Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
297 Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical 45 (3): 297-300, maio-jun, 2012 INTRODUÇÃO Artigo / Artigo 1. Laboratório de Entomologia Médica e Veterinária, Setor de Ciências Biológicas, Departamento de Zoologia, Universidade Federal do Paraná, Curitiba, PR. Endereço para: Dr. Mario Antônio Navarro-Silva. Lab. EntomologiaMédica e Veterinária / Dept o Zoologia / UFPR. Caixa Postal 19020, 81531-980 Curitiba, PR, Brasil. Fone: 55 41 3361-1640 e-mail: mnavarro@ufpr.br Recebido em 26/07/2011 Aceito em 11/10/2011 Diversidade genética dos sorotipos 1 e 2 do vírus da dengue no Estado do Paraná, Brasil, a partir de um fragmento da região da junção capsídeo / pré-membrana Diversidade genética dos vírus dengue sorotipos 1 e 2, no Estado do Paraná, Brasil, baseada no fragmento da junção do gene capsídeo / pré-membrana Ana Caroline Dalla Bona 1, Adriana Lacerda Twerdochlib 1 eMário AntônioNavarro-Silva 1 RESUMO Introdução: A identificação precisa das variantes genéticas do enguevírus é importante para entender seus padrões de dispersão e virulência e para identificar as cepas responsáveis por surtos epidêmicos. Este estudo investigou as variantes genéticas do fragmento da região da junção capsídeo-pré-membrana nos sorotipos 1 e 2 do vírus da dengue (DENV1-2). Métodos: Amostras de 11 municípios do Estado do Paraná, Brasil, foram fornecidas pelo Laboratório Central do Paraná. Eles foram isolados da linha de cultura celular C6 / 36 ( Aedes albopictus) e foram positivos para imunofluorescência indireta. O ácido ribonucléico (RNA) extraído dessas amostras foi submetido à reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa (RT-PCR) e nested PCR. Resultados: O RT-PCR revelou que 4 das amostras estavam co-infectadas com ambos os serotipos. As sequências isoladas do DENV-1 foram 95-100% semelhantes às sequências de outras cepas do sorotipo 1 depositadas no GenBank. Da mesma forma, as sequências isoladas de DENV-2 foram 98-100% semelhantes a outras sequências de sorotipo 2 no GenBank. De acordo com nossa árvore de união de vizinhos, todas as cepas obtidas neste estudo pertenciam ao genótipo VofDENV-1. As cepas DENV-2, ao contrário, pertenciam aos genótipos americanos / asiáticos. Conclusões: O monitoramento de cepas circulantes é uma ferramenta importante para detectar a migração de subtipos de vírus envolvidos nas epidemias de dengue. Palavras-chave: Infecção concomitante. RT-PCR. Flavivirus. Variação genética. RETOMAR Introdução: A identificação da variante genética do vírus da dengue é importante para compreender a dispersão, virulência e identificação das cepas responsáveis pelas epidemias. O objetivo da pesquisa foi investigar uma variação genética do fragmento da junção do gene capsídeo / pré-membrana dos sorotipos 1 e 2. Métodos: Amostras de onze municípios do Estado do Paraná, Brasil, foram cedidas pelo Laboratório Central do Paraná e consistiam em solicitar a cultura de células da linhagemC6 / 36 ( Aedes albopictus), positivos para técnica de imunofluorescência indireta. O Ácido ribonucleico ( RNA) esse agente foi extraído, seguido da transcrição reversa, reação em cadeia da polimerase (PCR) e aninhado PCR. Resultados: Co-infecção por DENV-1 e 2 (vírus da dengue 1 e 2) foi observada em quatro pacientes, através da técnica Reação em cadeia da polimerase-transcriptase reversa ( RT-PCR). Para o DENV-1 a porcentagem de similaridade