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Bioquímica Prof. Dr. Rafael Machado Felix de Lima Doutor em Ciências (Química e Bioquímica) Mestre em Ciências (Química e Bioquímica) Licenciado em Química rafael.felix@prof.una.br Enzimas Catálise biológica início séc. XIX digestão da carne: estômago digestão do amido: saliva Década de 50 Louis Pasteur concluiu que a fermentação do açúcar em álcool pela levedura era catalisada por “fermentos” enzimas. Eduard Buchner (1897) extratos de levedo podiam fermentar o açúcar até álcool; enzimas funcionavam mesmo quando removidas da célula viva. INTRODUÇÃO: Um pouco de história 3 INTRODUÇÃO: Um pouco de história James Sumner (1926) Isolou e cristalizou a urease; Cristais eram de proteínas; Postulou que “todas as enzimas são proteínas”. John Northrop (década 30) Cristalizou a pepsina e a tripsina bovinas; Década de 50 – séc. XX 75 enzimas isoladas e cristalizadas; Ficou evidenciado caráter proteico . Atualmente - Mais de 2000 enzimas são conhecidas. 4 Enzimas Definição: Catalisadores biológicos; Longas cadeias de pequenas moléculas chamadas aminoácidos. Função: Viabilizar a atividade das células, quebrando moléculas ou juntando-as para formar novos compostos. 5 Enzimas: Estrutura Geral Com exceção de um pequeno grupo de moléculas de RNA com propriedades catalíticas, chamadas de RIBOZIMAS, todas as enzimas são PROTEÍNAS. Proteínas Formadas por ligações peptídicas entre aminoácidos. Aminoácidos: COOH NH3 C* H R 6 Século XIX poucas enzimas identificadas Adição do sufixo ”ASE” ao nome do substrato: gorduras (lipo - grego) – LIPASE amido (amylon - grego) – AMILASE Nomes arbitrários: Tripsina e pepsina – proteases Enzimas: Nomenclatura Características Enzimas Apresentam alto grau de especificidade; São produtos naturais biológicos; Reações baratas e seguras; São altamente eficientes, acelerando a velocidade das reações; São econômicas, reduzindo a energia de ativação; Não são tóxicas; Condições favoráveis de pH, temperatura, polaridade do solvente e força iônica. 8 Não alteram o estado de equilíbrio Abaixam a energia de ativação; Keq não é afetado pela enzima. Não apresenta efeito termodinâmico global G não é afetada pela enzima. Diferença entre a energia livre de S e P Caminho da Reação Energia de ativação com enzima Energia Energia de ativação sem enzima S P Atividade Catalítica em Enzimas Emil Fischer (1894): alto grau de especificidade das enzimas originou Chave-Fechadura considera que a enzima possui sitio ativo complementar ao substrato. Enzimas como componentes de reações Koshland (1958): Propôs Encaixe Induzido enzima e o substrato sofrem conformação para o encaixe. O substrato é distorcido para conformação exata do estado de transição. Enzimas como componentes de reações Maioria deriva de vitaminas hidrossolúveis Classificam-se em: transportadoras de hidrogênio transportadoras de grupos químicos Enzimas & Cofatores 13 RNA Estrutura Enzimática Ribozimas Se covalente Apoenzima ou Apoproteína Grupo Prostético Holoenzima Cofator Coenzima Proteína Pode ser: íon inorgânico molécula orgânica Estruturas Enzimas Região da molécula enzimática que participa da reação com o substrato. Pode possuir componentes não proteicos: cofatores. Possui aminoácidos auxiliares e de contato. Enzimas & Cofatores Coenzima: molécula orgânica complexa. Ex. NAD+ HOLOENZIMA Porção proteica APOENZIMA Grupamento prostético Ativador:Íons inorgânicos que condicionam a ação catalítica das enzimas Ex. Fe²+ Cofator ENZIMA COFATOR PEROXIDASE Fe+2ou Fe+3 CATALASE CITOCROMO OXIDASE Cu+2 ÁLCOOL DESIDROGENASE Zn+2 HEXOQUINASE Mg+2 UREASE Ni+2 Algumas enzimas que contêm ou necessitam de elementos inorgânicos como cofatores Enzimas & Cofatores Transportadoras de hidrogênio Enzimas & Cofatores Transportadoras de grupos químicos Enzimas & Cofatores Subclasses Enzimas: Classificações Oxidorredutases: São enzimas que catalisam reações de transferência de elétrons, ou seja: reações de oxirredução. Ex.: Desidrogenases e Oxidases. Se uma molécula se reduz, tem que haver outra que se oxide. Enzimas: Classificações 20 Transferases: Enzimas que catalisam reações de transferência de grupamentos funcionais como grupos amina, fosfato, acil, carboxil, entre outros. Ex.: Quinases e Transaminases Hidrolases: Catalisam reações de hidrólise de ligação covalente. Ex: Peptidases. Liases: Catalisam a quebra de ligações covalentes e a remoção de moléculas de água, amônia e gás carbônico. Ex.: Dehidratases e Descarboxilases. Isomerases: Catalisam reações de interconversão entre isômeros ópticos ou geométricos. Ex.: Epimerases. Ligases: Catalisam reações de formação e novas moléculas a partir da ligação entre duas já existentes, às custas de Energia(ATP). Ex.: Sintetases. Fatores que alteram a velocidade de reações enzimáticas: pH; temperatura; adição de solutos (ex: álcool, uréia, etc.) concentração das enzimas; concentração dos substratos; presença de inibidores. Fatores que alteram uma reação enzimática Qualquer substância que reduz a velocidade de uma reação enzimática: Inibidores enzimáticos INIBIDORES REVERSÍVEIS IRREVERSÍVEIS COMPETITIVOS NÃO COMPETITIVOS INCOMPETITIVOS Concorre com o Substrato (S) pelo sitio ativo da Enzima (E) livre. Inibidores enzimáticos - Competitivo I não tem semelhança com S Inibidor não-competitivo se liga reversivelmente, aleatória e independentemente em um sítio que lhe é próprio. Inibidores enzimáticos – Não-Competitivo Inibidor incompetitivo se liga reversivelmente, em um sítio próprio, ao complexo ES. I não tem semelhança com S Inibidores enzimáticos – Incompetitivo Forma-se uma ligação COVALENTE entre o I e a E. I se combina com um grupo funcional da E. Pode ocorrer a destruição do grupo funcional Inibidores enzimáticos – Irreversível Pesquise: O que são ribozimas? Enzimas e Sítio Ativo Imagem: [Haynathart / Um sítio ativo em uma enzima dependente de NAPD+ / Public Domain Obrigado!! rafael.felix@prof.una.br 35