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Do DNA à Proteína Transcrição e Tradução Prof. Dr. Magaiver Andrade O fluxo da informação genética ✓ O DNA não origina diretamente a síntese proteica, usa o RNA como molécula intermediária ✓ A informação contida no DNA precisa ser decodificada e utilizada adequadamente ✓ A molécula de RNA servirá como molde para a síntese de uma proteína específica ✓ Os transcritos nas células eucarióticas podem sofrer uma série de processamentos antes de serem traduzidos Onde é produzido o RNA? O RNA é sintetizado no núcleo e depois vai para o citoplasma. Mas no caso da bactéria que não possui núcleo, onde ocorre a transcrição ?? A Transcrição no procarioto ocorre no citoplasma • Mas procarioto não tem núcleo... • Por isso se diz que sua transcrição é acoplada com a tradução O acoplamento transcrição-tradução Atenção: só em procariotos Claro, eles não têm núcleo RNAs bem-conhecidos • mRNA • tRNA • rRNA O RNA e a transcrição Há vários tipos de RNAs RNA Função mRNAs (~ 2%) RNA mensageiro codificam proteínas rRNAs (~80%) RNA ribossomal formam a estrutura básica dos ribosomos tRNAs (~15%) RNA transportador Adaptadores entre o RNA mensageiro e os aminoácidos - tradução microRNA Controle pós-transcricional snRNAs Small nuclear RNA Processamento do pré-RNAm (“splicing”) O gene • O que é um gene? • Qual a estrutura molecular de um gene? O gene eucarioto • Genes partidos no genoma • Processamento: Exons, introns • Promotores, enhancers Fitas molde e codificadora A transcrição transcrição • Transcrição - é o processo pelo qual uma seqüência de DNA é enzimaticamente copiada por uma RNA polimerase para produzir um RNA complementar. A transcrição é química e enzimaticamente semelhante à replicação do DNA: Semelhanças entre a replicação e a transcrição ✓ Polaridade 5’ → 3’ ✓ Necessidade de um molde ✓ Inicia a partir de uma sequência específica – sequência de iniciação A transcrição • São necessários para que a transcrição ocorra: • Fita molde de DNA • Enzimas RNA polimerases • Ribonucleotídeos RNA polimerase em procarioto Na maioria dos procariontes, uma única espécie de RNA polimerase transcreve todos os tipos de RNA. Enzimas RNA polimerases em Eucarioto Estrutura do RNA polimerase em procarioto • O cerne da enzima contém dois polipeptídios , um polipeptídio e ’. • A adição da subunidade fator sigma,permite a iniciação nos sítios promotores, formando uma holoenzima ’ ’ ’ + Cerne da enzima Fator sigma Holoenzima • RNA polimerase + conjunto de proteínas Enzimas RNA polimerases em Eucarioto FATORES DE TRANSCRIÇÃO FATORES DE TRANSCRIÇÃO GERAIS FATORES DE TRANSCRIÇAÕESPECÍFICOS São necessários para transcrição de todos os genes TF II A,B,C,D,E,F,G E H Especifico para cada gene, pode tanto se ligar a seqüência distais como proximais Importante dos Fatores de transcrição e do Fator sigma Posicionamento correto da RNA polimerase no promotor Aumento a adesividade da RNA polimerase ao DNA Auxiliam na dupla fita A transcrição Etapas da Transcrição: Iniciação Elongação Terminação Conduzidas diferentemente em procariotos e eucariotos A transcrição Etapas da Transcrição: Iniciação Elongação Terminação ➢Localização e reconhecimento da RNA polimerase no promotor( fator sigma nos procariotos e Fatores de transcrição em eucariotos.; ➢Inicio da transcrição dos primeiros nucleotídeos ; ➢Liberação dos fatores de transcrição e fatores sigma, RNA polimerase continua sozinho; A transcrição em procariotos Iniciação Afinal, o que é um promotor? ➢ reconhecidas pelo fator Diferentes promotores bacterianos possuem sequências heterogêneas, mas relacionadas entre si – sequências consenso Pequenas sequências especiais de nucleotídeos que indicam o ponto inicial da síntese de RNA ➢localizadas antes da região codificadora TATA BOXCAT BOX A transcrição Etapas da Transcrição: Iniciação Elongação Terminação ➢Construção da fita de RNA, pela inserção de nucleotídeos complementares aos da fita molde de DNA A transcrição Etapas da Transcrição: Iniciação Elongação Terminação A RNA polimerase le seqüência que indicam término do gene e se solta do DNA. TERMINAÇÃO DO PROCARIOTO Terminação rho- independente Formação do grampo de finalização O pareamento intramolecular das seqüências complementares C e G do RNA recém-sintetizado forma uma estrutura em grampo. a presença de resíduos de A logo após as sequências invertidas de GC também facilitam a dissociação do RNA recém sintetizado do complexo de