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4° TERMO NOME: AMANDA AP. DE LIMA BUENO PROFESSORA: FABIANA VENEGAS DATA:26/09/2021 QUAIS OS TRÊS COMPONENTES BÁSICOS PARA QUE OCORRA O PROCESSO DE REPLICAÇÃO? QUAL O SENTIDO DA REPLICAÇÃO? QUAL O NOME DOS 2 FILAMENTOS DE DNA NA HORA DA REPLICAÇÃO? QUAL A DIFERENÇA ENTRE O FILAMENTO LEADING E O FILAMENTO LAGGING? QUAL O PROBLEMA QUE TEMOS NO FILAMENTO LAGGING, E COMO ISTO É SUPERADO? O QUE SÃO FRAGMENTOS DE OKAZAKI? 1 AÇUCAR, 1 BASE NITROGENADA, 3 FOSFATOS OS NUCLEOTÍDEOS SÃO UNIDOS UM DE CADA VEZ À PONTA 3’ DE UM FILAMENTO RECÉM-SINTETIZADO. ENTÃO, NOVOS FILAMENTOS DE DNA SEMPRE SE ALONGAM NO MESMO SENTIDO (5’→3’). A SÍNTESE NAS DUAS FITAS OCORRE EM SENTIDOS CONTRÁRIOS... A MEDIDA QUE O DNA SE DESELICOIDIZA, O FILAMENTO MOLDE QUE É EXPOSTO NO SENTIDO 3’→5’ PERMITE QUE OUTRO FILAMENTO SEJA SINTETIZADO CONTINUAMENTE NO SENTIDO 5’→3’. A SÍNTESE DE DNA DEVE COMEÇAR NOVAMENTE NA FORQUILHA DE REPLICAÇÃO E CONTINUAR NO SENTIDO OPOSTO AO DO MOVIMENTO DA FORQUILHA ATÉ CHEGAR AO SEGMENTO JÁ REPLICADO DO DNA. ESTE PROCESSO É REPETIDO VÁRIAS VEZES, EM FLUXOS CURTOS E DESCONTÍNUOS. DNA POLIMERASE E DNA LIGASE NO FILAMENTO LEADING – É NECESSÁRIO APENAS UM PRIMER. NO FILAMENTO LAGGING – É NECESSÁRIO UM NOVO PRIMER NO COMEÇO DE CADA FRAGMENTO DE OKASAKI. SÃO OS CURTOS TRECHOS DE DNA PRODUZIDOS POR REPLICAÇÃO DESCONTÍNUA, DEPOIS SÃO UNIDOS E FORMAM UMA MOLÉCULA CONTÍNUA. (O NOME EM HOMENAGEM A REIJI OKAZAKI QUE OS DESCOBRIU) Questões de replicação Aula 4 CITE OS 4 ESTÁGIOS DO MECANISMO DE REPLICAÇÃO. ESCREVA SOBRE COMO OCORRE O PROCESSO DE INICIAÇÃO EM BACTÉRIAS. ESCREVA SOBRE COMO OCORRE O PROCESSO DE DESELICOIDIZAÇÃO. CITE AS PROTEÍNAS NECESSÁRIAS NO PROCESSO DE DESELICOIDIZAÇÃO. QUAL A FUNÇÃO DA HELICASES? QUAL A FUNÇÃO DAS PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO UNIFILAMENTAR? QUAL A FUNÇÃO DA DNA-GIRASE? O QUE SÃO PRIMERS? QUAL A FUNÇÃO DA PRIMASE? INICIAÇÃO, DESELICOIDIZAÇÃO, ALONGAMENTO E TÉRMINO. AS PROTEÍNAS INICIADORAS LIGAM-SE A ORIC E FAZEM COM QUE UM TRECHO DE DNA SE DESENROLE, E ISTO VAI PERMITIR QUE A HELICASE E OUTRAS PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO UNIFILAMENTAR SE LIGUEM AO FILAMENTO POLINUCLEOTÍDICO. É NECESSÁRIO VÁRIAS PROTEÍNAS E ENZIMAS PARA REALIZAR A DESELICOIDIZAÇÃO. HELICASES, PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO UNIFILAMENTAR, DNA- GIRASE. A PRIMASE SINTETIZA PRIMERS PARA QUE A REPLICAÇÃO SEJA INICIADA. É UM TRECHO CURTO DE NUCLEOTÍDEOS DE RNA (COM