variou de 95 a 100% comparando com as cepas do Genbank. Para o DENV-2 a porcentagem de similaridade variou de 98 a 100%. De acordo com o cladograma gerado, todas as cepas deste estudo se agruparam no genótipo V para DENV-1. Para o oDENV-2 foi encontrada uma cepa referente ao genótipo asiático / americano. Conclusões: Omonitoramento das cepas circulantes torna-se uma ferramenta importante na detecção da migração dos subtipos do vírus da dengue afetada em epidemias. Palavras-chaves: Infecção simultânea. RT-PCR. Flavivirus. Variação genética. O vírus que causa a dengue pertence ao o genoma contém uma estrutura de leitura aberta (ORF) que codifica 3 proteínas estruturais e 7 não estruturais. As proteínas estruturais são: capsídeo (C), membrana (M) e envelope (E); e as proteínas não estruturais são NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, e NS5 1 O vírus da dengue exibe diversidade genética substancial, principalmente na existência de 4 sorotipos distintos e vários genótipos. As tentativas de identificar essas variantes genéticas foram feitas sequenciando certas regiões do genoma viral. Por exemplo, a proteína E, que é o principal alvo da seleção de vírus na natureza, foi sequenciada com frequência 2-4. No entanto, Singh e Seth 5 sugeriram que fragmentos da região de junção capsídeo-pré-membrana (CprM) podem ser uma alternativa mais rápida e barata para sequenciar regiões curtas. Desde então, o CprM tem sido usado por vários autores 6-8. Genes que codificam para proteínas não estruturais também foram sequenciados e usados em estudos de filogenia 9 Verificar a diversidade molecular do vírus da dengue é importante para avaliar o impacto dessas variantes genéticas na população humana, bem como a virulência, distribuição e origem das várias cepas. Neste estudo, caracterizamos geneticamente o fragmento da região da junção capsídeo-pré-membrana do vírus da dengue em pacientes com teste positivo para dengue em 2010. o gênero Flavivirus (Flaviviridae). Seu RNA de 11kb MÉTODOS As amostras, fornecidas pelo Laboratório Central do Paraná, foram isoladas da linhagem de cultivo celular C6 / 36 ( Aedes albopictus) e foram positivos para imunofluorescência indireta (IFA). As amostras de sangue humano foram coletadas de 298 RESULTADOS Bona ACD et al - Diversidade genética do vírus da dengue TABELA 1 - Amostras de pacientes de 11 municípios do Estado de Paraná, Brasil, com o vírus da dengue detectado por RT-PCR e imunofluorescência indireta. RT-PCR Região Norte Amostras Maringá Assaí Planaltina do Paraná Sertanópolis Alvorada do Sul Pato Bragado Realeza Toledo SãoMiguel do Iguaçu DENV-1 / DENV-2 Nova Aurora DENV-1 / DENV-2 Foz do Iguaçu DENV-1 RT-PCR: reação em cadeia da polimerase-transcriptase reversa; SE UM: ensaio de imunofluorescência; DENV: sorotipo do vírus da dengue. não diluído DENV-2 DENV-1 DENV-1 DENV-1 DENV-2 DENV-1 / DENV-2 DENV-1 / DENV-2 DENV-2 diluído 1/100 DENV-2 DENV-1 DENV-1 DENV-1 DENV-2 DENV-2 DENV-2 DENV-2 DENV-1 / DENV-2 DENV-1 DENV-1 / DENV-2 DENV-1 DENV-1 DENV-1 SE UM DENV-2 DENV-1 DENV-1 DENV-1 DENV-2 DENV-2 DENV-2 DENV-2 ocidental Março-maio de 2010, de casos autóctones na Estado do Paraná, Brasil. Até junho de 2010, 147 (37%) municípios apresentavam 15.012 casos autóctones de dengue 10 Os municípios foram amostrados na região oeste do Estado do Paraná (FozdoIguaçu, 25 ° 32 48 ″ S, 54 ° 35 17 ″ W; São Miguel do Iguaçu, 25 ° 20 ″ 49 ″ S, 54 ° 14 ″ 20 ″ W; Realeza, 25 ° 48 45 ″ S, 53 ° 33 45 ″ W; Toledo, 24 ° 41 15 ″ S, 53 ° 41 15 ″ W; Pato Bragado, 24 ° 41 15 ″ S, 54 ° 11 ″ 15 ″ W; e Nova Aurora, 24 ° 33 ″ 45 ″ S, 53 ° 18 ″ 45 ″ W) e região norte (Maringá, 23 ° 26 ″ 15 ″ S, 51 ° 56 ″ 15 ″ W; Assaí, 23 ° 18 45 ″ S, 50 ° 48 45 ″ W; Planaltina do Paraná, 23 ° 03′45 ″ S, 52 ° 56′15 ″ W; Sertanópolis, 23 ° 03 ″ 45 ″ S, 51 ° 03 ″ 45 ″ W; e Alvorada do Sul, 22 ° 48′45 ″ S, 51 ° 11′15 ″ W) ( Figura 1). A extração de RNA do sobrenadante celular foi conduzida usando um kit QIAmp Viral Mini (Qiagen, EUA), seguindo as instruções do fabricante Lanciotti et al. 11 Para obter cDNA, 2.000ng de RNA viral e 1μL do primer D2 (50pmol) foram colocados em um termociclador por 5min a 70 ° C. A amostra foi mantida em gelo e foram adicionados 5µL de tampão 5 ×, 0,5µL de dNTPs (200mM) e 20U de transcriptase reversa AMV (Promega). O volume da mistura foi aumentado para 25µL com a adição de água tratada com DEPC (0,1%). A amostra foi mantida em termociclador por 90 min a 42 ° C e 15 min a 70 ° C. O controle negativo continha água emvez de RNA. A reação de amplificação foi conduzida usando 3µL de cDNA, 2,5 µL de 10 × tampão, 1 µL de iniciador D1 (20pmol), 1 µL de iniciador D2 (20pmol), 1,5µL de MgCl 2 ( 25 mM), 0,5 µL de dNTPs (200 mM) e 3U de AmpliTaq Gold DNA polimerase (Applied Biosystems). O o volume da mistura foi levado a 25µL pela adição de água tratada com DEPC (0,1%). O seguinte programa de ciclagem foi usado para obter os produtos: 35 ciclos de 94 ° C por 30 s, 55 ° C por 1 min e 72 ° C por 2 min. Para PCR aninhado, 3 µL da primeira reação de amplificação (não diluído e diluído 1/100), 2,5 µL de tampão 10 ×, 1 µL de iniciador D1 (20pmol), 1 µL de cada iniciador TS1, TS2, TS3 e TS4 (20pmol), 1,5 µL de MgCl 2 ( 25 µM), 0,5 µL de dNTPs (200 µM) e 3U de AmpliTaq Gold DNA polimerase (Applied Biosystems) foram combinados. A mistura foi levada a 25 µl por adição de água tratada com DEPC (0,1%). O seguinte programa de ciclagem foi usado para obter os produtos: 20 ciclos de 94 ° C por 30 s, 55 ° C por 1 min e 72 ° C por 2 min. Os produtos amplificados foram visualizados em gel de agarose a 2%. A reação de purificação foi realizada usando um kit de purificação de PCR QIAquick (Qiagen) de acordo com as instruções do fabricante. As amostras foram enviadas ao Centro de Estudos do Genoma Humano (Universidade de São Paulo-São Paulo / SP) para sequenciamento em Analisador de DNA ABI 3730 (Applied Biosystems). As sequências de consenso foram obtidas usando o pacote Staden versão 1.5 12; alinhamento de sequência e tradução para aminoácidos foram realizados na versão BioEdit 7.0.0 13, uma ferramenta ClustalW 14 As sequências obtidas em nossas amostras foram comparadas com 39 sequências de várias partes de theworld disponível no GenBank. As análises filogenética e de similaridade de sequência foram realizadas usando o método de neighbour-joining implementado pelo programa Mega 4 15, usando o modelo de 2 parâmetros Kimura e 1.000 replicações de bootstrap. protocolo. Os primers eram os mesmos que em FIGURA 1 - Municípios do Estado do Paraná (Brasil) com suspeita de sangue infectado com o vírus da dengue foi coletado. A RT-PCR identificou 4 amostras de sangue humano que foram co-infectadas com DENV-1 e -2. Quando as amostras foram amplificadas com o primeiro produto de PCR sem diluição, 2 bandas de diferentes intensidades foram visualizadas no gel, mostrando os sorotipos com maior e menor número de