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Estudo dos ácidos nucléicos 2 São macromoléculas (polímeros) formadas por unidades monoméricas (monômeros) menores chamadas de nucleotídeos (DNA e RNA) O que são ácidos nucléicos? Estudo dos ácidos nucléicos 3 Armazenamento e transmissão da informação genética Qual a função dos ácidos nucléicos? Estudo dos ácidos nucléicos 4 Síntese de Proteínas Estudo dos ácidos nucléicos • Genoma, DNA e gene 5 GENOMA O conjunto completo de informações genéticas (hereditárias) de qualquer organismo, codificado no seu DNA (ácido desoxirribonucleico) Genômica é o termo utilizado para o estudo dos genomas Estudo dos ácidos nucléicos 6 Cromossomos Onde tem DNA? Mitocôndrias Cloroplastos Estudo dos ácidos nucléicos • Genoma, DNA e gene 7 DNA cromossômico 33% do conteúdo de DNA estão na forma de genes estruturais e sequências a eles relacionadas. 67% é DNA extra gênico, ou seja, não faz parte dos genes nem das sequências relacionadas a eles. Estima-se que existam 20 a 25 mil genes (Lewin) Estudo dos ácidos nucléicos 8 GENES Wilhelm Johannsen (1909) Segmento de DNA que codifica um cadeia polipeptídica (ptns) e inclui regiões flanqueadoras que antecedem (sequência-líder ou promotora) e que seguem (cauda) a região codificadora, bem como sequências que não são traduzidas (ÍNTRONS) e que se intercalam com as sequências codificadoras individuais (ÉXONS) Estudo dos ácidos nucléicos 9 GENES Propriedades necessárias para o material genético • Deve carregar a informação para controlar a síntese de enzimas e proteínas dentro de uma célula ou organismo; • Deve se autorreplicar com alto grau de fidelidade e com baixo nível de mutação; • Deve estar localizado nos cromossomos. Dogma Central da Biologia Postulado por Francis Crick, em 1968. Fluxo da informação: Uma sequencia de ácidos nucleicos pode originar uma proteína, mas o contrário não é possível. Dogma Central da Biologia - RNA define a sequencia de proteínas - DNA define a sequencia de RNA - DNA é capaz de definir sua própria síntese - O fluxo da informação é do DNA para a proteína - RNA também pode dirigir a síntese de proteínas Estrutura do DNA Estrutura do DNA Ácido Desoxirribonucleico Aglomerado de moléculas que contém material genético Orienta a célula na produção de proteínas Molécula informacional Capacidade de caracterizar tudo e qualquer particularidade do nosso corpo Base Nitrogenada Estrutura do DNA Ácido Desoxirribonucleico Polímero de Nucleotídeos Estrutura do DNA Açúcar: Desoxirribose Estrutura do DNA Bases nitrogenadas podem ser classificadas quanto ao número de anéis. Estrutura do DNA Grupo fosfato Estudo dos ácidos nucléicos 19 Estrutura dupla hélice Ligação entre as fitas → Pontes de hidrogênio Ligação nas fitas (nucleotídeos) → Ligação Fosfodiéster Estudo dos ácidos nucléicos 20 Estrutura dupla hélice Estudo dos ácidos nucléicos 21 Estrutura dupla hélice A Descoberta da Dupla Hélice do DNA Regra de Chargaff: Adenina = Timina Citosina = Guanina Razão 1:1 entre as bases púricas e pirimídicas em todos os organismos Estudados A + G = T + C A quantidade molar de A/T e C/G varia de espécie para espécie Exemplos • Se o total de bases nitrogenadas de uma sequência de DNA de fita dupla é igual a 240, e nela existirem 30% de adenina, o número de moléculas de guanina será: a)48. b)72. c)120. d)144. e)168. Exemplos Com base nas Regras de Chargaff, considere a seguinte questão: se um fragmento de DNA com 100 bases nitrogenadas apresenta um conteúdo de adenina de 30%, qual a quantidade (número de bases) de cada uma das quatros bases nitrogenadas nesta molécula? Exemplos Com base nas Regras de Chargaff, considere a seguinte questão: se um fragmento de DNA com 100 pb (pares de base) apresenta um conteúdo de adenina de 30%, qual a quantidade (número de bases) de cada uma das quatros bases nitrogenadas nesta molécula? A) 60 (A), 40 (C), 60 (T) e 40 (G). B) 60 (A), 60 (C), 40 (T) e 40 (G). C) 40 (A), 60 (C), 40 (T) e 60 (G). D) 40 (A), 40 (C), 60 (T) e 60 (G). E) 30 (A), 70 (C), 30 (T) e 70 (G). A Descoberta da Dupla Hélice do DNA Rosalind Franklin e Maurice Wilkins, 1950 Padrão de difração do raio X do DNA mostrou que o DNA é formado por 2 fitas helicoidais com periodicidade de 0.34 nm e 3,4 nm Desvendando a Molécula da Hereditariedade 1953, James Watson e Francis Crick: Estrutura do DNA Palestra Watson O modelo de Watson e Crick • Duas cadeias polinucleotídicas estão enroladas em torno de um eixo comum em sentidos opostos • As bases estão do lado de dentro e a desoxirribose e o fosfato estão do lado de fora • Diâmetro da hélice é de 20A. Bases adjacentes estão separadas por 0,34 nm com uma rotação de 36 graus • As duas cadeias são mantidas juntas por pontes de hidrogênio entre as bases • As fitas são complementares e antiparalelas • A sequência exata das bases carrega a informação genética Propuseram um modelo tridimensional do DNA sem executarem um único experimento em laboratório!!!! Estrutura do RNA 31 RNA Cadeia simples de NUCLEOTÍDEOS ligados (tendo a ribose como seu açúcar). Pentose – Ribose Uracila em vez de Timina Estrutura do RNA Estrutura do RNA RNA mRNA miRNA ta-siRNA nat-siRNA ra-siRNA RNAs não codificantes Small RNAsRNAs de trancrição RNA codificante tRNArRNA siRNAs Small interfering RNAs 5% 15% 80% Replicação do DNA A replicação é Semiconservativa • Processo de autoduplicação do material genético; • Cada fita de DNA pode atuar como molde (template) para síntese de uma nova fita; • A replicação é considerada um processo semi-conservativo; • Exige que duas cadeias polinucleotídicas que formam o DNA se separem, expondo as bases que vão orientar o emparelhamento dos nucleotídeos para a formação de uma nova cadeia A replicação é Semiconservativa Replicação do DNA 40 Replicação Semi-Conservativa Replicação do DNA 41 Replicação Semi-Conservativa Meselson e Stahl (1958) Replicação do DNA 42 Replicação Semi-Conservativa Meselson e Stahl (1958) Requisitos para Replicação do DNA • Um molde: DNA unifilamentar; • Matérias-primas (substratos) a serem reunidas em um novo filamento de nucleotídeo; • Enzimas e outras proteínas que fazem a ‘leitura’ do molde e reúnem os substratos em uma molécula de DNA. Replicação do DNA 44 Replicação DNA Polimerase •DNA pol I •DNA pol III Helicases Topoisomerases Primases SSBs DNA ligase Telomerases Replicação do DNA 45 Replicação DNA Polimerase • Principais enzimas envolvidas no processo; • São incapazes de quebrar as pontes de hidrogênio que ligam as duas fitas do DNA; •Alongam uma fita de DNA pré-existente; – Responsáveis pela adição de nucleotídeos e reparo; •Requerem um modelo (PRIMER – segmento de RNA - Primase) para iniciar o processo; DNA Polimerase • Artur Kornberg, 1959: isolou DNA Polimerase de E. coli • Adiciona desoxirribonucleotídeos à ponta 3’ de uma cadeia de nucleotídeos em crescimento, usando como molde um único filamento de DNA que foi exposto pela deselicoidização localizada da dupla hélice. • Substratos: trifosfato dos desoxirribonucleotídeos • Remoção de dois dos três fosfatos na forma de