CERCA DE 10-12 NUCLEOTÍDEOS DE TAMANHO), QUE FORNECE UM GRUPO 3’-OH AO QUAL A DNA POLIMERASE PODE PRENDER OS NUCLEOTÍDEOS DE DNA. HELICASES, PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO UNIFILAMENTAR, DNA- GIRASE. QUEBRAM AS PONTES DE H QUE EXISTEM ENTRE NUCLEOTÍDICOS. PARA ESTABILIZAR O DNA UNIFILAMENTAR (PARA NÃO REELICOIDIZAR). É UMA ENZIMA QUE CONTROLA A SUPERELICOIDIZAÇÃO DO DNA. REDUZ A FORÇA TORCIONAL QUE SE ACUMULA DIANTE DA FORQUILHA DE REPLICAÇÃO. SÃO TRECHOS CURTOS DE NUCLEOTÍDEOS SINTETIZADOS POR UMA ENZIMA CHAMADA PRIMASE. SINTETIZA PRIMERS PARA QUE A REPLICAÇÃO SEJA INICIADA. PORQUE NO FILAMENTO LAGGING SÃO NECESSÁRIOS VÁRIOS PRIMERS? ESCREVA SOBRE COMO OCORRE O ALONGAMENTO NA FASE DA REPLICAÇÃO. QUAL A FUNÇÃO DA POLIMERASE III? QUAL A FUNÇÃO DA DNA-LIGASE? COMO OCORRE O TÉRMINO DA REPLICAÇÃO? PARA QUE SERVE O PROCESSO DE REVISÃO? QUAL A ENZIMA QUE ESTÁ PRESENTE NESTA FASE? COMO FUNCIONA O PROCESSO DE REPARO DE PAREAMENTO ERRADO? APÓS ADIÇÃO DOS PRIMERS, AS DNA POLIMERASES ALONGAM O FILAMENTO. PERMITE ADICIONAR NOVOS NUCLEOTÍDEOS NO SENTIDO 5’→3’ SUA ATIVIDADE DE EXONUCLEASE LHE PERMITE REMOVER NUCLEOTÍDEOS NO SENTIDO 3’→5’, CAPACITANDO-A A CORRIGIR ERROS. APÓS A POLIMERASE TER SUBSTITUÍDO O ÚLTIMO NUCLEOTÍDEO DO PRIMER DE RNA POR UM DNA, PERMANECE UM CORTE NA SEQÜÊNCIA DO NOVO FILAMENTO. ESTE CORTE É SELADO PELA ENZIMA DNA-LIGASE, QUE CATALISA A FORMAÇÃO DE UMA LIGAÇÃO FOSFODIÉSTER SEM ADICIONAR OUTRO NUCLEOTÍDEO AO FILAMENTO. EM ALGUMAS MOLÉCULAS DE DNA, A REPLICAÇÃO TERMINA SEMPRE QUE SE ENCONTRAM 2 FORQUILHAS DE REPLICAÇÃO. EM OUTRAS, SEQÜÊNCIAS ESPECÍFICAS DE TÉRMINO BLOQUEIAM UMA REPLICAÇÃO POSTERIOR. UMA PROTEÍNA DE TÉRMINO EM E.COLI (TUS) BLOQUEIA O MOVIMENTO DA HELICASE, PARANDO A FORQUILHA DE REPLICAÇÃO. O POSICIONAMENTO DE UM NUCLEOTÍDEO ERRADO, PARA A REAÇÃO DE POLIMERIZAÇÃO, E A ATIVIDADE DE EXONUCLEASE 3’→5’ DA DNA- POLIMERASE REMOVE O NUCLEOTÍDEO INCORRETAMENTE PARADO, E DEPOIS INSERE O NUCLEOTÍDEO CORRETO (ERRO DE 1 EM 10 MILHÕES DE NUCLEOTÍDEOS). CORRIGE ERROS APÓS A REPLICAÇÃO COMPLETA. QUALQUER NUCLEOTÍDEO INCORRETAMENTE PAREADO PRODUZ UMA DEFORMIDADE NA ESTRUTURA SECUNDÁRIA DO DNA. ESTA DEFORMIDADE É RECONHECIDA POR ENZIMAS QUE REMOVEM UM NUCLEOTÍDEO INCORRETO E O SUBSTITUI. ESTE REPARO REQUER HABILIDADE DA ENZIMA DE RECONHECER A FITA NOVA DA VELHA. (GRUPOS METILA –CH3 SÃO ADICIONADOS A FITA ORIGINAL (METILAÇÃO), E O REPARO SÓ OCORRE NO FILAMENTO DE NUCLEOTÍDEOS NÃO METILADOS)
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