O gânglio linfático apresenta uma cápsula de tecido conjuntivo denso que envia septos para o interior do órgão dividindo o parênquima em compartimentos incompletos. A zona cortical (logo abaixo da cápsula) é constituída por nódulos linfáticos, tecido linfóide frouxo que forma seios subcapsulares e peritrabeculares. Os seios são espaços delimitados por células reticulares e macrófagos fixos. Além dessas estruturas, apresenta nodos linfáticos com seus centros germinativos. A zona medular é constituída por cordões medulares formados por tecido linfóide denso, seios medulares de tecido linfóide frouxo e numerosos vasos sanguíneos. A zona paracortical (entre a zona cortical e a zona medular) é constituída por tecido linfóide denso e linfócitos T.
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