Aol 3 Química Medicinal Avançada

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Química Medicinal Avançada - T.20212.B 
Avaliação On-Line 3 (AOL 3) - 
Questionário 
Avaliação On-Line 3 (AOL 3) - 
Questionário 
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Conteúdo do exercício 
Conteúdo do exercício 
1. Pergunta 1 
/1 
Em modelagem Molecular de Proteínas existe a opção de se empregar um método muito 
eficiente para a análise da complementariedade e efetividade no processo de interação entre 
o fármaco e a proteína receptora, trata-se da ‘docagem molecular’. Aponte, entre as 
alternativas abaixo, aquela que revela a principal vantagem desse método, em relação ao 
tempo de acoplamento. 
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1. 
Apresenta igual tempo computacional às demais técnicas 
2. 
O tempo computacional não interfere nesse caso 
3. 
A vantagem consiste na rapidez dos cálculos paramétricos 
4. 
Apresenta menor tempo computacional que as demais técnicas 
Resposta correta 
5. 
A vantagem consiste na obtenção da estrutura 3D do receptor 
2. Pergunta 2 
/1 
O enovelamento da proteína será definido pelos ângulos de torção anteriores e posteriores 
ao carbono central (o alfa) na cadeia peptídica, sendo de fundamental importância o 
programa identificar esses ângulos. Qual das alternativas aponta a contribuição do Diagrama 
de Ramachandran para a identificação dos ângulos de torção. 
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1. 
A facilidade de decodificação do diagrama 
2. 
A disponibilidade de informações de ângulos diedros 
3. 
O cálculo angular 
4. 
O sistema facilitado de diagramação 
5. 
A esquematização em gráficos para cada resíduo de aminoácido 
Resposta correta 
3. Pergunta 3 
/1 
A complementariedade, na interação fármaco-receptor, foi explicada por vários modelos, 
hoje sendo compreendida por meio das propriedades interativas características da estrutura 
molecular da micromolécula que definem o grau de afinidade pela molécula receptora e o 
percentual de resposta que determinará as condições para que a resposta terapêutica 
esperada aconteça. Assinale abaixo a alternativa que indica o fenômeno responsável para que 
os grupamentos funcionais e as propriedades estruturais do fármaco exerçam a 
complementariedade no sítio receptor da macromolécula. 
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1. 
O pH do meio reacional 
2. 
A natureza química do fármaco 
3. 
A natureza química da molécula receptora 
4. 
Os ângulos de torção do fármaco 
5. 
A estereoespecificidade da molécula bioativa 
Resposta correta 
4. Pergunta 4 
/1 
O formato PDB permite armazenamento de informações sobre a técnica experimental usada 
para determinação da estrutura, detalhes sobre a macromolécula, origem, fonte, forma de 
obtenção, referências dos artigos relacionados à estrutura depositada e as coordenadas 
atômicas, devido a qual característica das listadas abaixo? 
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1. 
Domínio público 
2. 
Pela flexibilidade do formato 
3. 
Capacidade de restringir informações 
4. 
Por ser o mais utilizado 
5. 
Por ser rígido 
Resposta correta 
5. Pergunta 5 
/1 
Em uma situação real na qual o pesquisador precisa escolher a melhor estratégia, em termos 
da química computacional, para iniciar o processo de modelagem, qual seria o um dos pontos 
fundamentais a serem considerados, em relação à infraestrutura? 
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1. 
Tamanho do sistema a ser estudado 
2. 
Especificação de métodos para a extração de características 
3. 
Custo computacional 
4. 
Quantidade de máquinas 
Resposta correta 
5. 
Criação da base de dados 
6. Pergunta 6 
/1 
A complexidade da estrutura proteica depende do tipo e da quantidade de aminoácidos 
constituintes. Existem proteínas constituídas por uma única cadeia polipeptídica, já outras 
podem ser constituídas por duas ou mais cadeias polipeptídicas. Quando essas cadeias são 
idênticas, a proteína é dita oligomérica, e as subunidades são chamadas de protômeros. Dois 
fatores limitam o tamanho da proteína, assinale a alternativa que apresente um fator que 
embora ocorra em baixa quantidade pode representar um problema complicado na síntese 
de proteínas grandes. 
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1. 
A precisão da síntese proteica 
2. 
A capacidade genética da célula 
3. 
A frequência de erros durante a síntese 
Resposta correta 
4. 
O percentual de aminoácidos aromáticos 
5. 
A fonte de informações biológicas para a síntese 
7. Pergunta 7 
/1 
Para que se possa descobrir e estudar a forma como atua um fármaco no organismo, é 
necessário conhecer também a estrutura da macromolécula receptora que se constitui no 
alvo farmacológico. Qual é a estratégia ‘in silico’ mais utilizada para esse estudo atualmente? 
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1. 
CADD 
2. 
SBDD 
Resposta correta 
3. 
ISIS 
4. 
PDB 
5. 
LBDD 
8. Pergunta 8 
/1 
A aplicação da técnica por homologia em estudos e predição de compostos bioativos se 
desenvolve a partir do uso de ferramentas computacionais para determinação de estruturas 
3D de proteínas. Em que ponto esse método é baseado para justificar essa denominação? 
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1. 
Em confluência de dados parametrizados 
2. 
Na função de cada proteína 
3. 
Em função da densidade eletrônica 
4. 
Na similaridade entre moléculas proteicas 
Resposta correta 
5. 
Em propriedades físico-químicas da micromolécula 
9. Pergunta 9 
/1 
Avançando-se para o processo de otimização e visualização da molécula proposta, ainda que 
tenham sido utilizados programas que atenderam à qualidade pretendida, frequentemente se 
faz necessário usar recursos de minimização de energia e análise conformacional 
interativamente para otimizar essa molécula. Assinale, entre as alternativas abaixo, aquela 
que justifica esse procedimento. 
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1. 
A incapacidade do programa em gerar figuras 
2. 
Instabilidade do banco de dados 
3. 
Distorções frequentes na estrutura da molécula gerada 
Resposta correta 
4. 
O desconhecimento da estrutura tridimensional 
5. 
Ambiguidade de geometrias para as moléculas geradas 
10. Pergunta 10 
/1 
Dentre as inúmeras contribuições que a interdisciplinaridade constituída pela Química e a 
Informática, certamente a mais significativa tem sido o suporte tecnológico para a 
compreensão dos problemas da química experimental. Em ‘quimioinformática destaca-se a 
importância do uso de descritores moleculares para a representação de uma estrutura 
química. Qual seria a maior vantagem, em relação a outros métodos, com o uso desses 
descritores? 
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1. 
A aplicação de similaridade química 
2. 
Aumento da capacidade de incorporar informações 
Resposta correta 
3. 
A demonstração da disposição dos átomos envolvidos 
4. 
A possibilidade de representação tridimensional 
5. 
O suporte de informações relevantes