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CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS Universidade Federal do Rio Grande do Sul Instituto de Ciências Básicas da Saúde Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia Disciplina de Virologia Básica Equipe de Virologia ICBS/UFRGS LABVIR CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS ICTV, 2013 http://www.ictvonline.org/index.asp Classificação definida pelo: Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV) ICTVdB - The Universal Virus Database International Committee on Taxonomy of Viruses Taxonomia Ordem Família Subfamília Gênero ...virales ...viridae ...virinae ...virus Mononegavirales Paramyxoviridae Paramyxovirinae Morbillivirus vírus da cinomose canina Espécie Exemplos: 1. Família Poxviridae, sub-família Chordopoxvirinae, gênero Orthopoxvirus, vírus vaccínia. 2. Família Herpesviridae, sub-família Alphaherpesvirinae, gênero Simplexvirus, herpes vírus humano 2 (vírus do herpes simples 2). Como se escreve? No uso vernacular informal, deve-se substituir o uso de "ph" por "f" e o do "y" por "i", e deve-se usar assento quando apropriado. Por exemplo: alfaherpesvírus, paramixovírus, aftovírus. Fonte: Cornelia Büchen- Osmond, ICTV Família Características estruturais; Morfológicas; Genéticas; Biológicas em comum. Família Herpesviridae Possuem vírions grandes; Com envelope contendo várias glicoproteínas; Capsídeo icosaédrico; Uma camada protéica – denominada tegumento – entre o capsídeo e o envelope; DNA de fita dupla linear; Capazes de estabelecer latência. Família Subfamília Gêneros Espécies BoHV-1 BoHV-5 SuHV-1 Herpesviridae Alphaherpesvirinae Betaherpesvirinae Gammaherpesvirinae Simplexvirus Varicellovirus “Espécie de vírus é uma classe politética de vírus que constitui uma linhagem replicativa e ocupa um nicho ecológico particular” “A classificação em subespécies, cepas, variantes e isolados não existe de forma oficial, embora sua importância seja reconhecida para o diagnóstico, para estudos biológicos e moleculares e também para a produção de vacinas.” O termo isolado (ou amostra) refere-se a um vírus que foi obtido por isolamento de uma determinada fonte de infecção (animal infectado). O termo cepa é utilizado para designar amostras de vírus que já foram bem caracterizadas e sobre as quais já se possui certo conhecimento. Classificação viral Estrutura (morfologia): Forma Tamanho Simetria Envelope Estrutura do genoma Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos Relações antigênicas Propriedades biológicas Estratégias de replicação Gama de hospedeiros Modo de transmissão Patogenicidade A classificação em espécies, embora não regulamentada pelo ICTV, segue os seguintes critérios: • a) homologia da sequência; • b) hospedeiros; • c) tropismo de tecido e células; • d) patogenicidade; • e) forma de transmissão; • f) propriedades físico-químicas; • g) propriedades antigênicas. Uma outra classificação prática, não oficial: • Respiratórios: vírus que penetram no hospedeiro por inalação e produzem infecção e doença primariamente no trato respiratório. Ex: rinovírus, calicivírus; • Entéricos: vírus que penetram pela via oral e replicam no trato intestinal. Ex: coronavírus, rotavírus; • Arbovírus: vírus que replicam e são transmitidos por vetores artrópodos. Ex: vírus da encefalites eqüinas leste e oeste; • Vírus oncogênicos: vírus com potencial para induzir transformação celular e tumores nos hospedeiros. Ex: retrovírus, papilomavírus. Famílias virais • Vírus com genoma RNA de sentido positivo • Vírus com genoma RNA de sentido negativo não-segmentado • Vírus com genoma RNA de sentido negativo segmentado • Vírus com genoma RNA de cadeia dupla • Vírus com genoma RNA que realizam transcrição reversa • Vírus com genoma DNA fita simples • Vírus com genoma DNA fita dupla Vírus com genoma RNA de sentido positivo Arteriviridae Astroviridae Caliciviridae Hepeviridae Coronaviridae Picornaviridae Flaviviridae Togaviridae CORONAVIRIDAE -Envelope lipídico com peplômeros que projetam externamente (aspecto de coroa). -Entre os vírus RNA é o que apresenta o maior genoma (27 a 32kb). -Em humanos está relacionado a resfriados comuns. Coronavirus: •Vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) •Coronavírus humano (HuCoV) •Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV) •Torovirus: •Torovirus: EToV; BToV; SToV e HToV ssRNA(+) Coronavírus Infecção respiratória Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV): doença respiratória severa na Ásia. PICORNAVIRIDAE - Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A) Enterovirus (enterovírus bovino, suíno B e humanos A, B, C e D) Rinovirus (resfriados) Aphtovirus (Febre Aftosa) ssRNA(+) Família Picornaviridae Aphtovirus (febre aftosa) - FEBRE AFTOSA – efeitos indiretos no meio ambiente - FLAVIVIRIDAE -Gêneros: Flavivirus : vírus da febre amarela (YFV), vírus da dengue 1,2,3,4 Pestivius: Vírus da diarreia viral bovina tipos 1 e 2 (BVDV1 e BVDV2) Vírus da peste suína clássica (CSFV) Hepacivirus: Hepatite C - Estão classificados vários agentes de doenças hemorrágicas