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Genética microbiana MICROBIOLOGIA PROFª RAQUEL ZENI TERNUS UNIVERSIDADE COMUNITÁRIA REGIONAL DE CHAPECÓ ÁREA DE CIÊNCIAS EXATAS E AMBIENTAIS CURSO DE Ciências Biológicas Todas as características microbianas são controladas ou influenciadas pela hereditariedade; GENÉTICA - Ciência da hereditariedade e da variabilidade dos organismos: ▪ estudo dos genes; ▪ como eles transportam informações; ▪ como são replicados e passados para as gerações subsequentes de células ou transmitidos entre micro-organismos; ▪ como a expressão da sua informação determina as características. GENÓTIPO Genes de um organismo. FENÓTIPO Expressão dos genes. GENOMA Material genético total de uma célula. GENÔMICA Estudo molecular do genoma CROMOSSOMOS São estruturas particulares que transportam fisicamente a informação hereditária e que contêm os genes. GENES São segmentos de DNA (exceto em alguns vírus, que são feitos de RNA) que codificam os produtos funcionais. CélulaCromossomo DNA ÁCIDOS NUCLÉICOS: Moléculas orgânicas complexas, formadas pela polimerização de nucleotídeos (DNA - desoxiribose e RNA - ribose) (1) Contêm a informação que determina a sequência de aminoácidos (aa) e a estrutura e função das proteínas (DNA); (2) Fazem parte das estruturas celulares e alinham os aa de forma correta quando uma cadeia polipeptídica está sendo sintetizada (RNA); (3) Catalisam uma série de reações químicas fundamentais nas células (pontes peptídicas entre os aa) GRUPO FOSFATO BASE NITROGENADA (adenina, timina, citosina e guanina) AÇUCAR Ribose RNA Desoxiribose DNA Nucleosídeo: açúcar + base Nucleotídeo: fosfato + açúcar + base ESTRUTURA DOS ÁCIDOS NUCLÉICOS ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLÉICO (DNA) - Polímero linear longo e de fita dupla, composto de 4 tipos de nucleotídeos (A, T, C e G), que é o carreador da informação genética. - Contém toda a informação necessária para a construção das células e tecidos de um organismo. ÁCIDO RIBONUCLÉICO (RNA) Polímero linear de fita simples, compostos de nucleotídeos (A, U, C e G). Apresenta 3 tipos de RNA celular (mRNA, tRNA e rRNA), com papéis diferentes na síntese de proteínas. -RNAm: transporta as instruções do DNA que especificam a ordem exata dos aa durante a síntese de proteínas. -RNAt: interpreta as informações do RNAm e transporta aa durante a síntese de proteínas. -RNAr: auxilia o RNAt no processo de tradução. Bases Nitrogenadas DNA e RNA - quimicamente muito semelhantes - constituídos por 4 nucleotídeos A, G – purinas (contém um par de anéis fusionados) T, C e U – pirimidinas (anéis simples) ESQUELETO DO ÁCIDO NUCLÉICO Formado por unidades repetidas de fosfato-pentose a partir das quais as bases purinas e pirimidinas se estendem como grupamentos laterais. Orientação: 5´ 3´ -Extremidade 5´: tem um hidroxil ou um grupamento fosfato no carbono 5´ de seu açúcar terminal. -Extremidade 3´: apresenta um grupamento hidroxil no carbono 3´ de seu açúcar terminal. Fita de Ácido Nucléico ilustrando sua orientação -orientação: sempre 5´ para 3´ -Ligação fosfodiéster: ligação química entre nucleotídeos adjacentes no DNA e RNA (estrutura 1º) DUPLA HÉLICE DE DNA - Watson & Crick -Dupla hélice -Fitas antipararelas (reverse) -Pontes de Hidrogênio entre as bases nitrogenadas (A - T e C - G) -Pareamento de bases de Watson-Crick: é ligação entre uma pirimidina e uma purina (DNA natural) -Fitas Complementares A dupla hélice de DNA. (a) Modelo tridimensional e (b) estrutura química. A = T C ≡ G MUITAS MOLÉCULAS DE DNA SÃO CIRCULARES DNAs (vários procariotos e vírus, mitocondrial e dos cloroplastos) Supertorção: Quando a fita de DNA gira sobre si mesma Círculo relaxado: Quando a fita de DNA é cortada (destorcida). Topoisomerase I (enzima que catalisa a distorção do DNA) (a) Forma B do DNA: normal (0,36 nm entre as bases, 10,5 pares/volta) (b) Forma A do DNA: mais compacta (11 pares/volta e uma forte torção em relação ao eixo da hélice (desidratado a 75% de etanol ou em baixa [sal]) (c) Forma Z do DNA: em zigue-zague (12 pares/volta) (metilação, > torção, ligação com algumas proteínas). DOGMA CENTRAL Com a descoberta do DNA, em 1953, e a subsequente elucidação de como o DNA dirige a síntese de RNA e posterior