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RECAPITULAÇÃO DE CONCEITOS DE GENES E GENOMAS 1. Conceitue e diferencie, em termos gênicos ORF e CDS. CDS: regiões que codificam para proteínas ORFs: open Reading frame; qualquer sequência de RNA ou DNA que é delimitada por um códon de início e termino de tradução, com presença ou não de íntrons Ou seja: os CDS são apenas regiões que vão ser traduzidas em proteínas, enquanto o ORFs podem conter íntrons. 2. Defina gene ortólogo, parálogo e xenólogo. Órtologo: genes com a mesma origem evolutiva, mas que um deles sofreu uma mutação, geralmente causada por especiação. Cada indivíduo possui uma cópia do gene que possui funções parecidas nas duas espécies. Parálogo: genes com a mesma origem evolutiva que sofreram um processo de duplicação, resultando em pressões seletivas diferentes. O gene copiado e o gene relacionado podem ter funções parecidas, mas nunca iguais. Xenólogo: genes oriundos de uma transferência horizontal, ou seja, o organismo transferiu o gene para uma célula que não era sua descendente. 3. Se compararmos um determinado gene hipotético X da levedura Saccharomyces cerevisiae com o seu ortólogo de camundongo, o último apresentará um tamanho potencialmente maior. Qual a potencial razão disto? Provavelmente o gene de camundongo possui mais íntrons que o da levedura. 4. Existem elementos que delimitam o sítio de início de replicação nos genomas dos diferentes organismos? Em caso positivo há sequências que os caracterizam? Exemplifique. Sim, existem os promotores, os operons, os operadores, os UAS. Essas sequências são bem conservadas e podem ser facilmente identificadas nos organismos, principalmente em procariontes. Em eucariontes a predição é mais difícil. 5. Quais as possíveis combinações de códons presentes no código genético poderiam dar origem ao peptídeo hipotética cuja sequência é MCRI? M → Metionina → AUG C → Cisteína → UGU e UGC R → Arginina → CGU, CGG, CGA, CGC I → Isoleucina → AUU, AUC, AUA Ou seja, poderíamos ter 36 combinações para formar o peptídeo. 6. De acordo com quais características físico químicas podem ser classificados os 20 aminoácidos geralmente encontrados em sequências proteicas? São anfóteros, possuem características ácidas (pela presença do grupo carboxílico) e básicas (pela presença do grupo amina). São sólidos com solubilidade variável em água e apresentam atividade óptica porque possuem carbono assimétrico.
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