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Profa. Rafaela Ferreira Replicação e Reparo do DNA A replicação do DNA DNA é uma forma arquivada de informações genéticas A replicação do DNA é semiconservativa Cada fita funciona como molde para uma nova fita Experimento (1957): DNA inicial marcado com 15N Meio contendo 14N A replicação começa em um ponto de origem e prossegue bidirecionalmente Origem de replicação: ponto onde a replicação é iniciada Geralmente são ricas em A=T A replicação começa em um ponto de origem e prossegue bidirecionalmente Imagens de replicação Bactérias em meio com timidina marcada radioativamente A replicação ocorre no sentido 5’-3’ Fita contínua: filamento é sintetizado inteiro. Fita descontínua ou retardária: filamento que é sintetizado em pedaços que depois são ligados (cada pedaço começa por 5’ e termina em 3’) DNA Ligase: liga os fragmentos de Okazaki Mecanismo de elongação da fita de DNA O DNA é sintetizado por DNA polimerases Responsável pela polimerização das novas fitas de DNA Catalisa a adição passo a passo de unidades de desoxirribonucleotídeos à cadeia de DNA (DNA)n +dNTP (DNA)n+1 + PPi DNA Polimerase Estrutura da DNA polimerase DNA Polimerase I O processo de elongação pela DNA polimerase O processo de elongação pela DNA polimerase 1) Necessita dos 4 precursores ativados + o Mg2+ Mecanismo de elongação da fita de DNA O processo de elongação pela DNA polimerase 2) A cadeia de DNA recém-formada é montada diretamente sobre um molde de DNA preexistente O processo de elongação pela DNA polimerase 2) A cadeia de DNA recém-formada é montada diretamente sobre um molde de DNA preexistente DNA polimerases catalisam a formação da ligação fosfodiéster de forma eficiente quando a base do nucleotídeo que chega é complementar na fita molde O processo de elongação pela DNA polimerase 3) A DNA polimerase necessita de um primer para iniciar a síntese Muitas vezes o primer é RNA O processo de elongação pela DNA polimerase 4) A replicação é especificada pela complementaridade das Bases Ligações de hidrogênio O processo de elongação pela DNA polimerase 4) A replicação é especificada pela complementaridade das Bases O processo de elongação pela DNA polimerase 5) Muitas DNA polimerases são capazes de corrigir erros no DNA através da remoção dos nucleotídeos que não se combinam Taxa de 1 erro a cada 108 par de base Existem diversos tipos de DNA polimerase A primeira enzima foi isolada de E. coli por Kornberg (1957) e foi chamada DNA polimerase I. Enzimas da replicação em E. coli: - DNA polimerase III: principal enzima da polimerização - DNA polimerase II: reparação do DNA - DNA polimerase I : remoção de primer de RNA, preenchimento da lacuna resultante e reparação do DNA Existem diversos tipos de DNA polimerase Propriedades DNA polimerase I II III Iniciação de síntese da cadeia - - - Polimerização 5’ + + + Atividade de exonuclease 3’ – 5’ + + + Atividade de exonuclease 5’ - 3’ + - - Nº de moléculas / célula 400 ? 15 Nos eucariotos existem outras DNA polimerase análogas às dos procariotos DNA Polimerase em eucariotos Função DNA Polimerase α Replicação do cromossomo nuclear (fita lagging) DNA Polimerase β Reparo de DNA no preenchimento de espaços do cromossomo nuclear. Análoga a Polimerase I DNA Polimerase γ Replicação de DNA mitocondrial DNA Polimerase δ Replicação do filamento leader a da lagging do cromossomo nuclear DNA Polimerase ε Reparo do DNA do cromossomo nuclear DNA Polimerase ζ Aparentemente reparo de DNA Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA Helicase: separa os filamentos da dupla hélice que vai ser copiada. Utilizam a energia da hidrolise do ATP para impulsionar a separação destas fitas. Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA f Topoisomerases – enzimas responsáveis pelo desdobramento das voltas da hélice dupla (consome energia = ATP). Topoisomerase tipo I – Catalisam o relaxamento do DNA. Topoisomerase tipo II – Utilizam a energia livre da hidrólise do ATP para produzir a quebra nas duas fitas Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA RNA primase 3´ 5´ 5´ 3´ 3´ 5´ 3´ 3´ 5´ 5´ Modelo de DNA Primase Primer de RNA DNA Polimerase DNA recém-sintetizado Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA DNA polimerase I : atividade exonucleásica 5’-3’ Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA DNA ligase Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA Telomerases A finalização da replicação é feita com a formação de estruturas complexas no topo do cromossomo, os telômeros Os telômeros são replicados com a ajuda das telomerases Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA Telomerases A telomerase é uma polimerase especializada que acarreia seu próprio molde de DNA Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA Telomerases Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA Telomerases – a extremidade 3´ dos telômeros é mais longa, forma uma alça T Diversas enzimas são necessárias para a síntese do DNA Reparo do DNA Três R’s 1) Reconhecer a(s) base(s) afetada(s). 2) Remover a(s) base(s) afetada(s). 3) Reparar a lacuna resultante com uma DNA polimerase e com uma DNA ligase A complementaridade das fitas permite que o reparo a partir da fita não mutada. Existem diversos mecanismos de reparo Em bactérias, fitas recém sintetizadas são distinguíveis por não serem metiladas Telomerases Reparo de bases mal pareadas em procariotos MutL-MutS se liga ao par mal pareado MutH se liga a uma sequência GATC metilada (até 1000 pb de distância!) A fita não metilada é clivada e marcada para reparo Reparo de bases mal pareadas Telomerases Reparo de bases mal pareadas em eucariotos MutS se liga ao par mal pareado MutL realizada uma varredura, buscando falhas na fita nova Reparo de bases danificadas endonuclease remove a base nitrogenada modificada nucleotídeo correspondente é removido inserção de novos nucleotídeos
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