sequências reguladoras específicas que indicam INÍCIO e TÉRMINO de transcrição • Transcrição é semelhante a replicação em dois pontos: 1) precisa de um molde (3’5’)! 2) É feita da 5’3’ • Dividida em três fases: 1. Iniciação ligação do DNA (PROMOTOR) 2. Alongamento produção da fita! 3. Terminação fim da transcrição Não precisa de iniciador tipo Primer como na replicação, apenas segmentos limitados do DNA estão envolvido e apenas uma fita está relacionada! Reconhecimento da região promotora no DNA Cada gene tem seu próprio promotor! RNAs transcritos sofrem modificações pós- transcricionais antes de estarem maduros e úteis! • tRNA e rRNA clivados • Pré-mRNA splicing / Cap 5’ / poliA 3’ 5’-ATG AAA TTT GAC GGA CAA TAA-3’ DNA-codificante 3’-TAC TTT AAA CTG CCT GTT ATT-5’ DNA-molde 3’-TAC TTT AAA CTG CCT GTT ATT-5’ 5’-AUG AAA UUU GAC GGA CAA UAA-3’ RNA produzido EUCARIOTOS Sai do núcleo poro nuclear! Transcrição Transcrição = síntese de RNA •RNA polimerase •3 espécies de RNA polimerase são responsáveis pela transcrição em eucariotos: RNA pol I (rRNA), RNA pol II (mRNA) e RNA pol III (tRNA e 5S rRNA) •Os precursores do mRNA são modificados em ambos os lados (cauda poli a e cap) •O processamento do mRNA remove grandes sequências de nucleotídeos do meio das moléculas de RNA. Genes • A maioria do DNA contido no genoma de organismos superiores não codifica proteínas ou RNAs (98,5% do genoma humano não codifica proteína). Genes • Nos organismos superiores é comum genes com mais de 100.000 pbs (alguns chegam mais de 2 milhões). Entretanto, apenas 1000 pbs são necessários para codificar uma proteína de tamanho mediano ( 300 a 400 aminoácidos) • Íntrons e exons • Genes grandes consistem de vários exons e íntrons alternados e além disso existe regiões reguladoras, responsáveis pela expressão do gene Íntrons e exons Splicing RNA SPLICING • Imediatamente após a síntese dos precursores do mRNA, ocorre a ligação de snRNPs. • snRNPs = Proteínas + pequenos RNAs (aprox. 250 nucleotídeos denominados de U1 a U12) . • O transporte do mRNA para o citoplasma é retardado até que o processo de splicing seja concluído Splicing gera variabilidade gênica Nucléolo • O nucléolo é uma máquina de fazer ribossomos e é desmontado e montado após cada mitose. • RNA ribossômico (rRNA) • Seres humanos possuem 200 cópias por genoma haploide • O rRNAs eucarióticos: 28S (5070nt), 18S (1869nt), 5.8S (156nt) e 5S (121nt)
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