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Replicação do DNA Prof. Asafe Costa Lopes Replicação Transcrição Tradução A informação passa de uma molécula de DNA para outra molécula de DNA = originar novas células. Replicação do DNA Quando a replicação do DNA deve acontecer? 18/01/2018 Replicação do DNA 2 Antes de qualquer processo de divisão celular – Mitose ou Meiose 18/01/2018 Replicação do DNA 3 418/01/2018 Replicação do DNA Intérfase Fase G1Fase S (Replicação do DNA) Fase G2 Fase M Em qual fase do ciclo celular a replicação do DNA deve acontecer? 18/01/2018 Replicação do DNA 5 Este modelo permite explicar a transmissão fiel do património genético e a manutenção do DNA nas divisões celulares. Regras básicas do processo de replicação • Processo semiconservativo; 18/01/2018 Replicação do DNA 6 Regras básicas do processo de replicação • Início da replicação: Origem; • A replicação inicia-se nas ORIGENS DE REPLICAÇÃO, que são sequências específicas muito ricas em pares A=T: • Procariontes (bactérias) – 1 origem de replicação; • Eucariontes – múltiplas origens de replicação localizadas ao longo do cromossomo; 18/01/2018 Replicação do DNA 7 Em bactérias DNA circular “mais curto” Eucariotos DNA não circular e extenso - cromossomos Regras básicas do processo de replicação 18/01/2018 Replicação do DNA 8 ± 20 minutos para completar a replicação 1 origem = 7 dias Várias origens = horas (±6 horas) Origens de Replicação 18/01/2018 Replicação do DNA 9 Múltiplas Origens de replicação Origem de replicação Genoma humano (~10.000 ori), o que permite a célula humana replicar seu DNA relativamente rápido; 18/01/2018 Replicação do DNA 10 Os replicons eucarióticos podem ser iniciados em tempos diferentes; Fase S demora ~ 6hrs em uma célula somática; O genoma eucariótico constitui vários replicons 18/01/2018 Replicação do DNA 11 Regras básicas do processo de replicação • Modos de replicação: • Teta; • Linear; • Movimento da forquilha de replicação: • Unidirecional; • Bidirecional; 18/01/2018 Replicação do DNA 12 Replicação Teta e Bidirecional • Ocorre em DNA circular: • Cromossomo bacteriano; • DNA de alguns vírus; • Gera uma estrutura que se assemelha à letra grega teta (Θ); • Replicação teta: apenas 1 origem de replicação; 18/01/2018 Replicação do DNA 13 Replicação Teta 14 O ponto de deselicoidação, onde os 2 filamentos de nucleotídeos se separam da dupla hélice do DNA é chamada de forquilha de replicação. 18/01/2018 Replicação do DNA Replicação Teta e Bidirecional 18/01/2018 Replicação do DNA 15 Replicação Linear - Bidirecional • Ocorre em cromossomos lineares – organismos eucariontes; • Replicação linear: várias origens de replicação – bidirecional; 18/01/2018 Replicação do DNA 16 Replicação Linear - Bidirecional 17 Cada cromossomo contém várias origens Em cada origem, o DNA se desenrola, produzindo uma bolha de replicação. A replicação ocorre em ambos os filamentos em cada ponta da bolha, com as duas forquilhas de replicação se abrindo. As forquilhas de bolhas adjacentes correm uma para a outra e os segmentos de DNA se fundem... ... produzindo duas moléculas de DNA lineares idênticas Conclusão: Os produtos da replicação eucariótica são duas moléculas de DNA linear. 18/01/2018 Replicação do DNA Replicação Linear - Bidirecional 18/01/2018 Replicação do DNA 18 Forquilhas de replicação Micrografia, bolha de replicação 18/01/2018 Replicação do DNA 19 Processo de Replicação • Os mecanismos celulares responsáveis pela replicação do DNA foram descobertos primeiramente em bactérias; • A replicação em eucariotos ocorre através de proteínas análogas e com processos semelhantes à replicação do DNA de E. coli; 18/01/2018 Replicação do DNA 20 O mecanismo de replicação • A replicação ocorre em quatro estágios: a) Iniciação; b) Deselicoidização; c) Alongamento; d) Término; 18/01/2018 Replicação do DNA 21 As proteínas iniciadoras ligam-se a origem de replicação. Fazendo com que um curto trecho que DNA se desenrole. O desenrolamento permite que a helicase e proteínas de ligação unifilamentar (SSB) se unam ao DNA unifilamentar. Iniciação 