prova de Biologia Molecular N1 e N2

Prévia do material em texto

1- O processo de replicação do DNA é relativamente simples, envolvendo diversas enzimas para que a síntese de uma nova fita de DNA seja realizada. Com base nas enzimas envolvidas no processo de replicação in vivo, analise as sentenças a seguir:
I- A enzima DNA polimerase realiza a adição de novos nucleotídeos à nova fita do DNA que está sendo sintetizada, podendo atuar de modo independente do sentido da fita (3'-5' ou 5'-3'), já que não necessitam de iniciadores.
II- As primases são enzimas responsáveis por adicionar primers (iniciadores) à fita de DNA que está sendo sintetizada, pois a DNA polimerase necessita de uma extremidade 3' disponível para a inserção do novo nucleotídeo.
III- As enzimas, DNA girase e helicase, são as responsáveis por abrir a dupla fita de DNA, e cortar as pontes de hidrogênio entre os nucleotídeos, permitindo, assim, a separação da fita e síntese de uma nova fita.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) Somente a sentença III está correta.
B) As sentenças I e II estão corretas.
C) Somente a sentença II está correta.
D) As sentenças II e III estão corretas.
2- Uma das técnicas essenciais em biologia molecular é a capacidade de sequenciar o gene de um organismo. Esse sequenciamento é importante, pois identifica possíveis mutações, cadeias de transmissão e origem da chegada do vírus a uma região específica. De acordo com as técnicas empregadas para o sequenciamento de DNA, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
( ) Os didesoxinucleotídeos (ddNTP) são utilizados para o sequenciamento com o método de Sanger, em que, posteriormente, faz-se a identificação da sequência com eletroforese.
( ) O pirosequenciamento tem como base a formação de pirofosfato a cada novo nucleotídeo adicionado à nova fita.
( ) O método empregado na plataforma Illumina foi a base para o desenvolvimento dos testes de sequenciamento que conhecemos atualmente, sendo a primeira geração de sequenciamento de DNA.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A) V - V - F.
B) V - F - V.
C) V - F - F.
D) F - F - V.
3-Através da técnica de eletroforese, ocorre a separação de moléculas em populações de tamanhos semelhantes, as quais são visualizadas como bandas no gel através de marcadores específicos. Sobre os marcadores para técnica de eletroforese em gel, assinale a alternativa CORRETA:
A) O marcador ideal para a técnica de eletroforese em gel será aquele capaz de separar as bandas de DNA em diferentes tons de cores.
B) O marcador ideal é o brometo de etídio, um corante fluorescente, que se liga ao DNA ou RNA e possibilita a sua visualização através de luz ultravioleta (UV).
C) O corante mais utilizado para marcação de DNA é o azul de brometo.
D) O corante ideal para eletroforese de DNA e RNA é aquele que não se liga ao DNA ou ao RNA, ficando somente na solução tampão da técnica.
4-O sequenciamento Shotgun, o qual é aplicado como estratégia para o sequenciamento de grandes sequências de nucleotídeos, especialmente genomas inteiros dos mais diversos organismos. Sobre o sequenciamento Shotgun, avalie as asserções a seguir e relação proposta entre elas:
I- Devido ao grande volume de informação gerado por esse procedimento, é necessário que programas computacionais sofisticados sejam utilizados para a determinação da sequência do material em estudo.
PORQUE
II- Na técnica Shotgun, o material clonado é sequenciado diversas vezes, fornecendo uma quantidade de dados de cerca de 10 vezes o tamanho do material genético que está sendo estudado, assegurando que todos os nucleotídeos presentes no material genético sejam detectados e inseridos na sequência final do DNA.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
B) As asserções I e II são proposições falsas.
C) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
D) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
5-A técnica da reação em cadeia da polimerase (PCR) se refere à replicação in vitro de um fragmento de DNA. Sobre o PCR, assinale a alternativa CORRETA:
A) O processo de replicação in vitro, depende do uso de primers (oligonucleotídeos sintéticos), com sequências de 18 a 22 nucleotídeos, que seja complementar ao gene de interesse.
B) A ligação dos primers à fita de DNA é denominado como desnaturação.
C) O processo do PCR não necessita da utilização de nucleotídeos.
