Por muito tempo acreditou-se que os imunossupressores seriam contraindicados a pacientes infectados com o vírus da imunodeficiência humana (HIV), uma vez que um organismo com seu sistema imune suprimido poderia ser favorável a replicação viral, porém hoje em dia estudos indicam que algumas drogas imunossupressoras podem na verdade ter ação antiviral. Uma O HIV só se replica em células T CD4 ativadas, portanto drogas que impedem a ativação dessas células estariam por tabela impedindo a replicação desse vírus.
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