Qual a melhor maneira de realizar a migração de dados?

Existem várias maneiras, pois depende muito de como é a sua base anterior e como foi projetada a sua base nova. Se não houver a possíbilidade de fazer a migração via comandos SQL diretos, a melhor forma é gerar arquivos textos que contenham comandos SQL para fazer a atualização direta. É claro que todas as regras e Triggers das tabelas deverão estar preparadas para executar vários comandos assincronos.

Para uma melhor esplanação seria interessante apresentar as configurações da base anterior e da base atual, assim podemos ajudar mais específicamente.

Caro Ivo, achei bem interessante fazer via comandos SQL, depende muito da preparação assim como foi citado em sua resposta. Agradeço pela ajuda.

Para responder a essa pergunta devemos utilizar nosso conhecimento em banco de dados

Migração de banco de dados nunca é uma tarefa simples, principalmente se for para outro SGDB. Pois por mais que se trate de dois bancos sql, existem variações de sintaxe e também dos tipos de dados suportados para armazenamento além de enconding e formatação.

Mas se for para um mesmo SGDB há um menor risco de inconsistências ou erros durante a restauração da base.

Um método amplamente utilizado para migração e muitas vezes até utilizado como forma de becape e a geração do DUMP do banco de dados, que nada mais é do que um arquivo contendo comandos sql para recriar todas as estruturas das tabelas novamente, as procedures, views, triggers e etc, além dos comandos para inserir cada um dos dados existentes, tudo isso em um arquivo apenas.

Mas hoje em dia existem softwares específicos para essas migrações e muitos SGDBs possuem ferramentas para importação de outros tipos de bancos de dados.

Portanto caso não tenha um software que realize essa tarefa para você, uma alternativa é gerar o DUMP do banco e importa-lo no novo banco de dados que utilizará.