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Profa Bruna Comparsi Biomédica - CRBM 2845 Mestre e Doutora em Bioquímica Toxicológica - UFSM Email: bruna.comparsi@unijui.edu.br 1 Aminoácidos: estrutura e Funções biológicas As proteínas são polímeros formados por unidades monoméricas chamadas alfa-aminoácidos, unidos entre si por ligações peptídicas Todas as proteínas são formadas por um conjunto de 20 aminoácidos covalentemente ligados em uma seqüência linear (alfabeto da bioquímica) Nas proteínas, os aminoácidos possuem um grupo carboxílico e um grupo amino ligados ao mesmo átomo de carbono, diferindo um do outros pelas cadeias laterais, que variam de tamanho e cargaestrutura, elétrica. abreviados Seus nomes são em 3 letras e simbolizados por uma letra. Aminoácidos das proteínas H COOH Grupo carboxila (pK1) H3N C Grupo amino (pK2) cadeia lateral - diferente para cada aminoácido (pK3) Tamanho Forma Carga Capacidade de formar pontes de hidrogênio Características hidrofóbicas Reatividade química Outra forma de representar a estrutura dos Aminoácidos: - aminoácidos C ou C quiral (exceção = glicina) NH2: grupamento Amino COOH: grupamento carboxila Cárater Ácido- Base Definição: 1.Amonoácidos não polares 2.Amonoácidos polares 3.Amonoácidos aromáticos 5. Amonoácidos polares não carregados positivamente 4. Amonoácidos polares carregados positivamente 8 pH fisiológico: FORMA IONIZADA -NH3 +, -COO- Constituintes básicos: aminoácidos 9 Características distintas Importante para a conformação das proteínas = função Constituintes básicos: aminoácidos Aminoácidos APOLARES Aminoácidos POLARES 10 Constituintes básicos: aminoácidos Aminoácidos APOLARES R = cadeias orgânicas Não interagem com a água Localização Interna 11 Constituintes básicos: aminoácidos Aminoácidos APOLARES R = apolar Incapaz de receber prótons, participar de ligações iônicas ou formar pontes de hidrogênio Cadeias laterais “oleosas”, ~ lipídios interações hidrofóbicas 12 Constituintes básicos: aminoácidos 13 Alanina Prolina 14 Constituintes básicos: aminoácidos Aminoácidos POLARES R = grupos com carga elétrica Interagem com a água Superfície da molécula 15 ÁCIDOS BÁSICOS 16 Constituintes básicos: aminoácidos SEM CARGA Em pH neutro 17 CISTEÍNA NOMENCLATURA: Aminoácido Abreviação - Símbolo Glicina Gly - G Alanina Ala – A Prolina Pro – P Valina Val – V Leucina Leu – L Isoleucina Ile – I Metionina Met - M Grupos R alifáticos apolares Aminoácido Abreviação - Símbolo Fenilalanina Phe – F Tirosina Tyr – Y Triptofano Trp - W Serina Ser – S Treonina Thr – T Cisteína Cys – C Asparagina Asn – N Glutamina Gln – Q Grupos R aromáticos Grupos R polares não carregados NOMENCLATURA: Aminoácido Abreviação - Símbolo Lisina Lys – K Histidina His – H Arginina Arg – R Aspartato Asp – D Glutamato Glu - E Grupos R carregados positivamente Grupos R carregados negativamente NOMENCLATURA: Estereoisomeria dos aminoácidos Isômeros L e D L aminoácidos: Atividade Biológica D aminoácidos são encontrados em alguns antibióticos (valinomicina e actinomicina) e em peptídeos bacterianos (peotideoglicanos) 24 Essenciais: necessidade de ingestão. Não-essenciais: produzidos pelo organismo através de reações de trasnsaminações Não Essenciais Essenciais Glicina, Alanina, Serina, Cisteína, Tirosina, Arginina Fenilalanina, Valina, Triptofano Aspartato, Glutamato, Histidina, Asparagina Treonina, Lisina, Leucina, Isolucina Glutamina, Prolina Metionina CLASSIFICAÇÃO DOS AAS: QUANTO A SÍNTESE • Neurotransmissores: glicina, GABA, serotonina, melatonina • Hormônios: Tiroxina (tireóide) Mensageiros Químicos: • Componentes de nucleotídeos e ácidos núcleicos • Componente do heme (grupo contendo ferro)Precursores: • Arginina, citrulina e ornitina: ciclo da uréia (excreção do excesso de nitrogênio) Intermediários metabólicos: Propriedade Ácido-Base dos AAs • Funcionam como bases e ácidos fracos 27 Em pH fisiológico ( 7,4) o grupo carboxila e amino estão dissociados (íons) pH neutro Um aminoácido pode agir como