transcrição. Esse acontecimento desencadeia os seguintes eventos A transcrição em procariotos Terminação • Rho- dependente Terminação células procarióticas e eucarióticas Nesse modelo, a proteína Rho migra até encontrar a RNA-polimerase parada em uma sequência rica em GC. A proteína Rho apresenta uma atividade de helicase dependente de ATP e auxilia no desligamento do RNA sintetizado e o molde de DNA. A transcrição em eucariotos A transcrição em eucariotos • Envolve muito mais elementos do que em procariotos: • ➢ Três RNAs polimerases • ➢ Fatores gerais de transcrição • ➢ DNA superempacotado • ➢ Presença de íntrons nos genes • ➢Múltiplos promotores A transcrição em eucariotos Fatores gerais de transcrição (TFII) Há fatores imprescindíveis para a transcrição eucariótica Fatores gerais de transcrição Auxiliam: posicionamento correto da RNA pol II no promotor separação das duas fitas de DNA liberam a RNA pol do promotor no início da transcrição A transcrição em eucariotos Fatores gerais de transcrição (TFII) Fatores se ligam ao promotor de eucariotos e atraem a RNA pol II Complexo de iniciação da transcrição A transcrição em eucariotos Promotores eucarióticos Há vários tipos, o mais importante é o TATA box (TATAAA): Localizado a -25 nucleotídeos antes do sítio de início da transcrição TBP (TATA Binding Protein): subunidade do fator geral de transcrição TFIID - elemento guia para os demais fatores gerais de transcrição ligarem-se ao promotor A transcrição em eucariotos • Processo parcialmente conhecido •As três RNApols usam diferentes mecanismos de terminação ✓RNA pol I: requer um fator de terminação ✓ RNA pol II: terminação pode ocorrer em múltiplos sítios ✓ RNA pol III: requer a transcrição de uma cadeia de uracilas (não necessariamente formando grampo) Terminação O processamento do RNA Nos eucariontes, a transcrição do RNA mensageiro se dá no núcleo, porém a tradução da proteína se dá no citoplasma da célula Como proteger o mRNA das nucleases do citoplasma? ➢Processamento do hnRNA (RNA heterogêneo nuclear ou pré-RNA) As modificações conferem ao RNA estabilidade e são necessárias como sinal para o início da tradução O processamento do RNA A RNA pol transcreve inicialmente o RNA nuclear heterogêneo que passará por uma série de etapas que envolvem: ➢a adição de um grupo CAP (2'-O-metil e de um resíduo 7- metilguanosina trifosfato) na extremidade 5' do hnRNA; ➢processamento do hnRNA: remoção dos íntrons (segmentos transcritos não codificantes) e formação de uma RNAm maduro. ➢a adição na extremidade 3' de uma ramificação de ácido poliadenílico (Poli A com 100 a 200 bases); O processamento do RNA Adição da estrutura 5’ Cap dos mRNAs – 1º evento do processamento O processamento do RNA ➢Não está presente no DNA e não existe nos rRNA e tRNA; ➢ Adicionada pela enzima poli-A polimerase ➢Sequência sinal de poliadenilação: AAUAAA, 11 a 30 nt antes do sítio de poliadenilação clivagem em 3´ ➢ A poliadenilação é um processo acoplado ao término da transcrição. O processamento do RNA Adição da cauda de poli Adenina – poli A • Realizada pelo spliceossomo – complexo de ribonucleoproteínas O processamento do RNA Remoção dos íntrons - splicing O processamento do RNA Remoção dos íntrons - splicing Osgenes codificadores de proteínas correspondem a 2% ou menos do DNA total da célula Como é possível, então, a grande variedade de proteínas? Splicing Alternativo A partir de um mesmo gene, há a formação de diferentes proteínas, que irão desempenhar diferentes funções em diferentes células Splicing ALTERNATIVO – REGULADO mais de uma forma de mRNA maduro➔ Grande variedade de produtos (protéicos ou outros) codificados por um único gene Tradução do RNAm • O RNAr forma os ribossomos, a maquinaria de produção de proteínas; • O RNAt leva os aminoácidos corretos até os ribossomos; • O RNAm especifica a sequência correta de aminoácidos na proteína. Tradução do RNAm maduro é uma ação combinada das três classes de RNA Código Genético • Correspondência da seqüência de nucleotídeos levando à seqüência de aminoácidos; • Códon → 3 bases nucleotídicas no RNAm que codificam cada aminoácido; • Códon: • RNAm → A, G, C e U; • “escrita” da direção 5’ para 3’; • 64 combinações diferentes de bases; 1 códon → 3 nucleotídeos no RNAm 7 códons → 21 nucleotídeos Código Genético Código Genético 61 dos 64 códons possíveis codificam os 20 aminoácidos padrão Códons de terminação ou de parada ou sem sentido; não codificam AA. UAG / UGA / UAA