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a) b) c) d) e) Exercícios de Biologia Molecular e Biotecnologia 1. A reação em cadeia da polimerase (PCR) se tornou em pouco tempo umas das ferramentas mais utilizadas no estudo dos ácidos nucléicos. Quais os componentes de uma reação típica de PCR? a) Água deionizada, tampão, DNA polimerase, sonda de DNA e plasmídeos b) Água deionizada, tampão, sondas, DNA polimerase e DNA molde c) Água, tampão, nucleotídeos (DNTPs), primers, DNA polimerase, magnésio e DNA molde d) Enzima de restrição, nucleotídeos (DNTPs), DNA polimerase, magnésio e sonda e) Enzima de restrição, tampão, nucleotídeos (DNTPs), magnésio e sonda 2. São características das endonucleases (enzimas) de restrição: a) Cortar o DNA exógeno em seqüências especificas, os chamados sítio de clivagem b) Foram inicialmente isoladas de organismos geneticamente modificados c) Facilitam a amplificação do material estudado d) Ligam DNAs de diferentes seres e) Não existem em seres vivos, sendo exclusivamente produtos da indústria química 3. Considera-se, na seguinte ordem de execução, as etapas do Southern blot: a) Fragmentação do DNA; Eletroforese em gel; transferência para membrana; marcação da sonda; hibridização. b) Fragmentação do DNA; hibridização; Eletroforese em gel; transferência para membrana; marcação da sonda. c) Fragmentação do DNA; transferência para membrana; Eletroforese em gel; marcação da sonda; hibridização. d) Eletroforese em gel; Fragmentação do DNA; transferência para membrana; marcação da sonda; hibridização. e) Fragmentação do DNA; marcação da sonda; Eletroforese em gel; transferência para membrana; hibridização. 4. A detecção de sinal fluorescente por SybrGreen ou pelo sistema TaqMan é feita em qual técnica? a) Seqüenciamento de RNA b) PCR convencional c) Seqüenciamento de DNA d) PCR em Tempo Real e) Northern blotting 5. As técnicas de Southern Blot, Northen-blot e Western- blot envolvem a transferência de moléculas de um gel para um suporte sólido (membrana). As moléculas transferidas em cada técnica são, respectivamente: a) DNA, RNA e proteínas. b) RNA, proteínas e DNA. c) DNA, proteínas e RNA. d) RNA, DNA e proteínas. e) proteínas, RNA e DNA. 6. Southern blot, Northern blot and Western blot são técnicas usadas no diagnóstico molecular de doenças de organismos aquáticos cultivados. Essas técnicas se baseiam em: a) extração e imobilização de proteínas e ácidos nucleicos em membranas. b) hibridização de moléculas de DNA fixas em suporte com sondas marcadas. c) extração e amplificação de fragmentos de ácidos nucleicos através do uso de sondas marcadas. d) hibridização de moléculas (DNA, RNA e proteínas) usando um anticorpo específico para cada molécula de interesse. e) hibridização de ácidos nucleicos (Southern e Western blot) e proteínas (Northern blot) usando um anticorpo específico para cada molécula de interesse. 7. Teste de DNA confirma paternidade de bebê perdido no tsunami Um casal do Sri Lanka que alegava ser os pais de um bebê encontrado após o tsunami que atingiu a Ásia, em dezembro, obteve a confirmação do fato através de um exame de DNA. O menino, que ficou conhecido como “Bebê 81” por ser o 81 o sobrevivente a dar entrada no hospital de Kalmunai, era reivindica-do por nove casais diferentes. Folhaonline, 14/02/2005. Adaptado. Algumas regiões do DNA são sequências curtas de bases nitrogenadas que se repetem no genoma; o número de repetições dessas regiões varia entre as pessoas. Existem procedimentos que permitem visualizar essa variabilidade, revelando padrões de fragmentos de DNA que são “uma impressão digital molecular”. Não existem duas pessoas com o mesmo padrão de fragmentos com exceção dos gêmeos monozigóticos. Metade dos fragmentos de DNA de uma pessoa é herdada de sua mãe e metade, de seu pai. Com base nos padrões de fragmentos de DNA representados abaixo, qual dos casais pode ser considerado como pais biológicos do bebê 81? a) 1 b) 2 c) 3 d) 4 e) 5 8. As enzimas de restrição são as principais ferramentas bioquímicas empregadas em Engenharia Genética. Com relação a essas substâncias é correto afirmar que: a) são altamente específicas, cortando o DNA em locais determinados. b) não existem em seres vivos, sendo exclusivamente produtos da indústria química. c) atuam como agentes de ligação entre DNA viral e bacteriano. d) permitem somente a ligação de pedaços de DNA de um mesmo tipo celular. e) impedem a clonagem de moléculas de DNA recombinante. 