Qual a classificação zoológica para bactérias e fungos? Em que se baseia essa classificação? E por que não há classificação zoológica para vírus?

Não entendi o que você pretende dizer com classificação zoológica, sendo que zoo, a meu ver, se limita a animais, e bactérias/fungos/vírus não são animais. Tem certeza que é essa a classificação que você quer?

Não seria "Classificação taxonomica"? 

As bactérias possuem um tamanho de poucos mícrons (geralmente entre 0,5 e 5 microns de comprimento) e várias formas, incluindo filamentos, esferas (cocos), as hastes (bacilos), saca-rolhas (vibriões) e hélices (espirais). Eles geralmente têm uma parede celulares isso é composto de peptidoglicano e possuem flagelos ou outros sistemas de deslocamento e são móveis.

Vírus infectam todos os tipos de organismos, de animais, fungos, plantas, bactérias e archaea. Os vírus são muito pequenos para serem observados com a ajuda de um microscópio óptico, então eles são considerados submicroscópicos.