Muitas vezes, o termo "bioma" é utilizado como sinônimo de "ecossistema" mas, diferente do ecossistema, à classificação de bioma interessa mais o meio físico (a fisionomia da área, principalmente da vegetação) que as interações que nele ocorrem. O perfil do local e a dimensão também importam na classificação: um ecossistema qualquer só será considerado um bioma se suas dimensões forem de grande escala.
Um bioma é diferente de um ecossistema . Um ecossistema pode ser caracterizado como sendo a interação de coisas vivas e não-vivas em um ambiente . Um bioma é uma área geográfica específica notável para as espécies que vivem lá. Um bioma pode ser constituído por muitos ecossistemas. Por exemplo, um bioma aquático pode conter ecossistemas como recifes de coral e florestas de algas .
Outros cientistas usam classificações mais precisas e listam dezenas de biomas diferentes. Por exemplo, eles consideram diferentes tipos de florestas como biomas diferentes.
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