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Na 2ª porção do duodeno, ocorre a recepção da bile e do suco pancreático, que são essenciais para a digestão de gorduras e a neutralização do quimo ácido proveniente do estômago. Essa porção também é responsável pela absorção de nutrientes, como aminoácidos e açúcares simples. Na 3ª porção do duodeno, o intestino continua a absorver nutrientes e também se prepara para a transição para o jejuno, onde a absorção se intensifica. Além disso, essa parte do duodeno é onde ocorre a regulação do trânsito intestinal e a interação com hormônios que controlam a digestão.