cópias. No entanto, quando o primeiro produto de PCR foi diluído 100 vezes, apenas uma banda foi detectada, indicando o sorotipo predominante ( tabela 1 e Figura 2). Análise das sequências de 368 pb obtidas a partir das cepas CprMrevealed2 do DENV-1 com 14 sítios polimórficos: GenBank: JN086990 (Foz do Iguaçu eSertanópolis); GenBank: JN086991 (Planaltina do Paraná) A análise das sequências de 360 pb obtidas do mesmo gene revelou 1 cepa do DENV-2: GenBank: JN086992 (Alvorada do Sul e Pato Bragado). As 2 cepas DENV-1 foram distinguidas por 13 transições e 1 transversão.Transições: G ↔ A (locais 207 e 351); T ↔ C (locais 81, 267, 306, 309 e 360); UMA ↔ G (local 180); C ↔ T (locais 69, 276, 297, 350 e 354). Transversão: G ↔ C (local 264). As alterações foram observadas nos códigos 69 (Met → Ile ) e 117 (Ala → Val ) de DENV-1, substituições de tonucleotídeo correspondentes 299 Rev Soc BrasMed Trop 45 (3): 297-300, maio-junho de 2012 FIGURA 2 - Gel de agarose (2%) M: escada de 100 pb (Amresco); 1-4Amostras de RNA não amplificado; 5: não diluído (coinfecção com DENV-1e-2); 6: diluído 1/100 (DENV-2); 7-8: controle negativo; 9: não diluído (DENV-1); 10: diluído 1/100 (DENV-1); 11: não diluído (DENV-2); 10: diluído 1/100 (DENV-2). DENV-1 e DENV-2: vírus da dengue sorotipos 1 e 2, respectivamente. em 207 e 350 e 351, respectivamente. As substituições de aminoácidos ocorreram entre aminoácidos com propriedades bioquímicas semelhantes. As sequências do DENV-1 obtidas por nós foram 95-100% semelhantes às sequências das outras cepas do sorotipo 1 depositadas no GenBank. Da mesma forma, nossas sequências de DENV-2 foram 98-100% semelhantes a outras sequências de sorotipo 2 naquele banco de dados. De acordo com nossa árvore de união vizinha, todas as cepas obtidas neste estudo pertencem ao genótipo V do DENV-1. A cepa DENV-2 pertencia aos genótipos americanos / asiáticos ( Figuras 3 e 4). FIGURA 3 - Árvore de união de vizinhos para o fragmento da região de junção capsídeo-pré-membrana (CprM) de DENV-1. A árvore foi construída usando o modelo de parâmetro Kimura 2 e inclui sequências obtidas por nós e do GenBank. Os valores de bootstrap (1.000 réplicas) podem ser encontrados acima dos nós principais. FIGURA 4 - Árvore de união vizinha do fragmento da região de junção capsídeo-pré-membrana (CprM) de DENV-2. A árvore foi construída usando o modelo de parâmetro Kimura 2 e inclui sequências obtidas por nós e do GenBank. Os valores de bootstrap (1.000 réplicas) podem ser encontrados acima dos nós principais. DISCUSSÃO A coinfecção com múltiplos sorotipos do vírus da dengue é comum em áreas hiperendêmicas onde múltiplos sorotipos circulam 6,16, mais especialmente quando há uma alta densidade de vetores e pessoas suscetíveis à dengue. Infecção concomitante com DENV-1 e 2 em sangue humano foi relatada no Brasil por Rocco et al. 17, Santos et al. 18, e Cunha et al. 19 Além disso, foram relatadas infecções simultâneas por diferentes vírus da dengue em mosquitos 20 Fêmea A. aegypti pode ser capaz de transmitir os dois vírus simultaneamente 17 Pessanha et al. 21 detectou A. aegypti larvas que eram positivas para mais de 1 sorotipo, mostrando também que a infecção dupla pode ser passada para a prole via transmissão transovariana. A técnica de RT-PCR utilizada em nosso estudo foi mais eficiente do que a IFA para detectar a coinfecção. Testes repetidos confirmaram esses resultados obtidos com RT-PCR. Portanto, se tivéssemos