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Lista de Exercícios Introdução ao Metabolismo 1 – Desenhe a estrutura do ATP e explique por quê esta molécula contém alta energia. 2 – O que são ADP e AMP? 3 – Desenhe as estruturas do NADH, FADH2 e NADPH. Explique suas funções. 4 – O que são vias metabólicas? 5 – O que é e para que serve o metabolismo? 6 – Quais as funções do metabolismo? 7 - A entropia é alterada durante o desenvolvimento do ovo. Considere um sistema consistindo de um ovo em uma incubadora. A clara e a gema do ovo contem proteínas, carboidratos e lipídeos. Se fertilizado, o ovo é transformado de uma única célula para um organismo complexo. Discuta este processo irreversível em termos das mudanças de entropia no sistema, nas vizinhanças do ovo e no universo. Certifique-se primeiro em definir o sistema e sua vizinhança. 8 Diferença entre ΔG'° e ΔG: Considere a seguinte interconversão que ocorre na glicólise. Frutose 6 fosfato ⇆ glicose 6-fosfato Keq = 1.97 a) Qual é o ΔG'° para a reação (Keq medida a 25°C)? b) Se a concentração de frutose 6-fosfato é ajustada para 1,5 mol/L e a glicose 6-fosfato é ajustada para 0,50 mol/L, qual será o ΔG? c) Por que ΔG'° e ΔG são diferentes? 9 - Dependência do ΔG em relação ao pH: A energia livre liberada pela hidrólise do ATP em condições padrão é 230,5 KJ/mol. Se o ATP é hidrolisado em condições padrão, porém a pH 5,0, é liberada mais ou menos energia? Explique. 10 - Calcule o ΔG'° para a reação acoplada com ATP. a) fosfocreatina + Pi ⇌ creatina + Pi ΔG'° = - 43 KJ/mol b) Pi + frutose ⇌ H2O + frutose 6-fosfato ΔG'° = + 15,9 KJ/mol OBS: Considere a hidrólise do ATP = - 30,5 kJ/mol Respostas 1 - O organismo vivo necessita de aporte ininterrupto de energia para manter as suas atividades básicas. A obtenção desta energia advém da quebra ou degradação de moléculas orgânicas dos alimentos, principalmente a glicose. Ela não é apenas liberada para o meio, sendo necessária sua transferência para outras moléculas, conhecidas como Adenosina Trifosfato – ATP (do inglês, Adenosine Triphosphate), as quais armazenam temporariamente a energia, liberando-a posteriormente. São moléculas altamente energéticas, que após a quebra da ligação, liberam energia para as atividades celulares. A molécula de ATP é formada por uma molécula de Adenosina (Adenina + Ribose) e três de Fosfato. As ligações que mantêm os radicais de fosfato, o segundo e o terceiro, presos no ATP, são muito energéticas. Sendo assim, toda vez que o terceiro fosfato se solta do conjunto, irá ocorrer a liberação de energia que o mantinha unido ao ATP. As ligações químicas entre dois dos fosfatos do ATP são representadas graficamente pelo símbolo ~ (til). O ATP tem a função de captar a energia liberada nas reações em que ocorre liberação de energia, armazenar essa energia em ligações moleculares altamente energéticas e transferi-la para processos celulares que necessitam absorver energia. https://www.infoescola.com/bioquimica/glicose/ 2 - O composto AMP, adenosina monofosfato ou monofosfato de adenosina é um nucleótido que é usado como monómero da RNA. Consiste num éster de ácido fosfórico com o nucleósido adenosina. É um composto de baixa energia, diferentemente de seus compostos di e trifosfatados ADP e ATP respectivamente. Considerando esses dois últimos compostos como as verdadeiras moedas energéticas da célula, o AMP só costuma aparecer em grandes concentrações na célula em situação de extrema baixa energética, em que todos as moléculas de ATP e ADP foram