A eletroforese baseia-se na aplicação de uma diferença de potencial na amostra, imersa em um gel especial, que se quer separar de tal forma que passe uma corrente elétrica. Como as moléculas de DNA e RNA possuem carga elétrica negativa, essas moléculas serão atraídas para o eletrodo positivo, enquanto as outras moléculas serão atraídas para o eletrodo negativo. Porém, essas outras moléculas possuem pesos moleculares distintos e, portanto, apresentam deslocamentos distintos no gel utilizado com a formação de bandas distintas.
Atualmente, existem kits de eletroforese que eliminam inconveniências da eletroforese realizada sem kit como, por exemplo, vibração e ondas de convecção devido ao aquecimento sofrido pela passagem da corrente elétrica. Assim, os kits utilizam matrizes rígidas que eliminam esses problemas.
Portanto, na eletroforese de DNA e RNA, a extração das proteínas, lipídeos e carboidratos é realizada por meio das diferentes bandas que se formam no gel de acordo com os seus pesos moleculares. Quanto aos kits de eletroforese, eles eliminam as perturbações e dispersões da amostra devido utilizar matrizes rígidas.
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