usado apenas IFA neste estudo, a detecção de sorotipos teria sido subestimada. A substituição de metionina e alanina (aminoácido 69) por isoleucina e valina (aminoácido 117), respectivamente, observada em nossos resultados, havia sido identificada previamente na cepa JN086991 do DENV-1 isolada em amostras do Rio de Janeiro (GenBank: HQ026762) e São Paulo (GenBank: GU131863). As 2 cepas identificadas agrupadas com outras sequências do genótipo V, o único genótipo em circulação no Brasil até agora 22 Em 2001, Santos et al. 23 também sequenciei uma terceira coloração no Estado do Paraná, além das 2 cepas encontradas por nós, totalizando 3 cepas naquele estado. Dois subclados, A e B, agrupados na árvore de junção de vizinhos das sequências DENV-1 com suporte de bootstrap de 96%. A cepa DENV-1 JN086990 está mais intimamente relacionada às cepas isoladas na Guiana Francesa (GenBank: EU482591), Venezuela (GenBank: EU518605) e Porto Rico (GenBank: FJ850103). O JN086991 DENV-1 cepa do subclade B agrupada com as cepas brasileiras isoladas de 2008-2010. As cepas do genótipo V do DENV-1 são agrupadas em 2 ramos filogenéticos diferentes, refletindo uma divergência anterior. A cepa DENV-2 JN086992 agrupou-se com os genótipos americanos / asiáticos com 100% de suporte bootstrap e foi a mais próxima da cepa da Guiana Francesa (GenBank: EU518604) que foi isolada em 2006. O genótipo americano foi associado a cepas menos virulentas. Pode ter sido substituído pelo genótipo do sul da Ásia, uma vez que não foi isolado onde o genótipo do sul da Ásia atualmente circula. TheAmerican / AsianDENV-2 AF311956.1 Brasil 1997 Subclade A Subclade B Genótipo V AF514885.3 Argentina 2000 AF513110.1 Brasil Paraná 2001 AB519681.1 Brasil Brasília 2001 GQ868570.1 Colômbia 2008 F937644.1 Nicarágua 2009 HQ166037.1 México 2008 HQ026760.1 Brasil JN086990 Brasil Paraná 2010 EU482591.1 Guiana Francesa 2008 EU518605.1 Venezuela 2008 FJ850103.1 Puerto Rico 2006 AF514878.2 Paraguai 2000 FJ850090.1 Brasil 2007 FJ850084.1 Brasil 2005 JN086991 Brasil Paraná2010 HQ026762.1 Brasil Rio de Janeiro 2010 GU131863.1 Brasil São Paulo 2008 EF457905.1 Genótipo III AB195673.1 Genótipo IV AF180817.1 Genótipo II AF309641.1 Genótipo I 0,005 50 39 94 71 30 54 96 66 9151 49 63 54 35 42 57 51 44 HQ012528.1 Brasil Rio de Janeiro 2008 EU076554.1 Paraguai 2007 HQ012526.1 Brasil Rio de Janeiro 2007 FJ898453.1 Ilhas Virgens 2005 HM181971.1 Brasil São Paulo 2008 HQ012529.1 Brasil Rio de Janeiro 2009 AB122022.1 República Dominicana 2001 GQ199892.1 Jamaica 2007 EU518604.1 Guiana Francesa 2006 JN086992 Brasil Paraná 2010 HQ012531.1 Brasil Rio de Janeiro 2010 FJ639822.1 Venezuela 2006 EU687216.1 EUA Porto Rico 2005 FJ024477.1 Colômbia 2004 FJ898439.1 México 2008 HQ541792.1 Nicarágua 2008 AF276619.1 Genótipo cosmopolita AF100465.1 genótipo americano Genótipo americano / asiático AJ487271.1 genótipo asiático AF204178.1 Genótipo Asian II 0,01 74 88 55 100 20 40 51 86 54 29 25 300 AGRADECIMENTOS Os autores declaram não haver conflito de interesses. CONFLITO DE INTERESSES AJUDA FINANCEIRA REFERÊNCIAS O genótipo predominou no Brasil durante seus 19 anos de circulação (1991-2008). Foi sugerida uma associação entre certos genótipos DENV-2 e febre hemorrágica da dengue 24,25. Estudos evolutivos têm mostrado que a diversidade genética do vírus da dengue está aumentando e que mutações são responsáveis por isso. A diversidade genética nesse vírus também pode ser gerada por