desfosforiladas para a obtenção de energia para funções celulares fundamentais. https://pt.wikipedia.org/wiki/Nucle%C3%B3tido https://pt.wikipedia.org/wiki/Energia https://pt.wikipedia.org/wiki/ADP https://pt.wikipedia.org/wiki/ATP https://pt.wikipedia.org/wiki/C%C3%A9lula https://pt.wikipedia.org/wiki/Concentra%C3%A7%C3%A3o Adenosina difosfato (ADP) ou difosfato de adenosina é um nucleotídeo, isto é, um composto químico formado por um nucleotídeo e dois radicais fosfato. Neste caso, compõem o nucleotídeo uma base purínica, a adenina, e um açúcar do tipo pentose, que é a ribose. É a parte sem fosforilação da ATP. O ADP é produzido quando há alguma descarboxilação em alguns compostos da glicólise no ciclo de Krebs. 3 - A forma NADH é obtida pela redução do NAD+ com dois elétrons e aceitação de um próton (H+). Quimicamente, é um composto orgânico (a forma ativa da vitamina B3) encontrado nas células de todos os seres vivos e usado como "transportador de elétrons" nas reações metabólicas de oxirredução, tendo um papel preponderante na produção de energia para a célula. Em sua forma reduzida, NADH, faz a transferência de elétrons durante a fosforilação oxidativa. https://pt.wikipedia.org/wiki/Nucleot%C3%ADdeo https://pt.wikipedia.org/wiki/Radical_(qu%C3%ADmica) https://pt.wikipedia.org/wiki/Fosfato https://pt.wikipedia.org/wiki/Purina https://pt.wikipedia.org/wiki/Adenina https://pt.wikipedia.org/wiki/Pentose https://pt.wikipedia.org/wiki/Ribose https://pt.wikipedia.org/wiki/Fosforila%C3%A7%C3%A3o https://pt.wikipedia.org/wiki/Trifosfato_de_adenosina https://pt.wikipedia.org/wiki/Descarboxila%C3%A7%C3%A3o https://pt.wikipedia.org/wiki/Glic%C3%B3lise https://pt.wikipedia.org/wiki/Ciclo_de_Krebs https://pt.wikipedia.org/wiki/El%C3%A9tron https://pt.wikipedia.org/wiki/Pr%C3%B3ton https://pt.wikipedia.org/wiki/Qu%C3%ADmica https://pt.wikipedia.org/wiki/Composto_org%C3%A2nico https://pt.wikipedia.org/wiki/C%C3%A9lula https://pt.wikipedia.org/wiki/Eletrons https://pt.wikipedia.org/wiki/Metabolismo https://pt.wikipedia.org/wiki/Energia https://pt.wikipedia.org/wiki/NADH https://pt.wikipedia.org/wiki/Fosforila%C3%A7%C3%A3o_oxidativa https://pt.wikipedia.org/wiki/Fosforila%C3%A7%C3%A3o_oxidativa FADH2 - O di-nucleotídeo de flavina e adenina (FAD), também conhecido como flavina- adenina di-nucleotídeo e di-nucleotídeo de flavina-adenina, é um cofator capaz de sofrer ação redox, presente em diversas reações importantes no metabolismo. O FAD pode existir em dois estados de oxidação e o seu papel bioquímico envolve frequentemente alternância entre esses dois estados. O FAD é capaz de se reduzir a FADH2, estado em que aceita dois átomos de hidrogênio: https://pt.wikipedia.org/wiki/Co-fator_(bioqu%C3%ADmica) https://pt.wikipedia.org/wiki/Redox https://pt.wikipedia.org/wiki/Metabolismo https://pt.wikipedia.org/wiki/Estado_de_oxida%C3%A7%C3%A3o https://pt.wikipedia.org/wiki/%C3%81tomo https://pt.wikipedia.org/wiki/Hidrog%C3%A9nio NADPH - A nicotinamida adenina di-nucleotídeo fosfato ou fosfato de di-nucleotídeo de adenina e nicotinamida (NADP) é uma coenzima semelhante a di-nucleotídeo. É o aceptor de elétrons nas reações da via das pentoses-fosfato e na transformação de malato em piruvato pela ação da enzima málica, havendo redução de NADP+ a NADPH. Está envolvida nas vias de síntese de ácidos graxos e glicerol. 4 - Uma via metabólica, do ponto de vista bioquímico, é uma série de reações químicas em que o produto final de uma reação serve de substrato (ou reagente) à reação que lhe sucede, estando as reações interdependentes umas das outras. Estas reações são catalisadas por enzimas. 