e encefalites transmitidas por mosquitos. ssRNA(+) Há 390 milhões de pessoas infectadas pelo vírus da febre de dengue todos os anos, refere um novo estudo. As alterações climáticas e a urbanização são os fatores importantes na incidência futura da doença. (OMS, 2013) Vírus da dengue Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentado, com polaridade negativa Filoviridae Paramyxoviridae Rhabdoviridae FILOVIRIDAE Gêneros: – Ebolavirus: vírus Ebola. Os vírus dessa família causam doenças hemorrágicas em humanos. ssRNA(-) Paramyxoviridae Paramyxovirinae: Respirovirus: parainfluenza bovina tipo 3. Morbillivirus: cinomose, sarampo. Rubulavirus: vírus da caxumba. Pneumovirinae: Pneumovirus: Vírus sincicial respiratório bovino (BRSV) Metapneumovirus humano Metapneumovírus aviário ssRNA(+) - Associados principalmente a doenças respiratórias identificadas em mamíferos e aves. Gêneros: Lyssavirus: Raiva (RV) Vesiculovirus: vírus da estomatite vesicular (VSV) - Característica morfológica lembrando um projétil de arma de fogo. Rhabdoviridae ssRNA(-) Vírus com genoma RNA de fita simples segmentado Arenaviridae Orthomyxoviridae Bunyaviridae ORTHOMYXOVIRIDAE - myxo = muco Glicoproteínas hemaglutinina (HA) e neuraminidase (NE) - Gêneros: -Influenzavirus A (FluAV) -Influenzavirus B (FluBV) -Influenzavirus C (FluCV) Genoma segmentado : FluAV – 8 seg. FluBV – 7 seg. FluCV – 6 seg. Vírus com genoma RNA de fita dupla Reoviridae Birnaviridae REOVIRIDAE - Dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm)- Gêneros: Orthoreovirus Orbivirus (língua Azul) Rotavirus dsRNA PATOGÊNESE Os rotavírus aderem ao epitélio do trato GI (mucosa jejunal) Danos da região apical das vilosidades * * Enterotoxina viral NSP4 Aumento da Motilidade e Diminuição da Absorção Zuckerman A et al, eds. Principles and Practice of Clinical Virology. 2nd ed. Londres: John Wiley & Sons; 990:182. Fonte: Simone Guadagnucci Morillo Vírus com genoma RNA de simples diplóide (que fazem transcrição reversa) Retroviridae Retroviridae - Replicação viral complexa; integra seu provírus ao DNA da célula: infectam o hospedeiro para o resto da vida. - Associados a doenças tumorais e imunossupressivas. Orthoretrovirinae Alpharetrovirus: leucose aviária (ALV) Gammaretrovirus: leucose felina (FeLV) Deltateretrovirus: leucose bovina (VLB) Lentivirus: anemia infecciosa equina (EIAV) imunodeficiência felina (FIV) imunodeficiência humana (HIV) ssRNA (RT) Imunodeficiência humana (HIV) Vírus com genoma DNA fita simples Circoviridae Parvoviridae CIRCOVIRIDAE Menores vírus com genoma DNA Gêneros: ssDNA Max. divergence 309, Clustal V (PAM250) Goose circovirus Porcine circovirus 1 Porcine circovirus 2 Bat cyclovirus Cyclovirus a Cyclovirus TN18 Chicken anemia virus a Chicken anemia virus b Chicken anemia virus c Chicken gyrovirus 2 Swan circovirus genus Circovirus genus Gyrovirus genus ´Cyclovirus´ Avian gyrovirus 2 CIRCOVIRIDAE Descoberta de um novo agente : Girovírus das aves tipo 2 Discovery of a genome of a distant relative of chicken anemia virus reveals a new member of the genus Gyrovirus. Franciscus A. M. Rijsewijk, Helton F. dos Santos, Thais F. Teixeira, Samuel P. Cibulski, Ana Paula M. Varela, Diogenes Dezen, Ana Cláudia Franco, Paulo M. Roehe. Publicado em: Archives of Virology, 2011 • DOI 10.1007/s00705-011-0971-6 PARVOVIRIDAE Parvovirus: parvovírus canino tipos 1 e 2 (CPV-1; CPV-2), vírus da panleucopenia felina (FPLV), parvovírus suíno (PPV), parvovírus bovino (BPV); Erythrovirus: vírus B19 humano (aborto) Dependovirus: vírus adeno-associado 2 (AAV). ssDNA Vírus com genoma DNA fita dupla Papillomaviridae Polyomaviridae Adenoviridae Hepadnaviridae Herpesviridae Poxviridae Asfarviridae PAPILOMAVIRIDAE - Vários associados a cânceres Papilomavírus: - Verrugas - Epidermodisplasia verruciforme Alphapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-32); Betapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-5); Gammapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-4) Epsilonpapillomavirus: papilomavírus bovino tipo 5 (BPV-5); dsDNA - Transcrição reversa 2 gêneros: - Ortohepadnavirus: hepatite B (HBV) - Humano - Avihepadnavirus: vírus da hepatite B dos marrecos (DHBV) HEPADNAVIRIDAE dsDNA (RT) HERPESVIRIDAE • Alfaherpesvirinae – Simplexvirus: » Herpesvírus bovino tipo 2 » Vírus do herpes simplex humano tipo 1 e 2 (HSV-1 e HSV-2) – Varicellovirus: » Vírus da rinotraqueíte bovina (BoHV-1) » BoHV-5 » SuHV-1 – Mardivirus: » Vírus da doença de Marek – Iltovirus: » Vírus da laringotraqueíte infecciosa das galinhas (ILTV) dsDNA Avipoxvirus: bouba aviária Orthopoxvirus: Varíola Parapoxvirus: ectima contagioso dos ovinos (ORFV) Vários outros poxvírus POXVIRIDAE - Um dos maiores vírus conhecidos (~ 300 nm) - simetria complexa (retangular ou ovoide) dsDNA Varíola Humana (VARV) CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS Universidade Federal do Rio Grande do Sul Instituto de Ciências Básicas da Saúde Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia Disciplina de Virologia Básica Obrigado! LABVIR
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