9. Em relação ao método de cromatografia de afinidade, assinale a opção correta. a) A cromatografia de afinidade é um método de separação de proteínas que tem como base o uso de uma resina contendo um anticorpo específico para a proteína que se deseja purificar. b) A cromatografia de afinidade, também conhecida como filtração em papel, permite o fracionamento de substâncias químicas de volumes moleculares diferentes. c) A rede tridimensional presente no gel de cromatografia de exclusão separa as moléculas, discriminando-as pela carga elétrica. d) Durante a cromatografia de afinidade, as moléculas com maior carga elétrica são excluídas. e) Na cromatografia de afinidade, ocorre a separação das proteínas pela sua polaridade. 10. Um determinado teste é baseado nas seguintes etapas: extração de RNA total, eletroforese em gel de agarose, transferência para filtro de nitrocelulose, incubação com sondas específicas e exposição ao filme de raio X. Estamos falando de qual procedimento? a) PCR em tempo real b) Cromatografia c) Seqüenciamento do DNA d) Southern blotting e) Northern blotting 11. A reação em cadeia da polimerase (PCR, na sigla em inglês) é uma técnica de biologia molecular que permite replicação in vitro do DNA de forma rápida. Essa técnica surgiu na decada de 1980 e permitiu avanços científicos em todas as áreas de investigação genômica. A dupla hélice é estabilizada por ligações de hidrogênio, duas entre as bases adenina (A) e timina (T) e três entre as bases guanina (G) e citosina (C). Inicialmente, para que o DNA possa ser replicado, a dupla hélice precisa ser totalmente desnaturada (desenrolada) pelo aumento da temperatura, quando são desfeitas as ligações hidrogênio entre as diferentes bases nitrogenadas. Qual dos segmentos de DNA será o primeiro a desnaturar totalmente durante o aumento da temperatura na reaçao de PCR? (1,0 ponto) 12. Na técnica de Western blot, o _________________________ deve ser executado junto com as amostras. a) padrão comercial da proteína alvo. b) padrão de peso molecular. c) controle negativo. d) controle positivo. e) controle de carregamento. 13. As proteínas citoplasmáticas abaixo apresentam as seguintes características: PROTEÍNA PESO MOLECULAR (PM) PONTO ISOELÉTRICO (pI) X 48.000 7,1 Y 126.000 3,8 Z 31.500 10,0 Pergunta-se: A) Como se disporiam estas proteínas em uma eletroforese em gel de poliacrilamida? B) Qual seria a ordem de eluição (saída da coluna) das proteínas em uma coluna de gel filtração 14. De acordo com a sequencia de aminoácidos das proteínas abaixo (use a tabela abaixo para ajudar): Cadeia lateral dos aminoácidos Polar com carga positiva Polar com carga negativa Apolar Polar neutro Arginina (Arg) Aspartato (Asp) Alanina (Ala) Asparagina (Asn) Histidina (His) Glutamato (Glu) Isoleucina (Iso) Cisteína (Cys) Lisina (Lys) Leucina (Leu) Glutamina (Gln) Metionina (Met) Serina (Ser) Fenilalanina (Phe) Treonina (Thr) Prolina (Pro) Tirosina (Tyr) Triptofano (Trp) Valina (Val) Glicina (Gli) Proteína A: Arg-His-Iso-Asn-Leu-Ser-Leu-Asp-Arg-Lys-met Proteína B: Leu-Met-Gli-Asp-Glu-Glu-Cys-Thr-Asp-Asn-Glu Proteína C: Ala-His-Lys-Met-Phe-Pro-Glu-Gli-Arg-Phe-Iso- Leu-Leu-His-Trp-Val-Met-Glu-Pro-Trp-Asp-Met-Iso-Pro- Ala-Phe-Met-Arg-val-Thr-Gln-Glu-Met-Iso-Leu-Gli-Cys- His-Ala-Pro-Gln-Asn-Leu-Asp-Isso-Gli Proteína D: Met-Cys-Arg-Lys-Iso-Glu-Phe-Met-Ala-Ser-Lys- Gln-Thr-Tyr-Glu-Ser-Ala-Met-His-Lys-Gln-Trp-val-His-His- Phe-Arg a) Como estariam estas proteínas em eletroforese simples? b) Explique, detalhando as etapas,como você faria para purificar a proteína A das demais? 15. Qual é a diferença entre southern blotting e northern blotting? 25/05/2022 20:20 Página 1 de 1
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