18/01/2018 Replicação do DNA 22 Deselicoidização • 3 proteínas essenciais: • DNA Helicase – quebra as pontes de H entre as bases nitrogenadas – abre a dupla fita de DNA e move a forquilha de replicação; • SSB – estabiliza o DNA unifilamentar – evitam que os filamentos simples de unam novamente; • DNA Girase – vai a frente - reduz a torção que se acumula adiante da forquilha de replicação à medida que o filamento se desenrola; 18/01/2018 Replicação do DNA 23 Super-helicoidização induzida por abertura 18/01/2018 Replicação do DNA 24 Alongamento • Proteínas necessárias: • DNA Primase; • DNA polimerase III; • DNA polimerase I; • DNA ligase; 18/01/2018 Replicação do DNA 25 DNA Polimerase III • Enzima que sintetiza os novos filamentos de nucleotídeos; • Sentido 5’ – 3’; • Adiciona nucleotídeos livres na ponta 3’ do novo filamento que está sendo formado; 18/01/2018 Replicação do DNA 26 Como, então, se dá a síntese na direção 3‘> 5' da forquilha de replicação? • Na fita molde exposta na direção do movimento da forquilha - a síntese da nova fita é contínua - fita líder ou contínua; • Na fita molde exposta no sentido oposto ao movimento da forquilha a síntese da nova fita é descontínua - fita descontínua; 18/01/2018 Replicação do DNA 27 O que ocorre é uma replicação contínua em uma direção e descontínua na outra direção • À medida que o DNA se desenrola, o filamento molde que é exposto no sentido 3’ – 5’ permite que o novo filamento seja sintetizado continuamente (5’–3’); 18/01/2018 Replicação do DNA 28 O que ocorre é uma replicação contínua em uma direção e descontínua na outra direção • No filamento molde que é exposto no sentido 5’ – 3’; • Após um pequeno pedaço de DNA ter se desenrolado a síntese deve ser feita no sentido 5’ – 3’ > no sentido oposto ao desenrolamento do DNA; • Cada vez que o DNA se desenrola é necessário iniciar novamente a síntese se DNA no sentido 5’ – 3’ > até se encontrar com o fragmento já replicado; • A síntese desse filamento é em pedaços curtos e descontínuos (fita atrasada ou descontínua) • Os curtos trechos de DNA produzidos são chamados de fragmentos de Okazaki; 18/01/2018 Replicação do DNA 29 O que ocorre é uma replicação contínua em uma direção e descontínua na outra direção 18/01/2018 Replicação do DNA 30 Molde “nu” DNA Polimerase III • A DNA polimerase precisa de um nucleotídeo com um grupo 3'-OH para estender a cadeia de DNA; • DNA polimerase não pode iniciar uma nova cadeia de ácido nucléico por si própria; • Como, então, se inicia a síntese de DNA? 18/01/2018 Replicação do DNA 31 DNA Primase • Síntese de pequenos trechos de RNA (primers) usando a fita de DNA como molde; • O primer fornece um grupo 3’ -OH ao qual a DNA polimerase pode começar prender os próximos nucleotídeos; • DNA polimerase pode chegar e iniciar a adição de bases; 18/01/2018 Replicação do DNA 32 Primer adicionado à fita molde DNA Primase 18/01/2018 Replicação do DNA 33 DNA Primase 18/01/2018 Replicação do DNA 34 DNA Primase • Fita líder: • Primase age uma vez; • 1 primer; • Fita retardada: • Primase age várias vezes (vários primers); • Cada vez que o DNA se desenrola mais um pouco; • Fragmentos de Okasaki; 18/01/2018 Replicação do DNA 35 DNA Primase 18/01/2018 Replicação do DNA 36 Alongamento - DNA Polimerase III • Após o DNA ser desenrolado;• Ter sido adicionado o primer; • DNA polimerase III alonga o novo filamento de DNA; • Usa nucleotídeos livres; 18/01/2018 Replicação do DNA 37 DNA Polimerase I • Remove os primers deixados pela primase; • Substitui por nucleotídeos de DNA; 18/01/2018 Replicação do DNA 38 DNA Ligase • Após a DNA pol I ter substituído o primer de RNA por DNA – permanece um corte no filamento de DNA; • A DNA ligase – fecha o corte no DNA recém sintetizado; 18/01/2018 Replicação do DNA 39 18/01/2018 Replicação do DNA 40 Replicação do DNA 18/01/2018 Replicação do DNA 41 Características gerais do processo de replicação • Semiconservativo; • Iniciação não é aleatória (ori); • Direção da síntese 5’> 3’; • Semidescontinuidade de síntese das fitas (contínua numa fita e descontínua na outra); • Enzima principal