Vamos analisar cada afirmativa: I. Podemos observar bacilos gram-negativos por microscopia. Verdadeiro, bacilos gram-negativos podem ser observados por microscopia após coloração adequada, como a coloração de Gram. II. O Petrifilm pode ser usado para identificação de Escherichia coli. Verdadeiro, o Petrifilm é um meio de cultura que pode ser utilizado para a contagem e identificação de E. coli. III. As provas bioquímicas e meios de cultura seletivos como o ágar Mac Conkey são úteis na identificação de S. aureus. Falso, o ágar Mac Conkey é um meio seletivo para a identificação de bacilos gram-negativos, especialmente enterobactérias, e não é utilizado para S. aureus, que é um cocó gram-positivo. Com base nas análises, as afirmativas I e II são verdadeiras, enquanto a III é falsa. Portanto, a alternativa correta que contém todos os itens verdadeiros é: D) II e III, apenas.