recombinação. Para que isso aconteça, diferentes genótipos do mesmo sorotipo viral toco-infectam o mesmo indivíduo, e os genomas que infectam a mesma célula forma híbrida de molécula de RNA. Infecção simultânea de A. aegypti por diferentes vírus durante surtos e epidemias, resultando em uma alta taxa de replicação viral, permitem o surgimento de alterações genéticas. O aumento da diversidade genética do vírus da dengue pode ter consequências graves, como vírus com uma gama ampliada de propriedades patogênicas e maior transmissibilidade e virulência 26-28. A incidência de subtipos do vírus da dengue, combinada com vários sorotipos circulando em um determinado local, pode gerar variação genética dentro dos sorotipos do vírus da dengue. Estudos que monitorem e sequenciem os sorotipos circulantes são importantes para rastrear esses eventos genéticos, a fim de diagnosticar as principais epidemias e a migração geográfica dessas cepas. Agradecemos a Anaclete Fellini, Secretaria de Estado da Saúde do Paraná, Laboratório Central do Paraná, para fornecer o indireto isolados de cultura de células positivas para fluorescência. ConselhoNacional dePesquisa eDesenvolvimento ( CNPq), processo Tecnologia e Ensino Superior ( SETI). # 305038 / 2009-5 e # 140231 / 2008-0 e Secretaria da Ciência, 1 GuzmanMG, HalsteadSB, ArtsobH, BuchyP, Farrar J, GublerDJ, et al. Dengue: uma ameaça global contínua. Nat RevMicrobiol 2010; 8: 7-16. Pandey BD, Morita K, Hasebe F, Parquet MC, Igarashi A. Evolução molecular, distribuição e relação genética entre os vírus da dengue 2 isolados de diferentes gravidades clínicas. Sudeste Asiático J Trop Med Public Health 2000; 31: 66-72. AraújoJM, NogueiraRM, SchatzmayrHG, ZanottoPM, BelloG. Filogeografia e história evolutiva do vírus da dengue tipo 3. Infect Genet Evol 2009; 9: 716-725. Ito M, Takasaki T, Kotaki A, Tajima S, Yuwono D, Rimal HS, et al. Análises moleculares e virológicas do vírus da dengue responsável pelo surto de dengue no leste de Timor em 2005. Jpn J Infect Dis 2010; 63: 181-184. SinghUB, SethP. Uso do sequenciamento de nucleotídeos dos fragmentos de cDNA genômico da região da junção capsídeo / pré-membrana para epidemiologia molecular do vírus da dengue tipo 2. Sudeste Asiático J Trop Med Public Health 2001; 32: 326-335. WangWK, ChaoDY, LinSR, KingCC, ChangSC. Infecções simultâneas por dois sorotipos do vírus da dengue entre pacientes com dengue em Taiwan. JMicrobiol Immunol Infect 2003; 36: 89-95. 2 3 4 5 6 7 Kukreti H, Chaudhary A, Rautela RS, Anand R, Mittal V, Chhabra M, et al. Surgimento de uma linhagem independente do vírus da dengue tipo 1 (DENV-1) e sua co-circulação com o DENV-3d predominante durante o surto de febre da dengue de 2006 em Delhi. Int J Infect Dis 2008; 12: 542-549. AnoopM, IssacA, MathewT, PhilipS, KareemNA, UnnikrishnanR, et al. Caracterização genética de sorotipos do vírus da dengue causando infecção simultânea em um surto em Ernakulam, Kerala, sul da Índia. Indian J ExpBiol 2010; 48: 849-857. Zhang JL, Jian R, Wan YJ, Peng T, An J. Identificação e análise filogenética do vírus DENV-1 isolado em Guangzhou, China, em 2002. Dengue Bulletin 2004; 28: 135-144. Secretaria de Estado da Saúde do Paraná (SESA). Boletim informativo dengue n.