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Cinética enzimática SABRINA BROETTO Cinética É o estudo da velocidade das reações, de como a velocidade varia em função das diferentes condições e quais os mecanismos de desenvolvimento de uma reação. Constante da velocidade (k): constante de proporcionalidade que relaciona velocidade e concentração. Tem valor constante a uma temperatura e varia com a temperatura” Cinética Uso de um processo enzimático baseia-se: O quão rápido irão ocorrer as reações Cinética No conhecimento da seletividade de uma enzima para um substrato Modelos simples para reações enzimáticas As enzimas são únicas no tipo de cinética que exibem. Cinética de Michaelis-Menten: modelo de equilíbrio rápido (reação enzimática mais simples). Ligação de S a E representa condições de equilíbrio entre as etapas de associação (E + S ES) e dissociação (ES E + S). (constante de eq. de 2ª ordem) (constante de eq. de 1ª ordem) Ordens de reação Ordem zero: a velocidade é uma constante, independente da concentração do reagente. Ex: reações fotoquímicas Primeira ordem: a velocidade é diretamente proporcional à concentração do reagente. Segunda ordem: dependência da velocidade com o quadrado da concentração do reagente. Modelos simples para reações enzimáticas ETAPA 1 ETAPA 2 ETAPA 1: Ligação de um substrato (S) a uma enzima (E), formando um complexo intermediário (ES). ETAPA 2: Formação do produto (P) a partir do complexo ES, com recuperação da forma livre da enzima (E). O modelo de Michaelis-Menten considera que uma reação enzimática ocorre em duas etapas: Modelos simples para reações enzimáticas Convenção bioquímica: representar o equilíbrio de ligação como processos de dissociação. Condição de equilíbrio para a ligação do substrato (S) é expressa como: Constante de dissociação ou de afinidade Constante de dissociação ou de afinidade Valor decrescente de , maior proporção de ES maior ligação ou afinidade entre E e S. Modelos simples para reações enzimáticas Segunda etapa da reação enzimática: etapa de catálise de ES E + P. É caracterizada pela constante de velocidade de 1ª ordem Velocidade inicial de uma reação enzimática pode ser representada como: Referência-modelo de equilíbrio rápido para cinética enzimática A taxa de formação de P, não perturba o equilíbrio de ligação entre E e S. Modelos simples para reações enzimáticas Abordagem cinética alternativa: V de decomposição de ES para formar P ( ) pode influenciar na proporção ou distribuição da enzima entre os estados E livre e ES. ESTADO ESTACIONÁRIO aquele em que, mesmo com as concentrações de S diminuindo e de P aumentando, não há variação da concentração dos intermediários da reação (ES) Por que? As duas reações acima estão acopladas (o produto da 1ª, é substrato da 2ª) Velocidade de formação de ES = Velocidade de decomposição de ES Modelos simples para reações enzimáticas No ESTADO ESTACIONÁRIO (“steady state”) temos: Rearranjo da equação Constante de Michaelis: medida da afinidade da E pelo S KM afinidade KM afinidade KM : definida pela [S]para o qual a velocidade de reação é a metade da velocidade máxima Se não houver nenhuma interferência sobre o substrato... catálise do complexo ES Expressões de velocidade para reações enzimáticas A reação de velocidade da reação enzimática pode ser definida como: v = Kcat [ES] [ET] [E] + [ES] Onde: v= velocidade inicial da reação Kcat= constante da velocidade limite da reação ET = enzima total E= enzima livre Expressões de velocidade para reações enzimáticas Adequando-se esta equação à reação de Michaelis, temos: v = Vmax x [S] (KM + [S]) Expressões de velocidade para reações enzimáticas Análise gráfica das reações enzimáticas A equação de Michaelis-Menten pode ser representada na forma inversa que representa uma equação do tipo y =ax+ b Essa é uma equação de reta (y = ax + b) em que: a inclinação (a) = KM/Vmáx e o intercepto (b) = 1/Vmáx Forma mais comum de determinação dos parâmetros cinéticos (KM e Vmáx). O gráfico dos duplos recíprocos determinação precisa de KM e Vmáx Na extrapolação dos dados experimentais, chega-se a 1/V= 1/Vmáx quando 1/[S] = 0; ou seja, quando a concentração de substrato for muito alta!!!! Se [S] >> KM v = Vmax ES E + P Kcat Se KM >> [S] v = Vmax x [S] KM E+S E + P Expressões de velocidade para reações enzimáticas Vmax/KM Constante combinada Medida da eficiência catalítica da reação Toda enzima está saturada com substrato Se V0=Vmax/2 Km = [S] Expressões de velocidade para reações enzimáticas Km corresponde à [S] necessária para se atingir a metade da velocidade máxima! Gráficos lineares na caracterização da ação de inibidores Formas diferentes Matematicamente equivalentes Resultados idênticos • Interferem na ligação do S ao sítio ativoInibidores competitivos • Não interferem na ligação do S ao sítio ativoInibidores não competitivos KM elevado Menor afinidade “envenenam” a enzima por redução da Vmax Obrigada!!!
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