Código Genético • Características: • Especificidade – um determinado códon sempre codifica o mesmo AA; • Universalidade – é conservado em todas as espécies; • Redundância ou Degeneração – um AA pode ter mais de 1 trinca que o codifica; • Contínuo – sempre lido de 3 em 3 bases. Tradução Elementos necessários para a síntese proteica: ✓ RNA mensageiro – RNAm OK ✓ Aminoácidos; OK ✓ Ribossomos ✓ RNA transportador – RNAt ✓ Aminoacil-tRNA sintetases ✓ Fatores de controle da tradução (iniciação, elongação e término) AA é ligado aqui •RNAt: Estrutura secundária: folha de trevo O pareamento códon-anticódon é complementar e antiparalelo 1 anticódon pode reconhecer mais de um códon Componentes da Tradução • RNAt • Sítios de ligação ao AA – extremidade 3’ do RNAt se liga ao grupo carboxila do AA; • Anticódon → seqüência de 3 nucleotídeos que reconhece o códon específico do RNAm; • Pode estar carregado ou descarregado. Componentes da Tradução Os tRNAs se ligam aos aminoácidos através de uma ligação do tipo éster catalisada pela enzima aminoacil-tRNA-sintetase (20 tipos diferentes); Aminoacil-tRNA sintetases • Ribossomos: Componentes da Tradução Ribossomos: grandes complexos de RNAr e proteínas compostos por duas subunidades. São as estruturas responsáveis pela síntese protéica (local da síntese). Livres ou no RER. Ribossomo de eucariotos: subunidades 60S (5S, 5.8S e 28S/49 proteínas) + 40S (18S/33 proteínas) Em procariotos: subunidades 50S (5S e 23S/36 proteínas) + 30S (16S/21 proteínas) RNAr: responsáveis pela estabilização do complexo de iniciação e dos demais participantes da tradução • A ligação entre códon do RNAm e anticódon do RNAt é antiparalela; • O códon é lido de 5’ para 3’; o anticódon também deve ser lido de 5’ para 3’. Portanto a primeira base do códon pareia com a última base do anticódon; Reconhecimento dos Códons pelo RNAt • Ativação dos AAs: • Ligação dos AAs aos seus RNAt ocorre no citosol pelas aminoacil-RNAt sintetases. • Duas lig. de alta energia Etapas da Síntese Protéica Aminoacilação do RNAt Etapa 1 • Iniciação: • O aminoacil-RNAt de iniciação pareia com o códon AUG, que é o códon que sinaliza o início da proteína a ser sintetizada; Etapas da Síntese Protéica Etapa 2 Formação do complexo de iniciação em eucariotos • O processo de elongação da cadeia polipeptídica em um ribossomo pode ser descrito 3 passos: 1. O aminoacil-tRNA se liga ao sítio A ao lado do sítio P ocupado por um peptidil-tRNA; 2. O rRNA da subunidade grande catalisa a ligação peptídica entre os aas do aminoacil-tRNA e do peptidil- tRNA; 3. O ribossomo desliza 3 nt sobre o mRNA, fazendo com que o peptidil- tRNA se desloque para o sítio P e o sítio A fique liberado para uma nova ligação de um novo aminoacil-tRNA. Elongação ou alongamento • Sítio P: neste sítio, o códon de iniciação é posicionado para seu pareamento com o anticódon do RNAt que transposta metionina – primeiro aa da tradução. • Sítio A: neste sítio, o códon adjacente é posicionado para seu pareamento com o anticódon do RNAt que transposta o próximo aa da cadeia polipeptídica. • Sítio E: depois de ser traduzido, o códon é posicionado no sítio E (ou sítio de saída) para seu desligamento com o RNAt, agora descarregado. Elongação ou alongamento • Terminação: • Ocorre quando 1 dos 3 códons (UAA, UAG, UGA) de terminação é “colocado” no sítio A; • Na E. coli, os fatores de terminação ou liberação reconhecem esses códons e ocorre a liberação do complexo ribossomal. Etapa 4 O entendimento desses eventos moleculares vai além da necessidade para que se tenha uma boa compreensão dos processos BIOTECNOLÓGICOS, pois SEM o conhecimento destes processos que estudamos: REPLICAÇÃO, TRANSCRIÇÃO E TRADUÇÃO, ficaria difícil entender o mecanismo de ação de alguns antimicrobianos. Inibidores de Síntese Protéica Tetraciclina: bloqueia o sítio A ribossomal Estreptomicina: Liga-se à subunidade 30S e distorce sua estrutura inibindo a iniciação X X Inibidores de Síntese Protéica Cloranfenicol: Inibe a atividade de peptidil- transferase procariótica X Clindamicina e Eritromicina: Ligam-se de maneira irreversível à subunidade 50S do ribossomo bacteriano, inibindo o deslocamento. X Bibliografia: Voet, D., Voet, J.G., Pratt, C.W. Fundamentos de Bioquímica (2000). Champe, P.C.; Harvey, R.A.; Ferrier, D.R. Bioquímica Ilustrada (3a ed, 2006). Nelson, D.L., Cox, M.M. Lehninger, Princípios de Bioquímica. Quarta edição (2004).
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