º 6/2010. Curitiba: Superintendência de Vigilância em Saúde. [Citado em 25 de julho de 2011] Disponível em: http://www.paranacontradengue.pr.gov.br/modules/ conteudo / conteudo.php? Conteudo = 3 / Lanciotti RS, Calisher CH, Gubler DJ, Chang GJ, Vorndam AV. Detecção e tipagem rápidas de vírus da dengue a partir de amostras clínicas por meio da Reação em Cadeia da Transcriptase Reversa-Polimerase. J ClinMicrobiol 1992; 30: 545-551. Staden R, Juiz DP, Bonfield JK. Métodos de montagem sequencial e acabamento. Methods BiochemAnal 2001; 43: 303-322. Hall TA. BioEdit: um editor de alinhamento de sequência biológica amigável e programa de análise para Windows 95/98 / NT. Nucleic Acids Symp Ser 1999; 41: 95-98. Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. Clustal W: melhorando a sensibilidade do alinhamento de sequência múltipla progressiva por meio de ponderação de sequência, penalidades de gap específicas da posição e escolha de matriz de peso. Nucl Acids Res 1994; 11: 4673-4680. TamuraK, Dudley J, NeiM, Kumar S.MEGA4: software MolecularEvolutionaryGenetics Analysis (MEGA) versão 4.0. Mol Biol Evol 2007; 24: 1596-1599. Gubler DJ. Dengue e febre hemorrágica da dengue. Clin Microbiol Rev 1998; 11: 480-496. Rocco IM, Barbosa ML, Kanomata EHN. Infecção simultânea por dengue 1 e 2 em paciente brasileira. Rev Inst Med Trop São Paulo 1998; 40: 151-154. SantosCLS, BastosMAA, SallumMAM, Rocco IM. Caracterização molecular de vírus da dengue tipo 1 e 2 isolados de infecção humana concorrente. Rev Inst Med Trop São Paulo 2003; 45: 11-16. Cunha AMM, Caiaffa WT, Oliveira CDL, Kroon EG, Pessanha JEM, Lima JA, et al. Fatores associados à infecção pelo vírus dengue no município de Belo Horizonte, estadodeMinasGerais, Brasil: características individuais ediferenças intra-urbanas. Epidemiol Serv Saude 2008; 17: 217-230. Cáceres RO. Detecção rápida de serotipos do vírus da dengue no mosquito Aedes aegypt eu. Rev PeruMed Exp Salud Publica 2003; 20: 156-158. Pessanha JEM, Caiaffa WT, Cecílio AB, Iani FCM, Araújo SC, Nascimento JC, et al. Cocirculação de dois sorotipos do vírus da dengue em amostras individuais e agrupadas de Aedes aegypti e Aedes albopictus larvas. Rev Soc Bras Med Trop 2011; 44: 103-105. Goncalvez AP, Escalante AA, Pujol FH, Ludert JE, Tovar D, Salas RA, et al. Diversidade e evolução do gene do envelope do vírus da dengue tipo 1. Virology 2002; 303: 110-119. SantosCND, RochaCFS, CordeiroM, FragosoSP, ReyF, DeubelV, et al. A análise genômica do vírus da dengue tipo 1 isolado entre 1990 e 2001 no Brasil revela uma notável conservação das proteínas estruturais, mas diferenças de aminoácidos nas proteínas não estruturais. Virus Res 2002; 90: 197-205. Rico-Hesse R, Harrison LM, Salas RA, Tovar D, Nisalak A, Ramos C, et al. Origens dos vírus da dengue tipo 2 associados ao aumento da patogenicidade nas Américas. Virology 1997; 23: 244-251. CruzACR, GallerR, SilvaEVP, SilvaMO, CarneiroAR, RosaEST, et al. Epidemiologia molecular dos sorotipos 2 e 3 do vírus da dengue isolados no Brasil de 1991 a 2008. Rev Pan-Amaz Saude 2010; 1: 25-34. WorobeyM, RambautA, HolmesEC. Recombinação intra-sorotípica generalizada em populações naturais do vírus da dengue. PNAS 1999; 96: 7352-7357. Holmes EC, Burch SS.As causas e consequências da variação genética no vírus da dengue. Trends Microbiol 2000; 8: 74-77. Weaver SC, Vasilakis N. Evolução molecular dos vírus da dengue: Contribuições da filogenética para compreender a história e epidemiologia da doença arboviral preeminente. Infect Genet Evol 2009; 9: 523-540. 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 Bona ACD et al - Diversidade genética do vírus da dengue
Compartilhar