D) A enzima DNA polimerase humana é uma das principais responsáveis pelo sucesso da técnica in vitro.
6- mais recente avanço no campo de sequenciamento de DNA foi o desenvolvimento de plataformas portáteis capazes de sequenciar grandes moléculas de DNA em pequenos equipamentos. Um exemplo dessas plataformas é a MinION. Sobre a plataforma MinION, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
I- Para que seja realizado o sequenciamento por meio da plataforma MinION, as amostras a serem sequenciadas são ligadas a enzimas de processamento. Essas enzimas induzem o fragmento de DNA a passar pelo nano poro, onde as variações da corrente elétrica são detectadas.
PORQUE
II- Sendo conhecidas as variações características de cada nucleotídeo, a sequência de nucleotídeos é formada rapidamente.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) As asserções I e II são proposições falsas.
B) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
C) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
D) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
7-Para construir uma biblioteca de DNA, utiliza-se técnicas de clivagem com enzimas de restrição e clonagem em vetor. Com base nas etapas para construção de uma biblioteca de DNA, ordene os itens a seguir:
I- Fragmentos de DNA são inseridos em vetores idênticos e ligados através da DNA ligase.
II- Clivado do DNA com uma enzima de restrição, formando centenas a milhares de fragmentos de DNA.
III- Inserção do vetor em células hospedeiras, produzindo a clonagem dos diferentes fragmentos.
IV- Extrair e isolar o DNA genômico de uma célula, tecido ou até mesmo de um organismo.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A) IV - II - I - III.
B) I - III - II - IV.
C) I - IV - III - II.
D) IV - II - III - I.
8-A técnica de eletroforese consiste na separação de moléculas de DNA, RNA ou proteínas em gel de agarose ou poliacrilamida. Essa separação se dá de acordo com o tamanho da molécula. Com base no processo de eletroforese em gel, analise as sentenças a seguir:
I- Uma corrente elétrica é transmitida através do gel do polo negativo ao polo positivo.
II- As moléculas de DNA são carregadas negativamente e são carregas por afinidade para o polo positivo.
III- Moléculas menores tendem a migrar com maior dificuldade no gel. Já as moléculas maiores, tendem a migrar mais facilmente.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) Somente a sentença II está correta.
B) As sentenças I e II estão corretas.
C) As sentenças I e III estão corretas.
D) Somente a sentença III está correta.
9- O qPCR (PCR em tempo real) utiliza corantes fluorescentes ou sondas específicas, que emitem fluorescência quando se encontram ligados ou intercalados à fita de DNA no meio de reação da PCR. Considerando esse fator, a fluorescência emita, é proporcional à quantidade de material disponível para iniciar a amplificação. Sobre os parâmetros para quantificação do qPCR, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
I- O threshold, também conhecido como linha de corte, demonstra o momento em que a fluorescência apresentada está livre de ruídos, sendo essencialmente a representação da amplificação da amostra teste.
PORQUE
II- O equipamento é capaz de determinar em que momento a fluorescência detectada é proveniente apenas das amostras que estão sendo amplificadas e, assim, determinar a linha de corte.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) As asserções I e II são proposições falsas.
B) As asserções I e IIsão proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
C) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
D) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
Questão cancelada
10- A clonagem de DNA se refere à produção, dentro de uma célula, de diversas cópias de uma sequência específica de um fragmento de DNA. Sobre o exposto, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
I- A clonagem de DNA depende da utilização de um vetor, do fragmento de DNA e, posteriormente, de um organismo hospedeiro.
PORQUE
II- O fragmento de DNA de interesse, será inserido em uma molécula de DNA genômico com capacidade de autorreplicação (DNA do vetor), originando o DNA recombinante. Essa inserção se dá através de enzimas de restrição e enzimas de ligação.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
B) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
C) As asserções I e II são proposições falsas.
D) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
1- Com a biotecnologia da transcriptômica, proteômica e metabolômica, tornou-se possível analisar todo o conjunto que esteja sendo expresso em um determinado tipo celular em diferentes fases de desenvolvimento de um organismo. Sobre as funções das "ômicas", avalie as asserções a seguir e relação proposta entre elas:
I- As "ômicas" permitem obter informações relativas à progressão de doenças, à influência de fatores ambientais sobre os processos biológicos que estejam sendo investigados, ou ainda, determinar biomarcadores específicos para uma determinada condição.