é a DNA polimerase; • Primase inicia a adição de ribonucleosídeos (RNA); 18/01/2018 Replicação do DNA 42 O DNA se desenrola na origem. Término • Procariotos: DNA circular, quando as duas forquilhas de replicação se encontram ela termina; 18/01/2018 Replicação do DNA 43 • Eucariotos: cromossomos eucarióticos são lineares e possuem pontas; Término 18/01/2018 Replicação do DNA 44 Término • A medida que a replicação caminha os primers são removidos e substituídos por DNA; • Nos cromossomos lineares o alongamento com nucleotídeos de DNA no local onde estavam os primers é possível porque não há fragmentos de Okazaki; • Na ponta de um cromossomo não linear, quando o último primer é removido não existe um trecho adjacente de DNA replicado para fornecer o grupo 3’-OH; • Uma vez que o primer de RNA na ponta do cromossomo é removido ele não consegue ser substituído por nucleotídeos de DNA; 18/01/2018 Replicação do DNA 45 Término • Caso não houvesse um mecanismo específico o cromossomo iria se tornar mais curto a cada replicação, e acabaria perdendo partes do telômero, desestabilizando o cromossomo, podendo causar até a morte celular; 18/01/2018 Replicação do DNA 46 Término 18/01/2018 Replicação do DNA 47 Término • Após a telomerase ter sido removida - a enzima DNA primase sintetiza um primer na nova ponta alongada pela telomerase e fornece um grupo 3’-OH - DNA polimerase III possa sintetizar os nucleotídeos de DNA que faltam na ponta do cromossomo; • Quando o novo primer de RNA é degradado e retirado ele não fará a diminuição do telômero devido aos nucleotídeos adicionais que foram adicionados pela telomerase no filamento complementar; 18/01/2018 Replicação do DNA 48 São necessários vários processos para garantir a incrível precisão da replicação do DNA: A. SELEÇÃO DOS NUCLEOTÍDEOS B. REVISÃO DO DNA C. REPARO Replicação – resulta em uma taxa de erros de menos de 1/bilhão de pb. Como é obtida essa incrível precisão??? A fidelidade da replicação 18/01/2018 Replicação do DNA 49 Seleção • Os erros na seleção de nucleotídeos pela DNA polimerase III surgem em cerca de 1/100.000 nucleotídeos; • A maioria dos erros que surgem na escolha de nucleotídeos é corrigida em um segundo processo chamado de revisão; 18/01/2018 Replicação do DNA 50 Revisão do Dna • Capacidade da DNA polimerase reconhecer e corrigir nucleotídeos mal pareados; • Juntos, a seleção do nucleotídeo e a revisão resultam em uma taxa de erro de apenas 1/10 milhões de nucleotídeos; 18/01/2018 Replicação do DNA 51 Atividade revisora 3’ > 5’ da Pol III ajuda na fidelidade da replicação • A DNA polimerase III tem atividade polimerase – adicionar nucleotídeos no sentido 5’ – 3’; • Atividade exonuclease – remover nucleotídeos no sentido 3’ – 5’ – capacitando-a a corrigir erros; 18/01/2018 Replicação do DNA 52 Reparo • Reparo de pareamento errado – corrige erros após a replicação estar completa. Erros que escapam da revisão; • Qualquer nucleotídeo incorretamente pareado – produz uma deformidade na estrutura do DNA; • Essa deformidade é reconhecida por enzimas de reparo que removem o nucleotídeo incorreto e substitui pelo nucleotídeo correto; 18/01/2018 Replicação do DNA 53 Reparo 18/01/2018 Replicação do DNA 54 Reparo do Mau Pareamento • Usado quando o nucleotídeo inserido errado durante a replicação escapa do processo de revisão; • Proteína MutS se liga à base malpareada e forma um complexo com a MutL e MutH; • MutL reconhece o filamento molde (pela metilação do DNA); • MutH corta o filamento recém sintetizado e as exonucleases (helicase II - RecJ) degradam o filamento até chegar na base malpareada; • O espaço é preenchido pela DNA polimerase e selado pela DNA ligase; 18/01/2018 Replicação do DNA 55 Reparo do DNA • Muitos tipos de danos ao DNA podem ser corrigidos por mais de uma via de reparo - isso garante que quase todos os erros sejam corrigidos; • Se um erro escapa a um mecanismo de reparo, ele provavelmente será reparado por outro sistema; 18/01/2018 Replicação do DNA 56 Reparo por Excisão de Bases • Usado quando existe uma base lesada (subs. químicas); • Primeiro