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Tradução Aminoácidos e peptídeos Os aminoácidos apresentam um carbono ligado a um grupamento amino, um grupamento carboxílico, um hidrogênio e uma cadeia lateral, que varia entre os diferentes aminoácidos. Os aminoácidos se ligam entre si através de ligações peptídicas. A ligação peptídica sempre ocorre entre o grupamento amino de um aminoácido e o grupamento carboxílico de um outro aminoácido. Essa ligação envolve a liberação de uma molécula de água e a ligação do carbono do grupo carboxílico com o nitrogênio do grupamento amino. A extremidade com o gurpamento amino livre é chamada amino-terminal e a extremidade com o grupamento carboxílico livre é chamada de carbox-terminal. DNA, RNA e proteínas As moléculas de DNA são formadas por 4 nucleotídeos diferentes: adenina, timina, guanina e citosina. As moléculas de RNA são formadas por 4 nucleotídeos: adenina, uracila, guanina e citosina. Existem combinações de 3 nucleotídeos do RNA mensageiro, que determinam os códons. CÓDON = sequência de 3 nucleotídeos do RNA mensageiro. O código genético é universal Independente do organismo, o códon determina o mesmo aminoácido. O código genético é degenerado Um mesmo aminoácido pode apresentar mais de um códon correspondente. Os códons UAA, UAG e UGA são códons de parada, eles determinam o fim da síntese proteica. O códon AUG é um códon de início de síntese proteína e também corresponde ao aminoácido metionina. O RNA transportador apresenta em sua estrutura uma sequência de três nucleotídeos que é denominado anticódon, de modo que o anticódon é complementar ao códon. PAREAMENTO WOOBLE: Pareamento em que a terceira posição entre o anticódon e o códon não é perfeito. Em resumo No núcleo ocorre o processo de replicação e o processo de transcrição. A molécula de RNA mensageiro é sintetizado e processado no núcleo, mas é no citoplasma que ele serve de molde para a síntese das proteínas. A fita de RNA mensageiro é reconhecida pelos ribossomos e determina a sequência de aminoácidos nas proteínas. Essas proteínas então são processadas até adquirirem seu endereço e conformação. Primeira etapa da síntese proteica: ativação de aminoácidos Consiste na ligação do aminoácido ao RNA transportador. Essa ligação acontece a partir da enzima aminoacil-RNAt sintase. Essa enzima apresenta três sítios: um para a ligação de RNAt, um para a ligação do aminoácido e outro para a ligação da molécula de ATP. Há então o consumo de uma molécula de ATP, que é convertida em AMP, e a ligação do aminoácido ao RNAt específico. Assim, existe uma aminoacil-RNAt sintase específica para cada dupla RNAt e aminoácido correspondente. Segunda etapa da síntese proteica: início da tradução Se dá pela formação do complexo de iniciação. A formação do complexo de iniciação se dá pela união entre a subunidade maior e menor do ribossomo, a molécula de RNA mensageiro e o RNA transportador carregando o aminoácido. Como todo início da síntese proteica começa com AUG, esse aminoácido será a metionina. Então quando se forma o complexo subunidade ribossomal maior, subunidade ribossomal menor, RNA mensageiro, RNA transportador e metionina, dizemos que está iniciando a sintese proteica, pois o complexo de iniciação foi formado. Ribossomos Os ribossomos são formados por RNA ribossômicos e proteínas. Em células procarióticas, os ribossomos são formados por uma subunidade maior 50S e uma subunidade menor 30S, enquanto que nas células eucarióticas os ribossomos são formados por subunidades maiores 60S e subunidades menores 40S. Em procariotos o ribossomo é denominado 70S e em eucariotos 80S. Drogas que interferem na síntese proteica Alguns antibióticos como a estreptomicina, neomicina, gentamicinas, tetraciclinas, cloranfenicol interferem na síntese proteica. Algumas dessas drogas interfere apenas na síntese proteica de procariotos e outras interferem na síntese proteica de eucariotos. Isso acontece pois são capazes de reconhecerem ribossomos de tipos diferentes. No citoplasma Quando a molécula de RNA mensageiro chega ao citoplasma, ela é reconhecida por alguns fatores resultantes das modificações do processamento pós-transcrição para que haja então o início da síntese proteica. Terceira etapa da síntese proteica: elongação Neste processo é sintetizada a cadeia da proteína. O ribossomo inicia o processo de leitura do RNA mensageiro na extremidade 5’ e vai lendo todos os códons até a extremidade 3’ do RNA mensageiro. A proteína é sintetizada da extremidade N-terminal para a extremidade carboxi-terminal (C-terminal). A mesma fita de RNA mensageiro é lida ao mesmo tempo por centenas de ribossomos, todos eles começando na extremidade 5’ e terminando na extremidade 3’, embora não iniciem o processo juntos. Quando se forma o complexo de início da tradução, no ribossomos se formam dois sítios: O sítio A (aminoacil) e o sítio P (Peptidil). O primeiro RNA transportador, que traz o aminoácido metionina, e reconhece o códon AUG do RNA mensageiro sempre será posicionado no sítio P. O segundo RNA transportador, que traz o segundo aminoácido vai ser incorporado no sítio A. Quando ocorre o pareamento dos dois RNAs no sítio A e no sítio P, cada um carregando um aminoácido, ocorre a ligação peptídica entre os dois aminoácidos. Essa ligação peptídica é feita por uma ribozima localizada no ribossomo, a peptidiltransferase. O complexo ribossômico é deslocado ao longo do RNA mensageiro por uma enzima chamada translocase. Esse processo de entrada de novos RNA transportadores e deslocamento ocorre sucessivamente até que o códon de parada seja lido. Esse processo de deslocamento do complexo ribossômico envolve gasto energético, cada códon lido leva ao gasto de uma molécula de GTP. Ao atingir o STOP-CÒDON, o complexo se desfaz e a molécula de RNA é degradada, terminando a síntese proteica. Processamento pós-tradução 99% das proteínas são sintetizadas por ribossomos associados ao retículo endoplasmático (complexo membranoso que envolve o núcleo). A síntese de proteínas também pode acontecer por ribossomos livres no citoplasma, mas isso envolve menos de 1% das proteínas. Após a síntese, as proteínas são transportadas em vesículas para o Complexo de Golgi. Inicialmente, no complexo de Golgi há a remoção de 20 a 30 aminoácidos da porção N- terminal, o que corresponde a remoção do peptídeo sinal. A transformação mais importante que acontece no complexo de Golgi é o processo de Glicosilação. O processo de glicosilação consiste na adição de açúcares e é importante para sinalizar a conformação final da proteína e seu endereçamento. Endereçamento após processamento pós-tradução Após o processamento pós-tradução, a proteína é direcionada para o local onde exercerá sua função. Uma proteína que participa do ciclo de Krebs, por exemplo, é direcionada para a matriz mitocondrial. Este processo de endereçamento é muito direcionado pela glicosilação. A remoção do peptídeo sinal também é importante para a conformação final da proteína. Degradação de proteínas O processo de degradação de proteínas é chamado de ubiquitinação. A ubiquitina é um peptídeo pequeno de 11 a 14 aminoácidos. A ubiquitina é inserida em proteínas por uma série de enzimas e envolve o gasto de ATP. Esse processo de ubiquitinação leva ao endereçamento dessas proteínas para os proteossomos, organelas ricas em proteases, levando a degradação proteica.