montagem das proteínas foi possível elaborar uma representação simplificada do sistema. DNA ProteínaRNADNA Replicação TraduçãoTranscrição Transcrição reversa Fluxo da Informação Genética REPLICAÇÃO -Garante a continuidade genética da espécie ao longo das gerações (sinais celulares para o crescimento, tais como > velocidade de síntese de proteínas, ou < concentração de aa e que induzem ao aumento da replicação); - Essencial para o desenvolvimento normal de um indivíduo. Na replicação do DNA, uma molécula de DNA “mãe” de dupla fita é convertida em duas moléculas “filhas” idênticas. http://www.youtube.com/watch?v=pin3569QfgI http://www.youtube.com/watch?v=NMObWWt_yrc Os micro-organismos apresentam elevadas velocidades metabólicas. Em algumas horas várias gerações podem surgir Ex: E. coli: 3 gerações em 1 hora. clones Procariotos - A Célula Duplica o Material Genético Antes da Divisão Celular Replicação do DNA em Procariotos Nogueira & Silva Filho, 2010 Replicação do DNA em Eucariotos Eucariotos: superenovelamento estabilizado pelas histonas Em Archaea tanto histonas quanto DNA girase TRANSCRIÇÃO - (DNA ⇨ RNA) A produção de um polipeptídeo mediada por ribossomos, cuja sequência de aminoácidos é especificada pela sequência de nucleotídeos no RNAm. http://www.youtube.com/watch?v=B7XEaafYNNk Uma fita do DNA serve de molde (sense strand) Tem Uracil (U) no lugar de Timina (T) RNA fita simples Três tipos de RNA com diferentes funções: mRNA (RNA mensageiro): especifica a sequência de aa tRNA (RNA de transferência): usa a informação contida no mRNA e traduz essa informação em uma sequência de aa rRNA (RNA ribossômico): forma os ribossomos responsáveis pela tradução do RNA em proteínas 2a base U C A G 1a base U UUU (Phe/F) Fenilalanina UUC (Phe/F) Fenilalanina UUA (Leu/L) Leucina UUG (Leu/L) Leucina UCU (Ser/S) Serina UCC (Ser/S) Serina UCA (Ser/S) Serina UCG (Ser/S) Serina UAU (Tyr/Y) Tirosina UAC (Tyr/Y) Tirosina UAA "Ocre" (Stop) UAG "Âmbar" (Stop) UGU (Cys/C) Cisteína UGC (Cys/C) Cisteína UGA "Opala" (Stop) UGG (Trp/W) Triptofano C CUU (Leu/L) Leucina CUC (Leu/L) Leucina CUA (Leu/L) Leucina CUG (Leu/L) Leucina CCU (Pro/P) Prolina CCC (Pro/P) Prolina CCA (Pro/P) Prolina CCG (Pro/P) Prolina CAU (His/H) Histidina CAC (His/H) Histidina CAA (Gln/Q) Glutamina CAG (Gln/Q) Glutamina CGU (Arg/R) Arginina CGC (Arg/R) Arginina CGA (Arg/R) Arginina CGG (Arg/R) Arginina A AUU (Ile/I) Isoleucina AUC (Ile/I) Isoleucina AUA (Ile/I) Isoleucina AUG (Met/M) Metionina, Start ACU (Thr/T)Treonina ACC (Thr/T)Treonina ACA (Thr/T)Treonina ACG (Thr/T)Treonina AAU (Asn/N) Asparagina AAC (Asn/N) Asparagina AAA (Lys/K) Lisina AAG (Lys/K) Lisina AGU (Ser/S) Serina AGC (Ser/S) Serina AGA (Arg/R) Arginina AGG (Arg/R) Arginina G GUU (Val/V) Valina GUC (Val/V) Valina GUA (Val/V) Valina GUG (Val/V) Valina GCU (Ala/A) Alanina GCC (Ala/A) Alanina GCA (Ala/A) Alanina GCG (Ala/A) Alanina GAU (Asp/D) Ácido aspártico GAC (Asp/D) Ácido aspártico GAA (Glu/E) Ácido glutâmico GAG (Glu/E) Ácido glutâmico GGU (Gly/G) Glicina GGC (Gly/G) Glicina GGA (Gly/G) Glicina GGG (Gly/G) GlicinaTRADUÇÃO - (DNA ⇨ Proteínas) Processo em que uma fita de DNA é usada pela RNA polimerase como um molde para a síntese de um RNA complementar. http://www.youtube.com/watch?v=B7XEaafYNNk http://www.youtube.com/watch?v=FMn9tv97QSk ❖ Participação do: mRNA e tRNA códon anticódon ❖ Aminoácidos ❖ Proteínas https://www.youtube.com/watch?v=f5FMLxqxW18 https://www.youtube.com/watch?v=FD_iOPkvKUA Resistência e variabilidade microbiana ORGANIZAÇÃO DO GENOMA BACTERIANO GENOMA: seqüência completa de DNA; algumas não são convertidas em produtos funcionais • Sequências não-codificadoras: INTRONS (bactérias não possuem) • Sequências codificadoras: EXONS OPERON: grupos de um ou mais genes estruturais expressos a partir de um promotor específico. Operons com muitos genes estruturais são chamados policistrônicos. Promotores e operadores: sequências de nucleotídeos que controlam a expressão de um gene determinando as seqüências que serão transcritas no mRNA. A variabilidade está associada a duas propriedades: Genótipo: potencial total herdado Procariotos: cromossomo + qualquer DNA presente (p. ex. Plasmídeos) Eucariotos: cromossomo + DNA organelas (mitocôndrias e