a base lesada é removida; • O nucleotídeo é substituído; • DNA glicosilases remove a base lesada (corta a ligação que une a base ao C’1 da pentose); • AP endonuclease corta a ligação fosfodiéster (fosfato / pentose); • DNA polimerase adiciona novo nucleotídeo contendo a base correta; • DNA ligase sela o filamento; 18/01/2018 Replicação do DNA 57 Reparo por Excisão de Bases • Processo de reparo muito utilizado quando existe uma base modificada; • Ex.: quando uma citosina é desaminada (-NH2) se transforma em uracila; • Essa modificação nas bases pode ocorrer de forma espontânea ou induzida por algumas substâncias químicas (ácido nitroso); 18/01/2018 Replicação do DNA 58 Reparo Por Excisão De Nucleotídeos • Remove volumosas lesões no DNA que distorcem o dupla hélice; • Um complexo de enzimas percorrem o DNA procurando distorções na configuração tridimensional; • Nucleases cortam o filamento de nucleotídeos na região danificada; • Helicases separa os dois filamentos de nucleotídeos e retira o filamento danificado; • O espaço é preenchido pela DNA polimerase e selado pela DNA ligase. 18/01/2018 Replicação do DNA 59 Reparo por Excisão de Nucleotídeos • As bases púricas e piridímicas absorvem luz UV; • O que pode resultar em mutações no DNA; • Ex.: formação de ligações químicas entre moléculas adjacentes de pirimidina no mesmo filamento de DNA criando estruturas chamadas dímeros de pirimidina (duas bases timina ou duas bases citosina); • Estes dímeros distorcem a configuração do DNA e bloqueiam a replicação do DNA; 18/01/2018 Replicação do DNA 60 Algumas doenças causadas por deficiência de reparo 18/01/2018 Replicação do DNA 61 Síndrome de Bloom • Características Clínicas: • Retardo no crescimento / baixa estatura; • Vermelhidão na face quando exposto à luz solar - dilatações capilares no rosto (eritema telangiectasia) aparece na infância; • Função imunológica defeituosa (infecções constantes); • Alto risco para desenvolvimento de neoplasias malignas (leucemia) - têm risco 150 a 300 vezes maior de desenvolvimento de neoplasias, quando comparado à população geral; • Instabilidade cromossômica (quebras / rearranjos inadequados por falta de reparo); 18/01/2018 Replicação do DNA 62 Características Clínicas • Retardo mental moderado, com dificuldade de aprendizado; • Microcefalia, face estreita, orelhas proeminentes, nariz proeminente; • Doenças pulmonares crônicas; • Azoospermia; • Manchas cafe-au-lait; • A sobrevida média é de 23 anos (neoplasia é a principal causa de morte); 18/01/2018 Replicação do DNA 63 Incidência • Rara - até 2003 foram descritosaproximadamente 220 casos, a maioria em judeus Ahkenazi; • Doença autossômica recessiva (consanguinidade entre os pais); 18/01/2018 Replicação do DNA 64 Base Genética • Está relacionada a alterações no mecanismo de reparo do DNA; • Alterações em uma família de genes denominada RecQ (DNA helicases); • Mutação no gene BLM, localizado no 15q26.1; • A proteína codificada pelo gene normal tem uma atividade DNA helicase e atua na replicação e na estabilidade genômica (reparo); 18/01/2018 Replicação do DNA 65 Base Genética • Ocorrem muitas interrupções da replicação - gerando instabilidade genômica - pode ser letal se uma via alternativa de resgate da forquilha de replicação não for iniciada; • Muitas células morrem por não conseguir terminar a replicação (retardo no crescimento); • PROBLEMA!!! Algumas células conseguem ativar vias de resposta restaurando a forquilha quebrada - mutações sem reparo - oncogenes. • As células apresentam: • Um aumento de quebras cromossômicas; • Aumento na taxa de mutação 10 vezes maior; • Replicações anormais (retardamento da elongação da forquilha de replicação e um atraso do momento de replicação, associado a um aumento no nível de danos no DNA); 18/01/2018 Replicação do DNA 66 Quebras cromossômicas • Defeitos nos mecanismos de reparo e replicação do DNA; • Frequência alta aberrações cromossômicas; • Incidência alta de câncer; 18/01/2018 Replicação do DNA 67 Obrigado! 18/01/2018 Replicação do DNA 68
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