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Ácidos Nucleicos 1 Ácidos Nucleicos Created Livro de referência NELSON DL; COX MICHAEL M. Princípios de Bioquímica de Lehninger, 7ª edição → Parte I – Estrutura e Catálise → Capítulo 8 → Itens 8.1 e 8.2; Parte III – Vias da informação → Capítulo 24 → Item 24.1, Capítulo 25 → Itens 25.1 e 25.2, Capítulo 27 → Item 27.1. Nucleotídeos → São os monômeros dos ácidos nucleicos - repositórios moleculares da informação genética DNA (Ácido Desoxirribonucleico) RNA (Ácido Ribonucleico) → Funções além da composição do RNA e DNA: Moeda energética nas transações metabólicas Ligações químicas essenciais nas respostas da célula a hormônios e outros estímulos extracelulares Componentes estruturais de cofatores enzimáticos e intermediários metabólicos → Composição: pentose + fosfato + base nitrogenada @March 25, 2022 3:41 PM Ácidos Nucleicos 2 O açúcar que forma o nucleotídeo pode ser a ribose (no RNA) ou a desoxirribose (no DNA) As bases nitrogenadas são a adenina, guanina, citosina, timina (DNA) e uracila (presente no DNA no lugar da timina) - Derivadas da pirimidina e purina Bases e pentoses são compostos heterocíclicos Ambos os tipos de pentoses estão na forma β-furanose (anel fechado com cinco átomos) 💡 São as pentoses que definem a identidade de um ácido nucleico. → São ligados por meio de ligações fosfodiéster (pontes de grupos fosfato - grupo 5’ fosfato de uma unidade nucleotídica é ligado ao grupo 3’ hidroxila do outro) dando origem a longas cadeias - no DNA se alinham em pares (dupla hélice) Complementariedade entre a bases adenina e timina, adenina e uracila e citosina e guanina, que interagem por ligações de hidrogênio Esqueleto covalente dos ácidos nucleicos consiste em fosfatos e resíduos de pentose alternados Bases nitrogenadas podem ser consideradas grupos laterais ligados ao esqueleto em intervalos regulares Ácidos Nucleicos 3 → Os esqueletos do DNA e RNA são hidrofílicos - grupos hidroxila dos resíduos de açúcar formam ligações de hidrogênio com a água → A estrutura de cada proteína de cada biomolécula e componente celular é um produto da informação programada na sequência nucleotídica de ácidos nucleicos das células ou vírus → Permitem transmitir a informação genética de uma geração a outra → A sequência de aminoácidos de cada proteína em uma célula e a sequência de nucleotídeos de cada RNA são especificadas por uma sequência de nucleotídeos no DNA da célula → Gene - um segmento de uma molécula de DNA que contém a informação necessária para a síntese de um produto biologicamente funcional Uma célula tem milhares de genes Armazenamento e transferência da informação biológica → Polímeros contendo 50 nucleotídeos ou menos são oligonucleotídeos Estrutura dos ácidos nucleicos → Estruturas primária, secundária e terciária: Primária: estrutura covalente e sequência nucleotídica Secundária: qualquer estrutura regular e estável adotada por nucleotídeos em um ácido nucleico Terciária: enovelamento complexo de grandes cromossomos dentro da cromatina eucariótica e o nucleoide bacteriano, assim como o enovelamento de grandes moléculas de tRNA e rRNA Ácidos Nucleicos 4 DNA → Dupla-hélice que armazena informação genética → Amostras de DNA isoladas de diferentes tecidos da mesma espécie têm a mesma composição de bases → A composição de bases de DNA em uma dada espécie não muda com a idade do organismo, seu estado nutricional ou a mudança de ambiente → Em todos os DNAs celulares, o número de resíduos de adenosina é igual ao de timina (A = T) e o de guanina é igual ao de citosina (C = G) Soma dos resíduos de purina é igual à soma dos resíduos de pirimidina (A + G = T + C) Citosina e guanina fazem ligação de hidrogênio tripla; adenina e timina fazem dupla - pareamentos diferentes desestabilizam a estrutura helicoidal dupla - Cadeias com mais ligações entre G e C são mais estáveis → As duas cadeias polinucleotídicas antiparalelas da dupla-hélice de DNA não são idênticas na composição e na sequência de bases - são complementares entre si → A dupla-hélice é estabilizada primariamente por cátions metálicos - protegem as cargas negativas dos fosfatos Replicação do DNA → Toda nova molécula é sintetizada a partir de outra → No processo de divisão celular, é preciso duplicar o material genético → Ocorre de forma semiconservativa Parte da molécula antiga de DNA fica presente em cada uma das novas moléculas Enzima DNA Polimerase - responsável por incluir novos nucleotídeos na fita nascente de DNA utilizando a fita antiga como molde para manter a sequência correta → As fitas parentais são simultaneamente desenroladas e replicadas - forquilhas de replicação → A síntese de DNA segue na direção 5’ → 3’ - semidescontínua → As duas extremidades das fitas de DNA são quimicamente diferentes - a DNA polimerase trabalha apenas na extremidade 3’ - faz a quebra do grupo trifosfato do nucleotídeo livre para obter energia - isso só é possível na extremidade 3’ Essas extremidades ficam “desencontradas” quando as duas fitas se unem para formar a dupla hélice - fitas são antiparalelas Ácidos Nucleicos 5 DNA Polimerase sintetiza uma das fitas continuamente e outra de forma descontínua - ação conjunta de diversas proteínas na forquilha de replicação - a molécula de DNA vai passando pela enzima enquanto se abre e fecha → Nucleases - degradação do DNA Exonucleases - extremidades Endonucleases - sítios internos → Primer (iniciador) - segmento de fita complementar ao molde com um grupo 3’- hidroxila livre, onde um nucleotídeo pode ser adicionado - terminal do iniciador Genes e cromossomos → Uma molécula de DNA pode atingir cerca de dois metros de comprimento → Compactação da cromatina - permitir que o material genético caiba no núcleo de forma organizada Histonas - proteínas octaméricas nas quais o DNA se enrola Meio de controle da expressão gênica - limita o acesso a informações nele contidas Eucromatina - mais “folgada” - pode ter a informação genética lida Heterocromatina - mais compactada (densa) - não está fornecendo nenhuma informação genética no momento → Cromossomos - repositórios da informação genética - empacotamento terciário do DNA → Gene - todo o DNA que codifica a sequência primária de algum produto gênico Ácidos Nucleicos 6 → Sequências regulatórias - fornecem sinais que podem indicar o início ou fim de um gene, influenciar a transcrição gênica ou funcionar como ponto de início da replicação ou recombinação → Cada um dos aminoácidos de uma cadeia polipeptídica é codificado por uma sequência consecutiva de três nucleotídeos em uma única cadeia de DNA - códons Códons organizados em uma sequência correspondente à sequência de aminoácidos no polipeptídeo codificado por esse gene → Íntrons - segmentos de DNA não traduzidos nos genes → Éxons - segmentos codificantes no gene → 3% do genoma humano é constituído por sequência altamente repetitivas - DNA de sequências simples → Centrômero - sequência de DNA que funciona como ponto de ancoragem para as proteínas que fixam os croossomos ao fuso mitótico na divisão celular - distribuição equitativa e ordenada do conjunto de cromossomos para as células-filhas → Telômeros - sequências finais dos cromossomos eucarióticos - estabilização - impedem a perda da informação genética, pois a cada vez que há uma divisão celular, a fita diminui de tamanho RNA → Responsável direto pelo processo de leitura do código genético Pode ter ações decorrentes de suas sequências ou estruturas tridimensionais → Não se apresenta em fita dupla, e sim como fita única → Os RNAs mensageiro, transportador e ribossomal são responsáveis pelos processos de transcrição (cópia do gene do DNA em uma fita de mRNA) e tradução (formação de proteína a partir dessa informação) Ácidos Nucleicos 7 RNA ribossômico (rRNA) - componentes dos ribossomos, responsáveis pela síntese proteica RNA mensageiro (mRNA) - intermediários, carregam informações para a síntese de uma proteína de um ou maisgenes para um ribossomo RNA transportador (tRNA) - moléculas adaptadoras que traduzem a informação no mRNA em uma sequência específica de aminoácidos → O RNA resultante da transcrição de um gene é um pré-mRNA, pois deve ainda sofrer “edição” para retirada de porções não codificantes (íntrons) Mutações no código genético → Alterações na sequência do código genético tem potencial danoso - eventualmente, entretanto, pode levar a um aperfeiçoamento da função original → Podem ser espontâneas (quando resultam de erros aleatórios da DNA polimerase) ou induzidas (influência de fator externo) → Splicing alternativo - reorganização dos éxons para formar diferentes produtos a partir de um mesmo gene → Mecanismos de reparo - evitar os prejuízos das alterações indesejadas - estratégias moleculares de reconhecimento de mau pareamento e correção da sequência com base na fita molde O código genético é “degenerado” - mais de um códon codifica o mesmo aminoácido - reduz as chances de alterações efetivas nas estruturas primárias das proteínas → Mutações podem ser: Sinônimas - alteração do códon não muda o aminoácido - não há alteração na estrutura primária da proteína formada Sentido trocado conservativa - mudança do códon gera pouca mudança na proteína. Ex: troca um aminoácido essencial por outro também essencial Sentido trocado não-conservativa - mudança no aminoácido é danosa Sem sentido - mudança no códon gera um código de fim da tradução - não produz a proteína Mudança de matriz de leitura - adiciona ou remove uma base nitrogenada - altera a sequência de códons Ácidos Nucleicos 8
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