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Aula 5 – Bioquímica Propriedade 1 O ligante combina-se a um sítio particular da proteína A molécula que se liga temporariamente à proteína é chamada ligante Qualquer molécula pode ser um ligante O sítio de ligação é complementar aos ligantes em: 1. tamanho 2. forma 3. carga (positiva ou negativa) 4. caráter (hidrofílico ou hidrofóbico) Uma proteína pode ter mais de um sítio de ligação Importância da especificidade da ligação Exemplo: Diferenciação do “próprio” e “não-próprio” no sistema imunológico As células dos vertebrados apresentam em sua superfície uma grande variedade de proteínas chamadas proteínas MHC Estas proteínas se ligam à fragmentos de proteínas celulares oriundos de degradação de células (complexo MHC-peptídeo) Estes complexos sinalizam para as células de defesa o que é próprio do organismo (são eliminados) Assim toda Célula T que resta se liga especificamente à apenas moléculas estranhas ao organismo (chamadas antígenos) Proteínas MHC e ligação ao antígeno (ligante) Propriedade 2 As interações proteína-ligante são reversíveis Um ligante pode conectar e desconectar de um sítio ativo da proteína Conexão - maior afinidade pelo ligante Desconexão – menor afinidade pelo ligante Garante a reutilização das proteínas em suas funções Exemplo: Mioglobina Função da mioglobina: transporte de O2 nos músculos O2 é pouco solúvel em soluções aquosas Proteínas especializadas em captar O2 nos pulmões e liberá-lo nos tecidos A cadeia peptídica única está ligada à um grupo heme (contendo Fe) Como se dá o ganho/perda da afinidade pelo O2? O grupo heme contém um átomo de Ferro que sofre oxido-redução Fe2+ tem maior afinidade pelo O2 do que Fe 3+ Cadeia lateral de uma Histidina impede a conversão do Fe2+ do grupo heme estabilizando a ligação da mioglobina ao O2 Quando a mioglobina muda sua conformação a Histidina perde efeito sobre o grupo heme e o Fe2+ passa a Fe3+ (perda de afinidade) Propriedade 3 As proteínas são flexíveis As proteínas são capazes de alterar sua “forma” de maneira controlada As mudanças na conformação influenciam na afinidade por determinado ligante As proteínas globulares são mais flexíveis que as proteínas fibrosas As proteínas podem ter regiões mais rígidas e regiões mais flexíveis Exemplo de proteína flexível: Hemoglobina Hemoglobina: transporte de O2 no sangue Proteína tetramérica com 4 grupos heme A hemoglobina tem dois estados conformacionais Estado R: Aminoácidos fazem o grupo heme assumir estrutura planar Afinidade maior pelo O2 Estado T: Aminoácidos fazem o grupo heme assumir estrutura pregueada Menor afinidade pelo O2 Nos pulmões Nos tecidos Transição do estado T → R Maior afinidade por O2 Captação de O2 Transição do estado R → T Menor afinidade por O2 Liberação de O2 O dispara a mudança conformacional? Íons H+ O CO2 nos tecidos é hidratado gerando HCO3 - + H+ Os íons H+ aumentam o pH e são incorporados à aminoácidos da hemoglobina Quando a His HC3 da subunidade β é protonada ela forma um par iônico com a Asp FG1 Este par iônico ajuda a estabilizar o estado T da hemoglobina (menor afinidade por O2), facilitando a liberação do O2 nos tecidos Aumento de H+ Protonação de HC3 Formação de pares iônicos Transição de estado R→ T Liberação do O2 A hemoglobina também transporta H+ e CO2 Tecidos: ↑ CO2 ↓ O2 Pulmões: ↑ O2 ↓ CO2 CO2 é hidratado CO2 → HCO3- Diminuição do pH Diminuição da afinidade por O2 Liberação de O2 Captação de CO2 Menos CO2 e H+ Aumento do pH Aumento da afinidade por O2 Captação de O2 Liberação de CO2 Propriedade 4 Ajustes em proteínas multiméricas é cooperativo As mudanças conformacionais de uma subunidade acelera as mudanças nas demais A velocidade de transição da segunda é maior que da primeira, a terceira é maior que a segunda, … Hemoglobina A transição do estado T → R é mais rápido a partir da segunda subunidade Ajuste da afinidade por O2 na hemoglobina A ligação de O2 à uma subunidade da hemoglobina altera afinidade das subunidades adjacentes Propriedade 5 As interações proteína-ligante podem ser reguladas Interações com ligantes adicionais (moduladores) podem causar mudanças na conformação que influenciam na capacidade de ligação dos sítios Estas proteínas são chamadas proteínas alostéricas Alosteria homotrópica: o modulador é o próprio ligante Alosteria heterotrópica: o modulador é uma molécula diferente do ligante A BPG é um modulador heterotrópico da hemoglobina A presença da BPG reduz a afinidade da hemoglobina por O2, ajudando a estabilizar o estado T Em condições normais, a presença da BPG resulta numa eficiência de liberação de apenas 40% nos tecidos Em baixas concentrações de O2, os níveis de BPG aumentam resultando numa eficiência de liberação maior Este efeito balanceia o nível de O2 nos tecidos
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