PORQUE
II- Com o desenvolvimento e aplicação das "ômicas" obtêm-se informações ou dados em larga escala, capazes de elucidar respostas biológicas complexas.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
B) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
C) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
D) As asserções I e II são proposições falsas.
2- Uma das abordagens efetuadas pela genômica funcional se trata da atribuição de anotações funcionais para os possíveis genes encontrados nos genomas. Para tanto, o genoma é vasculhado em busca de regiões que possivelmente codifiquem para proteínas. De acordo com o exposto, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
( ) A genética reversa se dá a partir da observação de um DNA ou de uma proteína que não se saiba qual a origem genética, ou seja, que não se tenha informação sobre os genes associados.
( ) Através da genética reversa, estuda-se a função de uma proteína desconhecida que pode ser investigada, de maneira reversa ao processo de síntese proteica.
( ) Os genes não podem ser submetidos a experimentos de mutagênese in vitro para a investigação de outras informações relativas à funcionalidade.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A) F - V - F.
B) V - V - F.
C) F - F - V.
D) V - F - F.
3- As informações obtidas no processo de digestão proteica são relativas à m/z dos diferentes peptídeos. Contudo, é de grande interesse que as sequências de aminoácidos que compõem as proteínas sejam também identificadas. De acordo com a detecção da sequência dos aminoácidos de uma proteína, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
( ) No processo de fragmentação dos íons peptídicos, são utilizadas técnicas que favorecem a formação de fragmentos que sejam opostos e complementares.
( ) A sequência de aminoácidos dos peptídeos pode ser deduzida por softwares apropriados para o sequenciamento, que podem formar a sequência completa da proteína.
( ) Os processos de dissociação induzida por colisão (CID) ou por transferência de elétrons (ETD) formam íons de massa molecular elevada, que são aplicados ao primeiro ciclo de cromatografia líquida.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A) V - F - F.
B) V - V - F.
C) V - F - V.
D) F - F - V.
4- Conhecendo estes conceitos básicos e sabendo que o processo de recombinação gênica que acontece na meiose é um processo ordenado em eucariotos, é possível inferir a frequência em que essa recombinação ocorre para cada um dos genes e, assim, determinar sua posição relativa no cromossomo. Sobre a recombinação cromossômica, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
I- Genes heterozigotos não geram nova conformação de alelo, uma vez que ambos os alelos são iguais. 
PORQUE
II- Genes homozigotos apresentam dois genes que podem se apresentar como dominantes ou recessivos.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
B) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
C) As asserções I e II são proposições falsas.
D) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
5- A genômica estrutural busca determinar qual é esse local e onde estão os marcadores associados a cada um dos genes encontrados. Sobre os termos utilizados para denominar os locais de um cromossomo, assinale a alternativa CORRETA:
A) O termo homólogo se refere aos diferentes cromossomos, que apresentam genes heterógenos.
B) O alelo se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado cromossomo.
C) O termo locus se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado cromossomo.
D) O termo locus se refere a uma das formas em que um gene pode ser encontrado em um cromossomo.
6- A sigla CRISPR vem do inglês Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats e pode ser traduzida como grupos de repetições palindrômicas curtas e regularmente interespaçadas. Já o Cas 9 se refere à nuclease que se encontra associada ao sistema CRISPR. Com base na técnica CRISPR-Cas9, analise as sentenças a seguir:
I- Uma molécula de RNA guia (gRNA) é inserida em uma sequência maior de RNA. Quando em contato com o DNA, o gRNA se liga uma a sequência específica do DNA, indicando para a enzima Cas9 onde o DNA deve ser cortado.
II- Os mecanismos de reparo de DNA presentes na célula é ativado e utilizado para a inserção, exclusão de pares de bases do DNA ou para efetuar a substituição de segmentos inteiros de DNA por segmentos de DNA personalizados.
III- Os efeitos da edição do genoma em células e animais experimentais, pois essa ferramenta se mostra bastante promissora para o tratamento de doenças relacionadas a determinados genes, como a fibrose cística e a hemofilia, e para auxiliar no tratamento de outras doenças, como o câncer.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) Somente a sentença II está correta.
