Para responder a essa pergunta, precisamos entender qual órgão é responsável pela declaração de utilidade pública para desapropriação ou instituição de servidão administrativa no contexto dos serviços de transporte. Analisando as alternativas: A) do Sistema Federal de Viação - Este é um sistema, mas não é um órgão específico que realiza a declaração. B) das Agências Nacionais de Transportes - As agências reguladoras têm funções específicas, mas a declaração de utilidade pública não é uma delas. C) do Ministério dos Transportes por meio da Presidência da República - O Ministério dos Transportes tem um papel importante, mas a declaração é feita por um órgão específico. D) do Departamento Nacional de Infra-estrutura de Transportes - Este departamento é responsável pela infraestrutura de transportes e pode ter a competência para declarar a utilidade pública. E) do Conselho Nacional de Integração de Políticas de Transportes - Este conselho atua em um nível mais estratégico e não é o responsável direto pela declaração. A alternativa correta, que se alinha com a competência para declarar a utilidade pública para desapropriação ou servidão administrativa, é: D) do Departamento Nacional de Infra-estrutura de Transportes.