O microscópio de varredura é o que revela aspectos tridimensionais de estrutura. Ele utiliza um feixe de elétrons para criar uma imagem em três dimensões da amostra, permitindo uma visualização mais detalhada da superfície. Já o microscópio de transmissão é utilizado para visualizar estruturas internas de células e tecidos, enquanto o microscópio óptico é limitado pela resolução e não permite a visualização de estruturas muito pequenas. O microscópio eletrônico também é capaz de visualizar estruturas em alta resolução, mas é mais utilizado para análises em nível molecular.
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