B) As sentenças I, II e III estão corretas.
C) Somente a sentença I está correta.
D) Somente a sentença III está correta.
7- As ciências ômicas buscam o entendimento do funcionamento celular dos organismos e suas alterações biológicas. A era das diferentes ciências "ômicas" está intimamente relacionada entre si. Sobre as "ômicas", associe os itens, utilizando o código a seguir:
I- Transcriptoma.
II- Proteoma.
III- Metaboloma.
( ) Estudo das proteínas e enzimas expressas.
( ) Estudo dos metabólitos resultantes de processos biológicos.
( ) Estudo do RNA mensageiro, ou seja, quais genes são lidos.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A) II - III - I.
B) I - II - III.
C) I - III - II.
D) II - I - III.
8- No estudo metabolômico necessita-se da comparação do perfil de metabólitos entre distintas amostras, o que implica que o objetivo do estudo seja previamente definido para direcionar a extração quando ela for necessária, especialmente nos casos em que se deseja quantificar os metabólitos, pois cada solvente irá extrair um perfil diferenciado de metabólitos. Após a extração, os solventes devem ser evaporados para evitar contaminaçãonas etapas de fracionamento, detecção e quantificação. Sobre as técnicas para quantificação de metabólitos, associe os itens, utilizando o código a seguir:
I- Cromatografia gasosa - espectrometria de massas (GC-MS).
II- Cromatografia líquida-espectrometria de massas (LC-MS).
III- Ressonância magnética nuclear (RMN).
( ) Esta técnica permite a detecção simultânea dos diferentes tipos de metabólitos, não degradando as moléculas e permitindo que a amostra seja recuperada para análises posteriores.
( ) Técnica indicada para o fracionamento de composto apolares e de menor peso molecular, associada à espectrometria de massas, que detecta e mensura rapidamente a massa molecular e as quantidades de uma vasta gama de substâncias.
( ) Técnica acoplada à espectrometria de massas, com o objetivo de detectar e mensurar de modo rápido a massa molecular e as quantidades de uma vasta gama de substâncias. A técnica em si, é indicada para compostos polares, de maior peso molecular ou que não possam ser submetidos ao aumento de temperatura.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A) III - II - I.
B) I - II - III.
C) II - I - III.
D) I - III - II.
9- A era da genômica iniciou-se através do Projeto Genoma Humano, através do desenvolvimento de tecnologias que pudessem acelerar o processo. De acordo com o Projeto Genoma Humano, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
( ) A técnica do shotgun hierárquico utiliza dois vetores, sendo um deles o BAC (cromossomo artificial de bactéria), que permite a inserção de grandes fragmentos de DNA, sendo clonado para formação da biblioteca de DNA.
( ) A técnica do shotgun hierárquico utilizou o vetor plasmidial na etapa final da clonagem, onde cromossomo artificial de bactéria era fragmentado e inserido em vetores plasmidiais clonados com extremidades sequenciadas.
( ) A técnica do shotgun de genoma inteiro utilizou somente pequena parte do genoma completo de um organismo para formar vetor plasmidiais clonados com extremidades sequenciadas, que formavam os contigs.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A) F - F - V.
B) V - V - F.
C) V - F - F.
D) V - F – V
10- . Durante o Projeto Genoma Humano, duas grandes frentes de trabalho independentes foram organizadas, uma formada por cerca de 5.000 cientistas em um consórcio público e a segunda por meio da iniciativa privada da empresa Celera Genomics, cujo objetivo era patentear os genes sequenciados. Com base nas técnicas utilizadas para o sequenciamento, analise as sentenças a seguir:
I- O shotgun hierárquico sequenciava através da fragmentação do DNA total, que era clonado a partir de diferentes tamanhos de fragmentos de 2 mil, 10 mil e 130 mil pares de base.
II- O shotgun de genoma inteiro formava três bibliotecas de DNA, com diferentes tamanhos de fragmentos.
III- O shotgun hierárquico utilizava como vetor plasmídeos bacterianos comuns, a fim de sequenciar diferentes tamanhos de fragmentos do genoma completo.
Assinale a alternativa CORRETA:
A) Somente a sentença III está correta.
B) As sentenças I e II estão corretas.
C) Somente a sentença II está correta.
D) As sentenças I e III estão corretas