Analisando as alternativas: A) Leptospira não é a causa comum de encefalite em suínos jovens. B) Streptococcus agalactiae não é o principal agente da meningite em suínos. C) Clostridium perfringens tipo C causa principalmente diarreia, não sintomas neurológicos. D) Streptococcus suis é um agente endêmico em suinocultura intensiva, transmitido por fêmeas portadoras, e pode causar meningite fatal em leitões recém-desmamados, com sintomas como meningite, convulsões e morte súbita. E) Escherichia coli enterotoxigênica causa diarreia, não sintomas neurológicos. Portanto, a alternativa correta é: D) Streptococcus suis é um agente endêmico em suinocultura intensiva, transmitido por fêmeas portadoras, e pode causar meningite fatal em leitões.