pirofosfato (PPi) DNA Polimerases ENZIMA GENE FUNÇÃO I polA Envolvida no reparo de DNA Remove os primers de RNA nos fragmentos de Okasaki e substitui-os por DNA Alongamento da fita de DNA no sentido 5’ 3’ Atividade de revisão no sentido 3’ 5’ Atividade de exonuclease 5’ 3’ II polB Requerida para reiniciar a replicação do DNA Alongamento da fita de DNA no sentido 5’ 3’ Atividade de revisão no sentido 3’ 5’ III polC Replicase (replicação do DNA) Alongamento da fita de DNA no sentido 5’ 3’ Atividade de revisão no sentido 3’ 5’ IV dinB Replicação através de lesão ou dano V umuD’2C Replicação através de lesão ou dano DNA Polimerase • Adiciona desoxirribonucleotídeos de 5’ para 3’ da nova cadeiaDNA Polimerase DNA Polimerase DNA Polimerase DNA Polimerase A replicação ocorre no sentido antiparalelo • a DNA polimerase somente consegue sintetizar uma nova molécula de DNA acrescentando novos nucleotídeos ao carbono 3´ do açúcar • Sentido 5’ 3’ Forquilha de Replicação Os eucariotos possuem múltiplas origens de replicação; As forquilhas são bidirecionais; No homem, as origens de replicação são espaçadas em Intervalos de aproximadamente 50.000‐100.000 pb Replicação do DNA 56 Origem de replicação Forquilhas de replicação Replicação do DNA 57 Origem de replicação Locais com sequências específicas – regiões ricas em AT Ligam proteínas específicas Quando acionadas, essas proteínas permitem o início da replicação Replicação do DNA 58 Origem de replicação Forquilhas de replicação Replicação do DNA 59 Replicação Helicase • Constituem uma classe de enzimas que podem mover ao longo da fita dupla de DNA utilizando a energia da hidrólise de ATP para SEPARAR AS DUAS FITAS DA MOLÉCULA; Replicação do DNA 60 Replicação Topoisomerases • Responsáveis por ALIVIAR A TORÇÃO na parte da fita que não está sendo replicada; Replicação do DNA 61 Replicação Primases • Fica associada a helicase; • Função de COLOCAR O PRIMER (conjunto de ribonucleotídeos – RNA) na fita aberta de DNA; •O primer é o “sinal” para a DNA pol III se unir a fita de DNA e iniciar a síntese. Replicação do DNA 62 Replicação Single-Strand-Binding SSBs • São proteínas que ficam associadas as fitas simples de DNA para PREVENIR QUE AS FITAS SE JUNTEM NOVAMENTE; Replicação do DNA 63 Replicação DNA ligase • Vai UNIR UM FRAGMENTO DE DNA AO OUTRO (na fita descontínua – Fragmentos de Okasaki); Replicação do DNA 64 Estágios da Replicação •Iniciação; •Alongamento; •Terminação Filamento Descontínuo, Lagging, Lento Filamento Contínuo, Leading, Rápido Iniciação • Após o reconhecimento da oriC, o DNA é desenrolado pela proteína DnaB ou Helicase Helicase e Topoisomerase Ex: DNA girase Proteínas de ligação ao DNA fita simples (SSB) • DNA helicase se liga ao DNA na forquilha de replicação e desenrola o DNA com o gasto de energia do ATP • • DNA Girase (um tipo de topoisomerase) relaxa o DNA superelicoidizado • • O DNA aberto de fita simples é estabilizado por proteínas que se ligam a DNA fita simples (Single‐stranded DNA‐binding protein –SSB ) primer Forquilha de Replicação Fitas parentais Fita leading Fita lagging DNA Polimerase III Movimento da Forquilha de replicação Filamento contínuo Filamento descontínuo DNA Polimerase III DNA Polimerase III Replicação do DNA 73 Estágios da Replicação • Terminação – Procariotos: DNA circular, quando as duas forquilhas de replicação se encontram ela termina; – Eucariotos: sequência de nucleotídeos específicas no final dos cromossomos, incorporadas ao telômero.
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