5 - Metabolismo é o conjunto de transformações que as substâncias químicas sofrem no interior dos organismos vivos. A expressão metabolismo celular é usada em referência ao conjunto de todas as reações químicas que ocorrem nas células. Estas reações são responsáveis pelos processos de síntese e degradação dos nutrientes na célula e constituem a base da vida, permitindo o crescimento e reprodução das células, mantendo as suas estruturas e adequando respostas aos seus ambientes. 6 - Metabolismo é a soma de processos químicos e físicos que ocorrem dentro de um organismo vivo. O metabolismo divide-se em catabolismo (quebra de uma substânciahttps://pt.wikipedia.org/wiki/El%C3%A9tron https://pt.wikipedia.org/wiki/Via_das_pentoses-fosfato https://pt.wikipedia.org/wiki/Rea%C3%A7%C3%A3o_qu%C3%ADmica https://pt.wikipedia.org/wiki/Composto_qu%C3%ADmico https://pt.wikipedia.org/wiki/Organismo https://pt.wikipedia.org/wiki/C%C3%A9lula https://pt.wikipedia.org/wiki/S%C3%ADntese_qu%C3%ADmica https://pt.wikipedia.org/wiki/Nutriente https://pt.wikipedia.org/wiki/Vida https://pt.wikipedia.org/wiki/Crescimento_(biologia) https://pt.wikipedia.org/wiki/Reprodu%C3%A7%C3%A3o para obter energia) e anabolismo (capacidade que o organismo possui de transformar uma substância em outra que sirva para seu desenvolvimento e reparação). 7 - Considere o desenvolvimento da ave como um sistema; os nutrientes, a casca do ovo e o mundo fora da casca como a vizinhança. A transformação de uma única célula em uma ave reduz a entropia do sistema. Inicialmente, as partes do ovo fora do embrião (a vizinhança) contem complexa quantidade de moléculas (baixa entropia). Durante a incubação, algumas destas moléculas são convertidas para um grande número de CO2 e H2O (alta entropia). Este aumento da entropia na vizinhança é muito maior que a diminuição da entropia no sistema (ave). 8 – a) ΔG'° = -RTlnKeq Onde T, temperatura em Kelvin (25°C = 298 K) R = 8,315 J/molo K (Constante universal dos gases perfeitos) ΔG'° = -(8,315).298. (ln 1,97) = - 1,68 kJ/mol b) A reação Frutose 6 fosfato ⇆ glicose 6-fosfato Frutose 6-fosfato = 1,50 mol/L Glicose 6-fosfato = 0,50 mol/L Keq = [Produtos] / [reagentes] Keq = 0,50/1,50 Keq = 0,33 Desde que a concentração não seja 1 mol/L, usa-se ΔG = ΔG'° + RTlnKeq ΔG = - 1,68 + (8,315).298. (ln 0,33) = -4,4 kJ/mol c) A dada a temperatura, o valor de ΔG'° para qualquer reação é fixado e definido como padrão (aqui, ambos glicose 6-foisfato e frutose 6-fosfato estão definidas como 1 mol/L). Em contraste, o ΔG é uma variável que pode ser calculada ajustando as concentrações de reagentes e produtos. 9 - Menor. A equação geral para a hidrólise do ATP pode ser aproximada: ATP + H2O ⇌ ADP + PO43- (Pi) + H+ Sobre condições padrão (i.e., [ATP] = [ADP] = [Pi] = 1 mol/L), a concentração da água é 55 mol/L e não muda durante a reação. Como íons H+ são produzidos durante a reação e o pH do meio é igual a 5,0, o equilíbrio é deslocado em favor da formação de ATP e assim, a energia livre será menor. 10 - a) fosfocreatina + H2O ⇌ creatina + Pi ΔG'° = - 43 KJ/mol ADP + Pi ⇌ ATP + H2O ΔG'° = + 30,5 KJ/mol Reação Global Fosfocreatina + ADP ⇌ creatina + ATP ΔG'° = - 12,5 KJ/mol b) Pi + frutose ⇌ H2O + frutose 6-fosfato ΔG'° = + 15,9 KJ/mol ATP + H2O ⇌ ADP + Pi ΔG'° = + 30,5 KJ/mol Reação Global Frutose + ATP ⇌ frutose 6-fosfato + ADP ΔG'° = - 14,6 KJ/mol
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