DNA Barcode

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DNA Barcoding 
O que é DNA Barcoding?
Uso de região padronizada de DNA para a rápida e precisa identificação de táxons a espécies.
Para animais, 648 pb do gene mitocondrial citocromo c oxidase 1 ("CO1") 
Vantagens COI: 
	-evolução rápida (ambiente oxidativo), 
	-primers universais robustos
	-distribuição em um amplo espectro filogenético
	-ausência de introns, 
	-herança haploide,
	-exposição limitada para recombinação.
O código de barras COI não é eficaz para a identificação de plantas, pois elas evoluem muito lentamente,
Duas regiões do gene no cloroplasto, matK e rbcL, foram aprovadas como as regiões de código de barras para as plantas terrestres.
	Utilização de fragmentos de DNA em: 
fezes,
urina,
fósseis (conservados em lugares muito secos e/ou congelados).
Lugares com alta riqueza de espécies (florestas tropicais, fossas abissais),
DNA Barcoding é uma das únicas alternativas viáveis,
Pode executar várias identificações simultâneas. 
Barato, 
Prático, 
Rápido, 
Limitações: 
	- espécies muito jovens pouca diferenciação filogeneticamente parecidos com seus predecessores.
Para serem mais específicas sequências devem ser grandes (600bp)
Sequências de DNA degradado: pequenas (em média 150bp), baixando a especificidade.
Banco de dados
IBOL
BRBOL
Entre outros regionais.
Instituições do Projeto BrBOL
Senso Stricto
Os taxonomistas preferem o senso stricto; neste caso o processo é feito com uma única e padronizada região do DNA mitocondrial.
Normalmente, tal processo é usado para uma identificação mais precisa (espécie, gênero)
Senso Lato
Usa-se qualquer região do DNA, e a pesquisa não é tão precisa (táxons, família)
Características de um DNA modelo
1) A sequência deve ser quase idêntica entre indivíduos da mesma espécie, mas diferente entre espécies
2) Deve ser padronizada, com a mesma região de DNA para qualquer grupo
3) Deve conter informações filogenéticas suficientes para atribuir espécies desconhecidas aos seus respectivos grupos taxonômicos
4) Deve ser robusto, com os primers bem conservados, para que as amplificações sejam confiáveis
5) A região a ser observada deve ser pequena o suficiente para ser amplificada.
Como é muito difícil encontrar um gene com tais características, cada cientista preza por algumas características. Os taxonomistas prezam mais pelas três primeiras características, enquanto que ecologistas prezam pelas últimas duas.
DEZ RAZÕES PARA USAR DNA BARCODE	
Bibliografia
http://www.barcodinglife.org/
http://geneticacritica.blogspot.com.br/2010/07/dna-barcode-e-sistematica-molecular.html
http://phe.rockefeller.edu/barcode/docs/BLIllustrated24jan04book%20v1-3%20Portugues%2021june07.pdf
http://z14.invisionfree.com/Conchologist_Forum/ar/t1178.htm
http://brbol.org/pt-br/content/brbol-brazilian-barcode-life-0
Danielle Hamae Yamauchi
Fábio Henrique de Arruda Lima
Gabriel Fellipe Rodrigues Barros
Maria Júlia Waldemarin Doria