um ácido (doador de prótons) Um aminoácido pode agir como uma base (aceptor de prótons) A N F Ó T E R A S T A M PÕ E S Relembrando!!! Conceito de ácido e base: •Ácido: toda substância capaz de liberar íons H+ •Base: toda substância capaz de captar íons H+ Ex: H2CO3 HCO3 - + H+ Ex: NH3 + H + NH4 + 30 Um α-aminoácido simples: 1 grupo carboxílico e 1 grupo amino ácido diprótico quando está totalmente protonado apresenta 2 grupos o grupo –COOH e o grupo –NH3 + podem se ionizar para liberar prótons Quem define o comportamento do AAs é o pH do meio, ou seja, em um meio básico se comporta como ácido e em um meio ácido como base Os aminoácidos em solução aquosa, são ionizados e podem agir como ácidos e bases, e potencialmente podem agir como tampões A característica ácido/básica dos aminoácidos é o que determina as propriedades físicas e biológicas das proteínas. A relação quantitativa entre a concentração ácido fraco (HA) e sua base conjugada de um (A-) é descrita pela equação de Henderson-Hasselbach. pH = pK + log [A-] [ HA] Comportamento como tampão pI - a carga elétrica liquida dos aminoácidos e sua relação com o pH da solução Medida quantitativa de pK para cada um dos 2 ou 3 grupos ionizantes Tem curvas de titulação características que fornecem 3 informações importantes: pH isoelétrico é o pH médio entre os valores de pK de cada lado das espécies isoelétricas. 2 pH isoelétrico Estruturas isoelétricas que embora carregados eletricamente, o íon híbrido não apresenta uma carga efetiva, e portanto não migra em um campo elétrico. pI = pK1 + pK2 Quando o aminoácido tem 2 grupos dissociáveis + NH3 O- O Estrutura isoelétrica ou Zwitteriônica da alanina ouQuando o aminoácido tem 3 grupos dissociáveis pI = pK1 + pK3 2 pI = pK2 + pK3 2 Os valores de pK expressam a força dos ácidos fracos (logaritmico da constante de dissociação, Ka). E, a carga líquida (soma algébrica de todos os grupos carregados negativamente presentes) de um aminoácido depende sobretudo do pH, ou concentração protônica da solução em que está contido. A habilidade para alterar a carga sobre os aminoácidos pelo monitoramento do pH facilita a separação física de aminoácidos, peptídeos e proteínas. •Fundamental para a compreensão do pH das soluções. EQUAÇÃO DE HENDERSON - HASSELBALCH Base conjugada (A-) Ácido fraco (HA) Tampões •Sistemas que tendem a se opor à mudanças de pH •O tampão pode ser produzido pela mistura de um ácido fraco (HÁ) e sua base conjugada (A-). Titulação de AAs •Representação gráfica do comportamento anfótero dos AAs •Evidenciam a atuação dos AAs como tampões Tampão: toda substância que mantém inalterado seu pH após a adição moderada de ácidos ou bases. Sistema Tampão: um bom tampão é constituído de um ácido fraco e sua base conjugada Base: NaOH Glicina + Ácido (HCl) 50 % -COOH 50 % -COO- 50 % -NH3 + 50 % -NH2 Fornece dois valores de pKa: um para cada grupo ionizável da glicina Duas regiões tamponantes Calcular as proporções de espécies doadora e aceptoras de H+ necessárias para fazer um tampão em um determinado pH Relação entre a carga líquida e pH Ponto isoelétrico ou pH isoelétrico pH onde a carga líquida é zero Forma dipolar ou Zwitterion +1 0 -1 Se não tivermos o pI, tem como calcular? SIM pI = pK1 + pK2 2 pI = 2,34 + 9,6 2 pI = 5,97 Se move para polo - Se move para polo + Não se move Curva de Titulação de AAs •AAs com um único grupo carboxil, um único grupo amino e grupo R não ionizável •Curva de titulação é semelhante a glicina •Possuem valores de pKa semelhantes mas não idênticos • pKa –COOH: 1,8 a 2,4 pKa –NH3 +: 8,8 a 11,0 •AAs grupos ionízáveis na cadeia R: curvas de titulação mais complexas com 3 estágios +1 0 -1 -2 pI = 2,19 + 4,25 2 pI = 3,22 Menor do que a glicina 3 áreas tamponantes 51 Bibliografia utilizada: LEHNINGER. Princípios de bioquímica. 5 ed.São Paulo: SARVIER, 2011. CHAMPE, P.C.; HARVEY, R.A. Bioquímica. Porto Alegre: Artes Médicas, 1997. 52 Obrigada pela atenção!!!
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