a energia gravitacional independe do referencial adotado

Não. Ela depende. Você precisa adotar um referencial para saber o valor da mesma. Se o corpo estiver a uma altura mais elevada do referencial adotado, ela estará sujeita a uma força gravitacional maior.

Não, o referencial adotado importa pois a energia potencial depende da altura (posição inicial e da posição final ocupada pelo corpo), mas não depende da trajetória. A energia potencial gravitacional é dada pela equação a seguir:

\(\boxed{E_P = m*g*(h_2-h_1)}\)