As macrófitas aquáticas e os organismos bentônicos contribuem para o aumento da complexidade estrutural dos ecossistemas aquáticos principalmente por meio da criação de habitats e microhabitats. Eles oferecem abrigo e alimento para diversas espécies, aumentando a biodiversidade e a estabilidade do ecossistema. Além disso, essas comunidades ajudam na filtragem da água e na ciclagem de nutrientes, o que é essencial para o funcionamento saudável do ecossistema como um todo.