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Regulação da expressão gênica em eucariotos – Genética I @bomdialaura Regulação da expressão gênica em eucariotos • A regulação gênica consiste em regular o processo da síntese (momento e taxa) de um transcrito (RNA); • A regulação gênica ocorre em muitos níveis, controlando- se: ֍ A transcrição do DNA em RNA; ֍ A tradução do RNA em proteína; ֍ No nível do mRNA (por alterações na recomposição ou estabilidade do mRNA); ֍ E após a tradução (por modificação das proteínas); • Duas categorias gerais: ֍ Regulação gênica transcricional; ֍ Regulação gênica pós-transcricional; • Mecanismo fundamental: sinais moleculares externos/internos → proteínas regulatórias → ligação a regiões adjacentes aos genes → modulação da taxa de transcrição (atividade da RNA polimerase); Diferenças fundamentais nos mecanismos subjacentes e na maquinaria Procariotos Eucariotos • Proteínas ativadoras ou repressoras únicas; • Organização em operons; • Atividade de fatores sítio-específicos; • O DNA bacteriano não tem nucleossomos; • A maioria dos genes não é encontrada em operons; • Muitos “interruptores” separados por gene, e as sequências reguladoras desses interruptores quase sempre estão situados longe dos promotores; • O acesso aos promotores gênicos eucarióticos é restrito pela cromatina; • Genomas maiores; • Regulação é mais complexa e requer mais tipos de proteínas reguladoras e de interações com regiões reguladoras adjacentes do DNA; • O DNA eucariótico é compactado em nucleossomos, formando cromatina; • A estrutura da cromatina é dinâmica e é um ingrediente essencial na regulação gênica; • Nucleossomos estão posicionados de modo a bloquear o promotor; • A estrutura da cromatina tem de ser mudada para ativar a transcrição eucariótica; • A estrutura da cromatina ao redor de genes ativados ou reprimidos é estável e herdada pelas células filhas; • Eucariotos: ֍ RNA polimerase II é muito maior e mais complexa; o Deve sintetizar RNA e coordenar os eventos únicos de processamento especial em eucariotos; ֍ Os eucariotos multicelulares podem ter até 25.000 genes; ֍ Os padrões de expressão eucariótica podem ser extraordinariamente complexos; ֍ A regulação gênica eucariótica deve ser capaz de: o Garantir que a expressão da maioria dos genes no genoma esteja desligada em algum momento, embora ativada em um subgrupo de genes; o Gerar milhares de padrões de expressão gênica; Regulação da expressão gênica em eucariotos – Genética I @bomdialaura Diversidade de padrões de expressão • A maquinaria necessária para gerar tantos padrões de transcrição gênica in vivo tem muitos componentes, incluindo tanto proteínas reguladoras, quanto sequências reguladoras de ação cis; • Dois grupos: 1- O grande complexo de RNA polimerase II e os fatores gerais de transcrição; o Proteínas que interagem com elementos proximais do promotor, perto do promotor de um gene; 2- Fatores de transcrição que se ligam em sequências reguladoras de ação cis no DNA → acentuadores; o Distantes dos promotores gênicos; As proteínas reguladoras apresentam um ou mais dos seguintes domínios funcionais • Domínio que reconhece uma sequência reguladora no DNA (o sítio de ligação da proteína do DNA); • Domínio que interage com uma ou mais proteínas do aparelho de transcrição (RNA polimerase ou uma proteína associada à RNA polimerase); • Domínio que interage com as proteínas ligadas a sequências reguladoras vizinhas no DNA de tal modo que atuam cooperativamente para regular a transcrição; • Domínio que influencia na condensação da cromatina, seja direta ou indiretamente; • Domínio que atua como um sensor de condições fisiológicas dentro da célula; Acentuadores • Acentuadores: são sequencias reguladoras com sítios de ligação que são necessários para a ativação gênica in vivo; • Sequências de ativação antecedentes (UAS): são acentuadores antecedentes aos genes que regulam; • Ex: Gal4 regula vários genes pelas sequências de ativação antecedentes aos genes; Domínios de ativação • Um distinto proteína Gal4 → domínio de ativação → é necessário para a atividade reguladora; • A proteína Gal4 tem domínios de ligação e ativação separáveis; • Dois domínios: 1- Um para a ligação ao DNA; 2- Outro para ativação da transcrição; Ativadores recrutam a maquinaria transcricional • Dois mecanismos importantes: 1- Os ativadores interagem com subunidades dos complexos proteicos e atuam no início da transcrição; 2- Os ativadores recrutam proteínas que modificam a estrutura da cromatina, permitindo que a RNA polimerase II e outras proteínas tenham acesso ao DNA; • Complexo mediador: um grande complexo de várias proteínas que interagem diretamente com a RNA polimerase II para recrutá-la para os promotores gênicos; Regulação da expressão gênica em eucariotos – Genética I @bomdialaura ֍ Coativador: uma proteína ou complexo proteico que facilita a ativação gênica por um fator de transcrição; ֍ Em si, não é parte da maquinária de transcrição nem é uma proteína de ligação do DNA; Efeito da organização do DNA genômico nos eucariotos • A unidade básica da cromatina é o nucleossomo; • Os genes eucarióticos estão inacessíveis e “desligados”, a menos que ativados; • Herança epigenética: a herança de estados da cromatina de uma geração celular para a seguinte; • Cromatina dinâmica → remodelagem da cromatina; ֍ A cromatina pode ser dinâmica; ֍ Os nucleossomos são estão em posições necessariamente fixas no cromossomo; ֍ O octâmero de histonas desliza em resposta à atividade de remodelagem da cromatina; ֍ A remodelagem da cromatina muda a densidade do nucleossomo ou a posição, e é parte integrante da regulação gênica eucariótica; Histonas e remodelagem da cromatina • Histonas: as proteínas mais conservadas na natureza; • Pontas aminoterminais → caudas de histonas; • Código de histonas: ֍ A modificação covalente das caudas de histonas é chamada de código de histonas; ֍ Para o código de histonas, a informação é armazenada nos padrões de modificação de histonas, e não na sequência de nucleotídeos; Acetilação / Desacetilação • Altera a interação dos nucleossomos com o DNA e o octâmero de histonas; • Altera a interação entre os nucleossomos adjacentes; • Influencia a ligação das proteínas reguladoras ao DNA; Herança epigenética • Herança das modificações de histonas e estrutura da cromatina; • Metilação do DNA: outra marca que influencia a estrutura da cromatina; Sítios de ligação em acentuadores / complexo acentuassomo Regulação da expressão gênica em eucariotos – Genética I @bomdialaura • Um acentuador pode catalisar a formação de um acentuassomo (enhanceosome); • Efeito sinérgico: ligação desses fatores a sítios que estão separados pela distância correta leva a um efeito amplificado, ou superaditivo, no sentido de ativar a transcrição; Isoladores de bloqueio de acentuador
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