Quando um agente infeccioso está presente no ambiente porém não causa adoecimento podemos definir a história natural da doença no período

A presença de um agente infeccioso no ambiente sem causar adoecimento é conhecida como período de incubação da doença. Durante esse período, o agente infeccioso está se multiplicando e se espalhando no corpo do hospedeiro, mas ainda não causou sintomas. Após o período de incubação, a doença pode progredir para o período de sintomas, onde o hospedeiro começa a apresentar sinais e sintomas da doença.