cloroplastos) Fenótipo: expressão de uma porção do genótipo. Condições ambientais também podem influenciar o fenótipo Ex. Azomonas spp. - meio com sacarose: colônias mucosas e grandes - meio sem sacarose: colônias secas e pequenas Variações genotípicas ❖ Ocorre graças a dois mecanismos: 1) Mutações (Processo vertical ) ■ Alterações (hereditárias) na sequência de nucleotídeos de um gene. - Geralmente resultam em pequenas alterações genéticas (uma em vários milhões de células) - Todos seres vivos Mutação → Evolução e diversidade das espécies 2) Recombinação genética (Processo horizontal ) ■ Elementos genéticos contidos em dois genomas diferentes são reunidos numa unidade – nova combinação de genes. - Provoca alterações mais significativas. ❖ Mutações Mudanças hereditárias na sequência de nucleotídeos de um gene Substituição de bases (troca de bases) Mutações de remoção ou de fase de leitura (remoção de bases) Adição ou perda de bases (proteínas não funcionais) Mutações sem sentido ou mutação nonsense (término da cadeia de aa) Mutações silenciosas (não acarreta efeito no fenótipo) Variações genotípicas Substituição de uma Base (pontual) Agentes mutagênicos ❖ Agentes químicos: Agentes mutagênicos e seu modo de ação Agente Ação Resultado Análogos de base 5-bromouracil Substitui T, mas pareia Troca de AT por GC com G 2-aminopurina Substitui A, mas pareia Troca de AT por GC com C Químicos que reagem com o DNA Ácido nitroso (HNO2) Desamina A e C Troca de AT por GC Troca de GC por AT Hidroxilamina (NH2OH) Reage com C Troca de GC por AT Agentes alquilantes Monofuncional (ex. sulfonato de Metilação de G, que passa Troca de GC por AT etil metano) a parear com T Bifuncionais (ex. gás mostarda,Ligação cruzada das fitas de Mutação pontual e nitrosoguanidina) DNA, a região é cortada deleção pela DNA polimerase Corantes intercaladores Acridinas, brometo de etídio Inserem-se entre nucleotídeos Microinserções e microdeleções Radiação Ultravioleta Formação de dímeros de Reparos podem levar pirimidina erros ou deleções Radiação ionizante (ex. raios X) Formação de radicais livres que quebram o DNA ❖Radiações: raios-X, luz ultra-violeta ❖Mutagênese por elementos transponíveis ❖Transposons: cromossomos, plasmídeos, genomas virais e qualquer outro tipo de molécula de DNA * transposase * repetições invertidas * baixa frequência: 10-5 a 10-7 por geração (1/10.000.000) EMA DIZ BOM DIA EMA DAZ BOM DIA EMA DIZ BOA DIA EMA DIZ BOM DIZ EMA IZB OMD IA Deleção EMA ADI ZBO MDI A Inserção Troca de uma letra Perda de uma letra Ganho de uma letra Consequências das mutações Como detectar mutações? Mutantes resistentes crescendo dentro de uma zona de inibição Teste de Ames - Procedimento Teste de mutagenicidade em Saccharomyces cerevisiae Ensaio Cometa (Single CeII GeI Electrophoresis - SCGE) Recombinação genética Formação de um novo genótipo Trocas de material genético entre dois cromossomos homólogos (crossing over) Eucariotos: MEIOSE Procariotos: RECOMBINAÇÃO Recombinação genética ❖ Transformação Avery, MacLeod & McCarthy (1944) ❖ Conjugação Ledeberg & Tatum (1946) ❖ Transdução Zinder & Ledeberg (1952) ■ Transformação Transformação bacteriana - Transferência de DNA “nu” em solução; - Célula competente: alterações na parede celular que permitem a entrada de DNA; ■ Conjugação Natureza: - Contato entre células - Plasmídeo ou cromossomo Nogueira & Silva Filho, 2010 - Mediada por plasmídeos (fragmento de DNA circular que se replica independentemente do cromossomo da célula – transportam genes não essenciais); - Requer o contato direto entre as células; - Célula doadora (contém o plasmídeo) / célula aceptora; - Bactérias Gram-negativas: plasmídeo codifica síntese de pili sexuais; E. coli: fator F (fator de fertilidade) – plasmídeo transferido entre as células durante a conjugação; - Célula Hfr (alta frequência de recombinação - fator F integrado) - Replicação e transferência do fator F (plasmídeo) Conversão de células F+ para Hfr e formação da célula F- recombinante após conjugação ■ Transdução Natureza: - Vírus como vetor (bacteriófagos ou fagos) - Generalizada e Especializada Transdução generalizada Leitura complementar Capítulos 8 e 9 TORTORA; FUNKE; CASE, 2012
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