Vamos analisar cada afirmativa: I. A empresa pode utilizar a invenção de João, desde que pague uma taxa de licenciamento, dispensando acordos. Falso. Para utilizar a invenção de João, a empresa precisa de um acordo formal de licenciamento, não basta apenas pagar uma taxa. A autorização deve ser acordada entre as partes. II. O direito de uso da invenção de João deve ser transferido para a empresa, pois a invenção foi divulgada publicamente antes de ser registrada. Falso. A divulgação pública antes do registro pode afetar a possibilidade de patenteabilidade, mas não transfere automaticamente o direito de uso da invenção para outra parte. III. O pedido de patente concede a João o direito exclusivo sobre a invenção por um tempo determinado, permitindo que o direito de uso possa ser licenciado. Verdadeiro. O registro da patente garante a João a exclusividade sobre sua invenção por um período determinado e ele pode licenciar esse direito. IV. João pode buscar judicialmente a interrupção da comercialização do produto similar, além de exigir uma indenização pelos prejuízos causados pela infração da patente. Verdadeiro. João tem o direito de tomar medidas legais contra a empresa que infringe sua patente, incluindo a interrupção da comercialização e a busca por indenização. Com base nas análises, as afirmativas corretas são III e IV. Portanto, a alternativa correta é: E) III e IV, apenas.