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Profa. Denise Wanderlei - UFAL ICBS / Setor de Microbiologia Métodos de Diagnóstico em Laboratório de Microbiologia Clínica Amostras Clínicas • MORFOLÓGICOS – Baseados em Microscopia • Exame Direto de Amostras Não-coradas: Montagem com salina; Gota pendente; Iluminação de campo escuro • Exame Direto de Amostras Coradas: Coloração de Gram; Coloração de Ziehl-Neelsen; Coloração de estruturas especiais; Fluorescência direta – Métodos Culturais • BIOQUÍMICOS • IMUNOLÓGICOS (SOROLÓGICOS) • GENOTÍPICOS (MOLECULARES) Métodos Diagnósticos Iluminação de Campo Escuro Leptospira sp. Exame Direto de Amostras Coradas (Fungos) Escamas epidérmicas e ungueais Malassezia spp. • K-tinta: Potassa (KOH a 10%) + tinta Parker (K-tinta) • Azul de lactofenol algodão Coloração de Gram Bastonetes Gram negativos Cocos Gram positivos Procedimento 1. Cristal violeta 2. Iodo (mordente) 3. Álcool (descoloração) 4. Safranina (contra-corante) Campo microscópico Coloração de Ziehl-Neelsen Bacilos de Koch - BKs (setas) Carbolfucsina Descoloração Safranina BAAR Não-BAAR Coloração de Estruturas Especiais • Coloração de Endosporos Método de Shaeffer-Fulton (verde malaquita a 5% e safranina) (A) • Coloração de Flagelos Carbolfucsina (B) • Coloração Negativa de Cápsulas: Tinta nanquim e safranina (C) (A) (B) (C) Colônias em meio Lowenstein-Jensen (BK) Métodos Culturais Pseudomonar aeruginosa Ágar Trypticase-soja Serratia marcescens Ágar MacConkey Shigella flexneri Ágar MacConkey Testes Bioquímicos Reação negativa Reação positiva Teste de Motilidade - + + Teste da oxidase Teste da Catalase Prova positiva em Staphylococcus aureus 2 H2O2 ½ O2 + H2O Pseudomonas aeruginosa (A) e Escherichia coli (B) em meio de cultura TSI (triplo açúcar ferro) (B) Fermentação de glicose e lactose modificação da cor do meio de cultura para amarelo. Produção de gás formação de bolhas no meio (seta) A B Utilização da glicose 1 2 Ágar MacConkey (AMC) 1) Fermentação da lactose positiva (E. coli) 2) Fermentação negativa (Salmonella) + - - Métodos Sorológicos Aglutinação negativa Aglutinação positiva Aglutinação Complexo Antígeno-Anticorpo ENSAIOS IMUNOFLUORESCENTES • Técnicas de imunofluorescência (IF) • Combinam isotiocianato de fluoresceína (FITC) com anticorpos, para que fluoresçam quando exposto à luz ultravioleta • São procedimentos rápidos, sensíveis e específicos e podem ser diretos (DFA) ou indiretos (IFA) DFA - um antígeno reage com o anticorpo contendo fluoresceína dirigido contra o antígeno + Lavar Determinante antigênico Anticorpos conjugados com FITC DFA - Imunofluorescência Direta IFA - a amostra é colocada para reagir com um excesso de anticorpos não-marcados dirigidos contra o antígeno Determinante antigênico + Lavar Anticorpos conjugados com FITC + Anticorpos não marcados Lavar IFA – Imunofluorescência Indireta Amplificação e detecção de ácidos nucleicos Métodos laboratoriais convencionais Expressão fenotípica de antígenos ou produtos bioquímicos Métodos moleculares Rápida identificação de agentes infecciosos Alta sensibilidade e especificidade Prevenção de doenças Rigoroso controle de qualidade Testes Moleculares em Laboratórios Particulares Microrganismo Técnica Material Biológico Chlamydia trachomatis Detecção do DNA por PCR Vários materiais Chlamydia trachomatis Detecção do DNA por PCR Vários materiais Mycobacterium tuberculosis Detecção por PCR Vários materiais Micobactérias Identificação por PCR Cepa da bactéria Bordetella pertussis e B. parapertussis Detecção do DNA por PCR Vários Materiais Neisseria gonorrhoeae Detecção do DNA por PCR Vários Materiais Toxoplasma gondii Detecção por PCR Vários materiais Vírus do Dengue Detecção por PCR em tempo real Plasma Parvovírus B19 Detecção por PCR Vários Materiais Epstein-Barr Vírus Quantificação PCR em tempo real Sangue HLAB27 Genotipagem por PCR em tempo real Sangue total Citomegalovírus Detecção do DNA por PCR Vários materiais Citomegalovírus Detecção do DNA por PCR em tempo real Plasma HBV Detecção do DNA por PCR em tempo real Plasma HBV PCR quantitativo em tempo real Sangue total HCV Detecção do DNA por PCR Sangue total HCV Detecção do DNA por PCR Sangue total HCV Detecção do RNA por PCR Sangue total HCV Quantitativo por PCR Sangue total HIV-1 Quantitativo por PCR Sangue total HIV-1 Quantificação por PCR ultra-sensível Sangue total Marc 3 29 45 52 53 54 55 55b 56 57 57b 58 58b 87 100 102 104 105 121 125 131 135 50bp Marc 45 55 57 58 87 100 102 105 121 125 131 135 3 29 52 53 54 55b 56 57b 58b 104 P 50pb Produtos de digestão com a enzima Sst II do gene gyrA, (P) produto de PCR (Pseudomonas aeruginosa) 5’… CCGCGG… 3’ 3’...GGCGCC… 5’ SstII Streptomyces stanford Sítio de clivagem Enzima Organismo Tipo selvagem Sensível Tipo mutante Resistente RFLPs/PCR Produtos amplificados da região do gene gyrA por PCR PCR Aninhada ou Nested-PCR PCR Multiplex Staphylococcus aureus: genes femB, ileS-2, e mecA, de uma cepa altamente resistente a meticilina e mupirocina. Linhas 1 a 3, PCR (amplicons) de femB, ileS-2, e mecA, respectivamente; linha 4, PCR triplex (amplicons), i.e., femB, ileS-2, e mecA simultaneamente amplificados. Mais que uma sequência alvo é amplificada utilizando mais de um par de primers M 3 45 55 57 58 87 100 101 102 1 04 105 118 120 121 125 127 131 133 135 144 M 1Kb 1Kb Perfil eletroforético de P. aeruginosa gerado pela amplificação PCR-RAPD do DNA total com OPC 11 (TGGACCGGTG). Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Sequenciamento de DNA